В правление Владислава II, еще когда он был князем, явились в Чехии два новые ордена премонстратов и цистерцианцев, которые за несколько времени перед тем получили начало во Франции, а оттуда быстро распространились по Германии. Владислав и тогдашний епископ Иоанн I, имея родовые имения в Быджовской области и в других местах, основали для Премонстратов первый монастырь на Страховской горе над малой Пражской стороной, поросшей еще тогда лесом (1139), и присоединили к ним потом два Бенедиктинские монастыря, прежний Литомышльский и только что основанный Желивский в ближнем лесу на моравской границе (1148). Позже чешский владетель (пан) Георгий из Милевска основал монастырь того же ордена в своей области (1184), а другой владетель из рода, считавшегося одним из славных родов, Грозната, любимец князя-епископа Бретислава III, основал Тепельский монастырь в Пелзенще (1197) и вступил в него в качестве пробста, отказавшись от мира по смерти своего покровителя. Также монахини премонстратского ордена в короткое время имели три монастыря в Чехии, в Доксанах у Литомежица, основанный первой женой Владислава II Гертрудой австрийской (1142), потом в Лауновичах (1149) и в Хотешове, основанный выше упомянутым Гразнатой. Цистерианцы имели один монастырь в Седльце, в Чаславской области, основанный дворянином Мирославом (1143), другой в Пласах над Модой, князем Владиславом II (1145). К нему присоединился монастырь того же ордена, основанный тем же владетелем в Полуце, а позже еще два, в Мниховом Городище, который основал Марквартиц Герман из Ральска (1177), и в Осеке, основателем которого был Славек Грабишич, главный камергер Пржемысла I, как о том сказано выше. В Сеземицах, в Хрудимской области, был женский монастырь того же ордена. Рыцарский орден Иоаннитов или больницы св. Иоанна в Иерусалиме, во время короля Владислава получил дом на малой Пражской стороне, на конце моста (около 1156 г.), а Грабишичи Вшебор и Еоята были первыми патроми рыцарей гроба Господня, которые в 1190 году получили пробство на Здераде Пражском подгородье. Число фарных и других местных церквей постоянно увеличивалось, они большей частью были учреждаемы королями или дворянами, которым поэтому сыздавна принадлежало право назначения должностей.
Церковное управление все лучше организовывалось частью старанием собственных епископов и людей, занимавших высшие духовные должности, частью принуждением со стороны папских легатов, которые со времени папы Григория VII чаще нежели прежде посещали Чехию и старались, чтобы новые папские постановления приводились в исполнение Для облегчения надзора над священством, епископ разделил Пражскую епархию на деканства, сначала по числу жуп; над деканами надзирали протоиереи которых было тринадцать; местопребывания их были в Праге, Ку жиме, Вехине, Горшове, Тыне, Пльзене, Рокичанах, Жатне, Вилине, Литомежицах, Руднице, Болеславе, Жирчиневиче и Градце над Лабой (Эльба).
Духовенство все более и более преуспевало в образованности и имело среди себя людей ученых и художников различного рода. Декан пражской капитулы Козьма, скончавшийся 80-летним старцем в последний год жизни князя Владислава I (1125), первый принялся писать историю Чехии с древнейших веков до своего времени, и после него нашлись последователи из Пражских и Вышеградских монахов и из другого духовенства. И тут, как во всех западных христианских государствах, ученым языком — был язык латинский; но совершение литургии на славянском языке в первое время введения христианства, и сохранявшееся в стране в течение двух столетий, оставило за собой стремление к усовершенствованию чешского языка переводами священных книг и сочинением церковных песней, молитв, легенд и другого рода церковных произведений. Превосходные отрывки Зеленогорской и Краледворской рукописи, сохранившиеся до нашего времени, свидетельствуют о том, что хотя редко, однако рано уже стали пользоваться такими произведениями для сохранения плодов древнего народного творчества, имеющего корни свои в язычестве.
Монастыри и капитулы были, как сначала епископства, наделены поземельными владениями, которые более или менее равнялись владениям дворянских фамилий. По примеру дворянства и духовенство старалось освободить своих крестьян от повинностей, которые служили жупным чиновникам удобным случаем к их притеснениям; оно достигло этого со временем чрез писанные княжеские привилегии, в силу которых оно исключено было от этих повинностей и получило право суда над своими подданными, кроме важных преступлений. Пражское епископство получило первое такой указ в первые года правления Владислава II. Однако ж жупные чиновники часто действовали против дарованной льготы и выдумывали» разные налоги на духовные имения, которым они вовсе не подлежали. Чрез это происходили жалобы духовного сословия на беззаконные притеснения, как вышеупомянутый разрыв между князем Фридрихом и епископом Генрихом Бретиславом, в котором однако ж епископ пошел далее, нежели надлежало.