Если разорение Аттики, так сказать, предусматривалось военными планами Перикла, то неожиданно вспыхнувшая в 430 г. до н. э. страшная эпидемия сыпного тифа (некоторые ученые считают — чумы) спутала стратегические расчеты афинян. Перикл и афинские руководители не предполагали, что сосредоточение огромного числа беженцев из Аттики в тесном, пыльном, недостаточно снабженном водой городе может вызвать ужасное заболевание. Болезнь свирепствовала до 426 г. до н. э. с небольшими перерывами и унесла в могилу до четверти всего населения, в том числе 4400 гоплитов и 300 всадников. Эпидемия имела серьезные последствия для Афин как в военном, так и в моральном отношении. Вождь афинской демократии Перикл, так много сделавший для укрепления ее могущества, был подвергнут резкой критике и его даже не избрали в 430 г. на должность стратега, более того, он был присужден к большому штрафу. Вскоре он сам стал жертвой эпидемии. «Болезнь имела вредное влияние и на тело и на душу граждан, — писал Плутарх, — они озлобились на Перикла. Как люди, обезумевшие от болезни, оскорбляют врача или отца, так и афиняне стали дурно относиться к Периклу по наущению его врагов, которые говорили, что болезнь эту производит скопление деревенского народа в городе, когда многие в летнюю пору принуждены жить вместе, вповалку, в тесных хижинах и душных сараях».
Спарта, воспользовавшись тяжелым положением Афин, предпринимала все усилия по разложению Афинского морского союза и достигла в этом определенного успеха. Еще в 432 г. до н. э. влиятельный на полуострове Халкидика полис Потидея поднял восстание и объявил о выходе из союза.
Афины были вынуждены послать в Потидею сильную эскадру в 70 триер и 3000 гоплитов (затем это количество возросло до 4200), которые в течение 2,5 лет приводили к покорности своего строптивого союзника. Не успели афиняне расправиться с Потидеей, как отпали города на острове Лесбос, одном из самых богатых и сильных афинских союзников (427 г. до н. э.). Лесбосские аристократы отправили послов в Лакедемон, прося помощи и защиты от афинян. Потеря Лесбоса была бы очень сильным ударом, афиняне понимали, насколько опасным был бы для них переход острова на сторону спартанцев. Поэтому были предприняты самые быстрые и решительные действия. Внушительная флотилия в 100 триер была направлена к берегам Пелопоннеса и задержала выход спартанцев на помощь Лесбосу. А тем временем другая афинская эскадра с 1000 гоплитами на борту была направлена к Лесбосу и приступила к осаде его главного города Митилены. Помощь спартанцев опоздала, и после нескольких месяцев осады Митилена пала. Афиняне жестоко расправились с восставшими: были срыты все укрепления на Лесбосе, уничтожен флот, наложена тяжелая контрибуция, часть земли была конфискована и на размежеванных участках поселены 2700 афинских колонистов; 1000 митиленских аристократов и их сторонников как зачинщиков восстания были казнены (при обсуждении вопроса о наказании восставших в афинском Народном собрании чуть не прошло решение о казни всех взрослых мужчин и о продаже в рабство женщин и детей Митилены). Суровые наказания, наложенные на мятежных митиленцев, должны были устрашить афинских союзников, не допустить других восстаний. И действительно, в течение длительного времени афинские союзники сохраняли спокойствие.
Классическая Греция
Несмотря на тяжелое положение Афин в первое пятилетие войны, они располагали большой военной мощью, сохранили превосходный флот и основные кадры сухопутного войска, была проведена новая мобилизация, использованы дополнительные средства союзников. В частности, сумма фороса была поднята более чем вдвое, с 600 до 1300 талантов серебра в год. Это вызывало, конечно, недовольство афинских союзников, но, устрашенные свирепой расправой с Лесбосом, они были вынуждены покориться требованиям афинян.