Мартин постарался выполнить те две задачи, которые были предъявлены ему при избрании, – подавление ереси и реформа Церкви. С этой целью он в 1422 г. послал в Германию своего легата. Так как поход 1421 г. окончился неудачно, то легату для успешного выполнения первой половины его задачи было приказано вновь проповедовать крестовый поход. Изданный легатом, согласно с папскими инструкциями, декрет описывает пороки германского духовенства в выражениях столь же резких, как и выражения Гуса и его сторонников. Мероприятие, выработанное для устранения этих зол, предписывало только новое применение тех средств, которые безрезультатно применялись в течение столетий.
Пять лет прошло после роспуска Констанцского собора, и не было сделано ничего существенного ни в деле борьбы с ересью, ни в деле реформы Церкви, когда в назначенный срок собрался в 1423 г. Сиенский собор. Однако собрание решило, что число явившихся прелатов и князей недостаточно для рассмотрения вопроса о реформе Церкви, но достаточно для того, чтобы вновь обещать отпущение грехов всем, кто будет содействовать уничтожению еретиков. Всем христианским князьям было предписано оказать содействие выполнению этого дела под страхом наказания.
Всякие торговые сношения с еретиками были запрещены, в особенности продажа им съестных припасов, одежды, оружия, пороха и свинца. Если кто-либо будет вести с ними торговые сношения, то князь, допустивший это в своих владениях, должен быть наказан согласно с законами против ереси. Чтобы вынудить Чехию смириться, надо было изолировать ее и заставить голодать.
Все усилия, направленные к реформе, были парализованы легатами. Убедившись, что под контролем папства немыслима никакая реформа, собор попытался сократить до двух или трех лет семилетний срок, назначенный для созыва нового собора. Но 8 марта 1424 г. легаты объявили, что собор распускается. Следующий собор был назначен в Базеле в 1431 г. Мартин сделал вид, что продолжает неоконченные реформы, и поручил вести их трем кардиналам, приказав направлять к ним все жалобы и проекты. Неохотно, под сильным давлением сторонников реформ в Церкви, Мартин 11 января 1431 г. поручил легату, кардиналу Джулиано Чезарини, проповедовать против гуситов крестовый поход, обещая участникам полную индульгенцию; в то же время он дал этому прелату полномочие открыть очередной собор и председательствовать на нем. Одним из наиболее энергичных сторонников собора был кардинал Сиены. Если бы он предвидел будущее, то несомненно умерил бы свое рвение: через три недели умер Мартин, и 3 марта кардинал Сиены был избран папой под именем Евгения IV. Кардинал Джулиано проповедовал пятый крестовый поход против гуситов, который поддержали в Германии, опустошаемой чехами. Вскоре прелат возглавил армию около ста тысяч человек. Чехи попросили у Сигизмунда охранных грамот для поездки на Базельский собор, соглашаясь представить спорные вопросы на обсуждение собора, который решил бы их на основании авторитета Св. Писания. Им было отказано и дано понять, что они должны без рассуждения принять решения собора. Чехи обратились ко всему христианскому миру с нападками на светскую власть папы и индульгенции, изданные с целью подавления их восстания. Протест чехов был получен собором 10 августа, почти в то самое время, когда в Таасе крестоносцы бежали без боя при первых звуках военного гимна гуситских отрядов. Изнуренные и разбитые немецкие князья были готовы вступить в переговоры со своими непобедимыми соседями. 15 октября собор решил пригласить чехов на совещание и дать им охранную грамоту. Но исполнено это было только 20 ноября.
Однако 18 декабря Евгений решил распустить собор и через восемнадцать месяцев созвать новый в Болонье под личным председательством. Собор, уверенный в поддержке императора Сигизмунда, отказался повиноваться папе. Кардинал Джулиано встретился с папой как представитель сторонников реформы. Объясняя мотивы своего неповиновения, прелат нарисовал яркую картину положения Церкви в Германии. По его словам, испорченность духовенства в Германии вызывает такое возбуждение против Церкви, что если не будет сделано никакой реформы, то население поднимется, подобно гуситам, против духовенства. Магдебург прогнал своего архиепископа и все духовенство; граждане просили у гуситов помощи. Население Пассау изгнало своего епископа и осадило один из его замков. Эти два города находятся в соседстве с Чехией, и если они соединятся, то к ним примкнет много других городов. В Бамберге с еретиками, разногласие между гражданами и епископом и капитулом дошло до опасного ожесточения. Если собор будет распущен, то эти конфликты примут более серьезный характер и в них примет участие много других крупных центров.
Гуситские идеи быстро распространялись по Германии, благодаря глубокому отвращению, которое внушало к себе неисправимо развращенное духовенство. Церковь могла ожидать всеобщего восстания. Единодушно поддержанный всем христианским миром к северу от Альп, собор оказал решительное сопротивление папе. Сигизмунд принял сторону собора и в ноябре 1432 г. объявил, что берет под свою защиту отцов собора. Евгений в феврале 1433 г. согласился предоставить собору свободу действий. Но в июле снова объявил роспуск собрания и в сентябре подтвердил это. Собор приступил к суду над папой, и в декабре Евгений отменил свои буллы. Когда же снова вспыхнула ссора, то собор в январе 1439 г. отстранил папу, в июне низложил его, а в ноябре того же года избрал на его место Амедея Савойского под именем Феликса V.
Тем временем шли переговоры между собором и гуситами; на совещании 18 мая 1432 г. в Эгере было установлено, что разногласия будут обсуждаться на основании авторитета Св. Писания и творений древних отцов Церкви. Четыре положения, представлявшие общее основание учений утраквистов и таборитов, были приняты как резюме их требований и легли в основу споров, которые велись в Базеле, в Праге, в Берне и Штульвейссенбурге вплоть до окончательного совещания в Иглау в июле 1436 г. Часто споры принимали бурный характер. Когда Иоанн Рагузский, говоря о гуситах, употребил слово еретики, то Ян Рокицана, один из делегатов утраквистов, потребовал, чтобы всякий, кто выдвинет подобное обвинение, был обязан подтвердить это под угрозою наказания. Представитель таборитов Прокоп присоединился к этому протесту и заявил, что он никогда не пришел бы в Базель, если бы знал, что подвергнется подобному оскорблению. Иоанн Рагузский и лионский архиепископ должны были извиниться. Пригласили гуситов принять участие в соборе, но они не попались в эту ловушку.
Чехи заставили официально признать свои четыре положения под названием Compactata («Сжатое изложение»). 26 ноября 1433 г. в Праге был заключен договор об этом. Но это соглашение не разрешало всех затруднений. Четыре положения были лишь кратким изложением веры и допускали бесконечно разнообразные толкования. Диалектикам собора не трудно было разбить их и лишить всякого практического значения. С другой стороны, гуситы могли легко развивать их так, чтобы оправдать свои требования. В сущности, дело было так мало улажено, что в апреле 1434 г. собор обложил весь христианский мир половиной десятинного сбора для организации крестового похода против гуситов.
Когда в январе 1434 г. легаты покинули Прагу, между таборитами и утраквистами поднялись споры по поводу последствий переговоров. Между обеими сектами существовало, кроме религиозного, и политическое различие. Табориты в большинстве были крестьяне или бедные люди. Они не хотели принимать в свои ряды ни баронов, ни дворян, желали к четырем основным положениям прибавить еще два, чтобы обеспечить Чехии независимость и вернуть все конфискованные имущества. Разногласия между двумя партиями дошло до крайности, и они прибегли к оружию.
Табориты осаждали Пльзень, принявший сторону Сигизмунда, когда в Новом-Граде в Праге двадцать две тысячи их последователей были вырезаны без разбора пола и возраста. Они сняли осаду и 9 мая отправились к Праге, чтобы отомстить городу; но лишь появившись под стенами Праги, пошли в Моравию. Между тем, утраквисты заключили союз с католическими баронами, которые, щедро одаренные собором, дали еретикам сильное подкрепление. Столкновение произошло в воскресенье 30 мая около Липан. Весь день и всю ночь тянулась ожесточенная битва, кончившаяся только в три часа утра в понедельник. Прокоп и тринадцать тысяч таборитов остались на поле битвы. Резня была настолько ожесточенной, что в плен взяли меньше ста человек. Могущество таборитов было окончательно сломлено.