Видимо последняя встреча американцев с Ки.61 над. Филиппинами произошла 11 января 1945 г. Тогда командир 82-й тактической разведывательной эскадрильи капитан Уильям Шомо (William A.Shomo) вместе со своим напарником, выполняя разведывательный полёт на двух F-6D (разведывательный вариант истребителя P-51D «Мустанг»), обнаружил уходящий бомбардировщик G4M «Бетти» в сопровождении примерно дюжины «Тони» и одного Ки.44. Японцы, видимо, приняли американцев за своих, и эта беспечность дорого им обошлась. Шомо с напарником, аккуратно подойдя сзади, сразу сбили пару истребителей сопровождения. Не ожидавшие такой наглости от двух истребителей, японцы растерялись. Воспользовавшись этим, ведущий сумел сбить бомбардировщик и ещё три истребителя, остальных трёх «Тони» записал на свой счёт ведомый. Поскольку, как потом оказалось, в транспортном самолёте находился не идентифицированный, но весьма высокий чин морской авиации, то за этот бой Шомо был награждён Медалью героя Конгресса США (American Congressional medal of Honor) и досрочно произведён в майоры.
После падения Филиппин и оглушительного поражения в битве у Марианских островов, война вплотную приблизилась к самим Японским островам. Фактически, к концу 1944 г. Япония уже сражалась «стоя на коленях». В условиях морской блокады и хронического недостатка буквально всех видов сырья промышленность была не в состоянии обеспечить даже минимально потребные поставки вооружения, не говоря уже о массовом выпуске новых улучшенных образцов техники. Тем не менее, американцы отдавали себе отчёт в том, что специфика японского менталитета такова, что сопротивление им будет оказываться до тех пор, пока хоть один японский солдат будет в состоянии использовать хоть какое-нибудь оружие, а посему прилагались все усилия для того, чтобы лишить японскую промышленность возможности производить это оружие. Наряду с морской блокадой, в результате которой в 1944 г. резко сократилась поставка сырья и материалов из района Южных морей, было принято решение и об уничтожении японской промышленности как таковой. В качестве главного орудия для достижения этой цели были выбраны стратегические бомбардировщики В-29, обладавшие рабочим потолком в 11 километров и достаточно мощным оборонительным вооружением, а потому казавшимися неуязвимым для атак японских истребителей и зенитного огня. Самое совершенное прицельнонавигационное оборудование должно было обеспечивать высочайшую точность бомбометания, в том числе и из-за облаков. На самом деле всё оказалось совсем не так, как это казалось американским кабинетным стратегам, и первым был поколеблен миф о неуязвимости «сверхкрепости».
«Хиен» из состава 18-го сентая и тяжёлый истребитель Ки.46-Ш из 17- й отдельной эскадрильи проходят отстрел оружия на аэродроме Кофу, сентябрь 1944 г. 18-й сентай был в числе немногих получивших Ки.61-1хэй кай с усиленным составом вооружения.
26 апреля 1944 г. В-29 из состава 444-й бомбардировочной группы майора Чарльза Хансена, пересекая индийско-китайскую границу на высоте около 4800 метров, подвергся атаке абсолютно устаревших на тот момент Ки.43 из 64-го сентая. В течение получасового боя на бомбардировщике заклинили сначала верхняя, а затем и кормовая турель, был ранен бортовой стрелок, а хвостовой записал на свой счёт сбитый истребитель. Японцы, которых вёл в бой капитан Хидео Маябе, доложили о том, что бомбардировщику серьёзно повредили один из правых двигателей. На самом деле, как это часто бывает, в бомбардировщике по возвращении насчитали лишь девять дырок, да и
японцы тоже потерь не имели. Тем не менее, это был первый сигнал о том, что над японскими островами американцев ждут достаточно серьёзные испытания. До того момента, когда над Токио появились рейдеры Дуллитла, ПВО японских островов как таковое практически отсутствовало, японцы в самом страшном сне не могли себе представить, что им придётся бороться с самолётами противника над своими городами. После «визита» В-25 японские армия и флот стали гораздо более серьёзно заниматься вопросами защиты от нападения воздушного противника. По мере того, как война приближалась к берегам самой Японии, авиации ПВО уделялось всё большее значение, была развёрнута сеть радарных постов раннего обнаружения, налажено взаимодействие между армейскими и флотскими истребителями, а сами части ПВО стали комплектоваться более совершенными машинами, в том числе и Ки.61.
По состоянию на июль-август 1944 г., американским бомбардировщикам противостояли порядка 190 перехватчиков флота и примерно 200 армейских истребителей ПВО. Кроме того, к борьбе с бомбардировщиками привлекались ещё около 400 истребителей из лётных школ и различных отдельных частей. Организационно императорская армейская авиация была сведена в 6-ю Воздушную армию, а вся территория Японских островов была поделена на три сектора обороны: Восточный, включавший в себя промышленный комплекс Иокогама-Токио-Нагоя, Центральный и Западный. В состав ПВО метрополии входило немало частей, вооружённых Ки.61. Так, Восточный сектор обороняли 18-й и 244-й сентай, в Центральном секторе были задействованы 17-й, 56-й и заново сформированный 55-й сентай. В Западном секторе на «Хиенах» летали переброшенный с Окинавы 56-й сентай, и 59-ой, первоначально некоторое время подчинявшийся командованию Центрального сектора ПВО. Помимо собственно территории Японских островов, задачи ПВО на дальних подступах осуществляли 19-й и 105-й сентай, а также 37-й учебный, дислоцировавшийся на Формозе (Тайвань). Эти части, а также 56-й сентай вместе с 23-й отдельной учебно-тренировочной эскадрильей были переброшены на Окинаву во время высадки туда американцев в апреле 1945 г. Кроме того, для нужд ПВО активно привлекались 8-я и 39-я учебные части, а также 5,7,11 — я и 18-я учебно-боевые хикоданы (бригады).
В состав многих полков входили и так называемые «Подразделения сотрясателей небес» — Синтен Сейку Тай. Эти боевые единицы комплектовались в основном молодыми пилотами, которые должны были сбивать неприятельские машины таранным ударом. Практика воздушных таранов не была каким-то особым изобретением японцев, достаточно вспомнить советских пилотов, да и лётчики Германии, Великобритании и США тоже изредка использовали подобный способ ведения боя. Однако именно в Японии практика таранных ударов была доведена до своего логического завершения и стала вполне официальным способом применения боевых самолётов. Многие европейские и американские авторы, упоминая о «Подразделениях сотрясателей небес» ошибочно путают их с «камикадзе», которые должны были исполнить возложенную на них задачу ценой своей жизни. На самом деле, «сотрясатели небес» жертвовали, как правило, только своей машиной, среди них многие совершали два и более таранов, многие даже ухитрялись приземляться на своих покалеченных машинах.
В состав учебных частей и подразделений помимо Ки.61 входили, как правило, и другие типы истребителей, как одно-, так и двухмоторных, а на вооружении истребительных полков армейской ПВО стояли как правило, машины практически всех модификаций, начиная с самых первых Ки.61-1ко. Исключением, пожалуй, был только находившийся под командованием подполковника Фурукава 56-й сентай, поначалу почти полностью перевооружённым новейшими Ки.61 — II, которые значительно превосходили по своим данным Ки.61-I.