Положение в Сирии становилось все запутаннее. Борьба внутри дома Селевкидов вконец истощила государство. К этому добавились нападения извне, в том числе арабов и иудеев, а внутри, как это часто бывает при слабости центральной власти, почти беспрепятственно действовали шайки разбойников. В этих условиях, понимая, что никакой Селевкид уже не выведет государство из состояния анархии, правящие круги Антиохии решили призвать нового царя. Сначала они обратили свое внимание на царя Понта Митридата VI, который успешно строил свою державу и казался самым сильным правителем эллинистического мира. Но тот потерпел поражение в войне с Римом. Неподходящей оказалась и кандидатура Птолемея IX. И тогда они призвали армянского царя Тиграна. Тот с удовольствием ответил на этот призыв и в 83 г. до н. э. явился в Сирию. Сестра Птолемея IX Клеопатра Селена, бывшая последовательно супругой трех Антиохов, попыталась укрепиться в Птолемаиде, но потерпела поражение и была выслана Тиграном в Парфию.
Однако и Тиграну долго править Сирией не пришлось. Он вступил в союз с Митридатом, когда тот начал очередную войну с Римом. Римский полководец Лукулл разгромил обоих. Тигран был вынужден очистить Сирию. Этим воспользовался один из Селевкидов, Филипп II, и стал царем, но его сверг уже бывший ранее царем и находившийся некоторое время в Риме сын Антиоха X и Клеопатры Селены, Антиох XIII. Активную помощь в захвате трона ему оказал Самсикерам, царек небольшого арабского государства на северо-западе Месопотамии. Он сначала захватил Антиоха в плен, а после ухода из Сирии Тиграна решил с помощью своего пленника установить в стране собственную власть. К этому времени во главе римской армии вместо Лукулла встал Помпей, принявший твердое решение раз и навсегда покончить с этой трагикомедией. В 64 г. до н. э. Помпей, не признавая Антиоха законным царем, изгнал его и объявил Сирию римской провинцией. История державы Селевкидов завершилась.
Еще до окончательного крушения державы Селевкиды потеряли не только фактический, но и официальный контроль над своими южными владениями. Местные правители стали не только реально, но и формально полновластными властителями своих территорий. Здесь возникло несколько сравнительно небольших государств, правители которых упорно боролись друг с другом, стремясь расширить зоны своей власти. Среди них выделяется Набатейское царство со столицей в Петре, занимавшее в период своего наивысшего расцвета Заиорданье, Синай, Негев и значительную часть Северо-Западной Аравии, а одно время даже южную часть Сирии с Дамаском. Оно играло важную роль в политической жизни всего региона, но, к сожалению, его история известна очень плохо. Набатея была расположена на чрезвычайно важных торговых путях, связывавших Аравию с Сирией и Египтом и даже с Индией (Gogte, 1999, 300–303), и это в значительной степени стало основой ее богатства. Захват иудейским царем Александром Йаннаем Газы, с древнейших времен являвшейся важнейшим средиземноморским портом для всей караванной торговли в Южной Палестине и Аравии, нанес тяжелый удар набатейскому могуществу и сделал Набатею непреклонным врагом Иудеи. Несколько позже набатейский царь Арета III сумел взять реванш и даже вмешаться во внутреннюю борьбу в Иудее, но был вынужден отступить под давлением римлян, которые после захвата Сирии стали диктовать свои условия (Шифман, 1976, 22–24).
В самой Палестине самым сильным государством того времени стала Иудея. Как уже говорилось, Аристобул (иудейское имя Иуда) принял титул царя, оставаясь при этом и первосвященником. Чтобы утвердиться в своем новом положении, он стал чеканить собственную монету. Может быть, он сделал это даже еще до официального принятия нового титула, но явно в расчете на него (Ronen, 1987, 107). Главной целью Аристобуда было, естественно, укрепление своей власти как внутри государства, так и вовне его. Он использовал резкое ослабление Селевкидов не только для официального утверждения себя как равноправного с ними царя, но и для захвата Итуреи, расположенной в Келесирии (los. Ant. Iud., XIII, 11, 3). Правда, археологические свидетельства, как будто, не подтверждают сообщения историка (Berlin, 1997, 36–37), но это не дает оснований считать его ложным. Внутри царства Аристобул стремился нейтрализовать собственных братьев, чтобы не потерять только что обретенный им царский трон. Один из них, Антигон, был убит, другие брошены в тюрьму. Это, однако, не упрочило его царствования. Первый правитель Второго Иудейского царства правил всего один год, хотя и умер естественной смертью. После смерти Аристобула власть оказалась в руках его вдовы Александры Саломеи, которая освободила братьев покойного царя и возвела на престол одного из них — Йанная, принявшего греческое имя Александр. Для укрепления власти нового царя она сама вышла за него замуж. Другой брат попытался было захватить власть, но потерпел поражение и был казнен (los. Ant. Iud., XIII, 12, 1).