В среде мусульман отыскались собственные теоретики, выступившие со своими проектами совмещения революционных социалистических идей с мировоззрением мусульманских народов. Прежде всего это Мирсаид Султан-Галиев (1892—1940). Он попытался нащупать возможные способы безболезненной интеграции мусульман в строящееся новое социалистическое общество. Он акцентировал внимание на необходимости признания культурных и ментальных особенностей народов, считая стержневым методологическим принципом адаптацию именно социалистических идей под уже существовавшие нормы духовной культуры и быта, в том числе и мусульман. Он отмечал такие черты «восточного» общества в целом, как коллективизм, приоритет общественного над личностным, сформировавшаяся традиция взаимопомощи, отсутствие института рабства в классическом понимании, отсутствие как таковой тенденции к жесткой социальной стратификации (высокая социальная мобильность). Даже отдельные айаты Корана, не впадая в противоречие с их смыслом, этот деятель нашел способ адаптировать под социалистическое учение.
Однако эти идеи М. Султан-Галиева не встретили понимания со стороны соратников по партии. Дело было как в простом непонимании того, что хотел донести до них этот татарский деятель, так и в заочном отрицании даже теоретической возможности любых отходов от казавшейся им универсальной схемы строительства социалистического общества. Недостаток знаний о Востоке сыграл здесь очень большую роль.
М. Султан-Галиев жестко критиковал размежевание территории страны на национальные республики на основе критериев, предложенных в 1922 г. И.В. Сталиным. Главное — он критиковал сам принцип, согласно которому одни нации почему-то признавались созревшими для создания союзных республик, другие оказывались достойными только автономий в составе этих республик. Не был, по его мнению, учтен и тот факт, что, например, во многих районах Средней Азии расселение различных этнических групп фактически носило чересполосный характер: в рамках небольших групп самоидентификация осуществлялась, исходя из родо-племенной принадлежности, в масштабах больших групп — на основе племенной у кочевых, и на основе территориальной принадлежности у оседлых народов.
В целом М. Султан-Галиев предложил создать мусульманскую социалистическую республику в составе СССР при присоединении Восточного Туркестана, тюркских районов Ирана и Афганистана. Фактически своими идеями М. Султан-Галиев поддерживал освободительную борьбу угнетенных народов Востока против «империалистического Запада».
Однако в мае 1923 г. М. Султан-Галиев был обвинен в антипартийной и антигосударственной деятельности, исключен из большевистской партии и арестован. В его защиту выступили многие представители национальностей. Уже в июне он был освобожден, но был отстранен от работы. Второй раз его арестовали в 1928 г., обвиняя его в национализме. В 1930 г. М. Султан-Галиев был приговорен к расстрелу, но приговор заменили на 10 лет заключения, до 1934 г. он отбывал срок на Соловках. Хотя в 1934 г. его выпустили, в 1937 г. он был вновь арестован, а в декабре 1939 г. снова приговорен к расстрелу. Его казнили 28 января 1940 г.
В Советском Союзе его имя стало нарицательным, поскольку под борьбой с «султангалиевщиной» понималась любая, рассматриваемая большевиками как антиправительственная, деятельность, хоть как-то затрагивающая вопросы национальной самобытности, истории, культуры. С конца 20-х по 40-е годы XX в. прошла волна репрессий в отношении национальной интеллектуальной элиты, в том числе мусульманских народов. Любые прогрессивные идеи, хоть как-то шедшие в разрез с официальным курсом И.В. Сталина, даже любые попытки обратить внимание на особенности национальных культур, сводились под единый знаменатель контрреволюционности и реакционизма, фабриковались дела о шпионаже и подрывной деятельности.
С идеями, близкими к взглядам М. Султан-Галиева, выступил один из коммунистических лидеров Туркестана, председатель Мусульманского бюро Туркестанской коммунистической партии Т.Р. Рыскулов (1894—1938). Он предложил концепцию мусульманского социализма и создание коммунистической организации тюркских народов. Также им была предложена идея проводить выборы в ЦК ВКП (б) на основе национального представительства — от каждой национальной республики и области. Т.Р. Рыскулов высказал идею об организации при каждом наркомате в Москве особого представительства национальных республик. Однако все его предложения не были приняты. В середине 30-х годов Т.Р. Рыскулов был объявлен «врагом народа» и расстрелян 10 февраля 1938 г.