Настоящее аутодафе, первое в Париже, состоялось 31 мая 1310 г.: был сожжен один еврей-вероотступник, но главной жертвой являлась Маргарита из Ганнау, прозванная ла-Пореть, еретичка-бегинка. Она была во Франции первым апостолом немецкой секты Братьев Свободного Духа. В 1308 г. в Париже она попала в руки инквизитора. На его предложение принести перед допросом присягу она отвечала решительным отказом. Обвиненная и отлученная от Церкви за этот отказ, она восемнадцать месяцев была в тюрьме инквизиции. На основании представленного инквизиторами письменного изложения дела канонисты Сорбонны 30 мая объявили эту женщину еретичкой-рецидивисткой. Она была выдана парижскому прево, который и сжег ее на другой же день. Ученик Маргариты, клирик из епархии Бовэ, пытался вырвать ее из рук инквизиции и также был схвачен; он в течение восемнадцати месяцев тюремного заключения отказывался принести предварительную присягу и был обвинен в ереси. Однако он был осужден только к лишению духовного сана и тюремному заключению.
Партенэ, один из самых могущественных дворян Пуату, был в 1323 г. объявлен еретиком парижским инквизитором. Король заключил его в тюрьму Тампля, а все его земли, до окончания дела, секвестровал. Но у Партенэ было много друзей и влиятельных родственников. Обвиняемому удалось подать папе жалобу, в которой он указывал на личную к нему ненависть инквизитора. После бесконечных отсрочек Партенэ получил свободу. Это дело отмечает высший расцвет инквизиции во Франции.
В продолжение нескольких лет развивалась деятельность инквизиции в Каркассоне. 16 января 1328 г. состоялось торжественное аутодафе в Памье: тридцать пять лиц были приговорены носить кресты; двенадцать было освобождено на том же условии от тюрьмы; шесть получило прощение; семь было приговорено вместе с четырьмя лжесвидетелями к пожизненному заключению; было осуждено четверо мертвых; один монах и один священник были лишены сана. Епархия Памье, давшая жертвы для этого ауто, была невелика, и по значительному числу осужденных видна ревностная деятельность инквизитора. 12 декабря того же года состоялось аутодафе в Нарбонне, где было приблизительно сорок жертв. 7 января 1329 г. имело место другое ауто в Памье; 19мая – ауто в Безье, 8 сентября – в Каркассоне, где было сожжено шесть еретиков, а двадцать один приговорен к пожизненной тюрьме; трое были сожжены в Альби; а в конце года ауто, на котором восемь человек было приговорено к простой тюрьме, трое – к тюрьме в оковах и двое – к костру. У инквизиторов были иногда конфликты с королевскими чиновниками; в 1334 г. инквизиторы жаловались королю, что встречают противодействие при исполнении своих обязанностей. Король предписал своим сенешалям Нима, Тулузы и Каркассона не нарушать привилегии инквизиции.
Не был бездеятельным инквизитор Тулузского сенешальства в 1337 г. Сборщик конфискаций перечисляет имущество тридцати еретиков, доходы с которых он в то время получал, упоминает об уплате издержек по одному аутодафе, свидетельствует, что в тюрьмах инквизиции в это время находилось восемьдесят два заключенных. Аутодафе происходили в Каркассоне в 1346, 1357 и 1383 гг., а в Тулузе было ауто в 1374 г. Должность инквизитора не оставалась не замещенной.
От этого времени дошло мало известий об инквизиции на севере Франции. Столетняя война с Англией сильно затрудняла ее деятельность. Обычай исключать из ведения инквизиторов, писал парижский провинциал папе Клименту VI в 1351 г., Тюрен де Мен, и дает возможность ереси процветать в этих областях. Папа немедленно распространил на них юрисдикцию инквизитора Франции.
Когда при Карле Мудром наступил мир, инквизиция получила большую свободу действий. В сентябре 1365 г. Урбан V напомнил прелатам и инквизиторам всей Франции, что еретики распространяют свои заблуждения. Он послал парижскому епископу подробные сведения об их учении и о местностях, где их можно было открыть; эти сведения епископ должен был сообщить инквизиции. В 1372 г. инквизитор деятельно трудился над искоренением ереси секты Братство Бедности (тюрлюпенов). Было сожжение еретических книг и одежд, а также женщины – главы секты. Ее помощник умер в тюрьме; его труп также сожгли. В мае 1421 г. двадцать пять адептов этого Братства были осуждены в Дуэ епископом Арраса. Двадцать из них отреклись от своих заблуждений, и на них в виде епитимьи наложили ношение крестов, изгнание или тюрьму. Пятеро остались непреклонными и погибли на костре.
В 1381 г. подвергся преследованию Гуго Обрио, доверенное лицо короля Карла, парижский прево. Город обязан ему своею первою сетью сточных труб, первыми ограничениями процветавшей в то время проституции и постройкой Бастилии, крепости против англичан. Он снискал уважение и любовь всего населения, но навлек на себя непримиримую ненависть университета, не признавая некоторых его привилегий. После смерти короля Карла V университет в 1380 г. отомстил прево, как только представился случай.
25 ноября 1380 г. в Париже толпа разграбила дома евреев и силой начала крестить детей. Обрио потребовал возвращения детей их родителям. 21 января 1381 г. Обрио был вызван к епископу и инквизитору и был отлучен от Церкви за неявку. Это заставило его подчиниться; но когда он в феврале предстал перед инквизитором, его заключили в епископскую тюрьму и начали суд. В вину ему ставили дело о еврейских детях и освобождение из тюрьмы одного осужденного инквизитором за ересь. Несмотря на слабость обвинения, Обрио был тут же осужден на костер, причем ему не разрешили даже принести раскаяние и отречься от заблуждений; но светские князья настояли, чтобы ему дана была эта возможность спасти свою жизнь. 17 мая состоялось торжественное аутодафе, и Обрио смиренно покаялся и отрекся от ересей, в которых его обвинили. Смерть на костре заменили ему пожизненным тюремным заключением и конфискацией имущества. В тюрьме он просидел до 1382 г.; в это время вспыхнуло восстание и народ освободил Обрио и поставил во главе восставших. Но в тот же вечер Обрио бежал в свою родную Бургундию, где жизнь его окончилась в полной безвестности.
После этого события нет почти ни одного упоминания о парижской инквизиции, хотя она и продолжала существовать. В 1388 г. Фома Апулийский утверждал, что он послан Св. Духом для преобразования мира. Университет и епископ судили этого еретика-реформатора и постановили сжечь его сочинения; он был приговорен к пожизненной тюрьме, так как его признали сумасшедшим.
К ограничению значения инквизиции во Франции повело то, что она прекратила прилив конфискаций в государственное казначейство и более ничего не делала для упрочения королевской власти. Даже и во время высшего расцвета инквизиции старались представить королевский суд верховной судебной властью. Инквизитор Генрих де Шамэ, обеспокоенный усилиями Филиппа Валуа взять под свой контроль и ограничить духовную юрисдикцию, добился в ноябре 1329 г. от короля указа, которым подтверждались все привилегии инквизиции; все светские чиновники снова предоставлялись в распоряжение святого трибунала; признавались не имеющими значения все грамоты от королевского трибунала, которые могли бы мешать инквизиторам. Но сам Генрих де Шамэ, однако, был в 1328 г. назначен инквизитором уже не папой, а королем. В 1334 г. Филипп приказал восстановить все старинные привилегии инквизиторов, отожествляя их с королевскими чиновниками. Теперь инквизиция уже зависила вполне от короля и была поставлена под контроль парламента.
Инквизитор, как чиновник королевства, получал жалованье от государства или, в крайнем случае, от города. Юрисдикция королевского трибунала – парламента – была тогда уже признана высшей даже в религиозных вопросах. В 1385 г. в Реймсе возник спор между городским муниципалитетом и архиепископом по вопросу о преступлении богохульства. Стороны согласились подсудность богохульства оставить за архиепископом. Но через двадцать лет дело о богохульстве уже было передано в парламент, который вынес приговор, благоприятный для архиепископа; притом не было даже упомянуто о праве на вмешательство инквизиции. Великий Раскол и последовавшие Костанцский и Базельский соборы сильно пошатнули папскую власть, на которой основывался авторитет инквизиции. Карл VII в отношении Рима всегда проявлял непослушание. В опубликованной в 1438 г. Прагматической Санкции Карл VII предоставлял Галликанской Церкви независимость и усиливал юрисдикцию парламента. Когда в 1461 г. Людовик XI отменил этот акт, то парламент обратился к королю с увещеваниями и продолжал применять отмененный закон. Только Франциск I своим конкордатом 1516 г. уничтожил его совсем.