Восстановленная инквизиция не отличалась на первых порах большой строгостью, и дело тут не только в том, что она была слишком обескровлена. Причина, быть может, состояла и в том, что светская власть в лице короля и его министров в каком-то смысле сама действовала как инквизиция — она с удивительной энергией искореняла политическую ересь, и инквизиции оставалось лишь с удовлетворением наблюдать происходящее и собираться с силами. Первые дела против виновных в еретических высказываниях были возбуждены трибуналами в октябре 1814 года: в Севилье привлекли подполковника Кастилью, в Сарагосе — священника Пингадо, в Валенсии — монаха Вальтеа, в Мурсии — генерала де Сайаса, в Мадриде к ответу был призван даже представитель высшей знати герцог Сотомайор. Но все они, можно сказать, отделались легким испугом. Высмеянная, оплеванная во время господства Наполеона и кортесов инквизиция начинала свою вторую жизнь неуверенно, часто никак не соответствуя своей страшной славе. Так, Супрема, получив известие, что в Лиме англичанин Джон Робинсон проповедует еретические идеи, советует лимскому трибуналу провести с ним профилактическую беседу и обратиться с просьбой к перуанскому вицекоролю, чтобы он усовестил болтливого англичанина. Разумеется, в прежние времена Супрема давала бы совершенно иные указания, и Робинсон в лучшем для себя случае отделался бы конфискацией имущества и изгнанием.
Чтобы придать инквизиции больший вес, Фердинанд в начале 1815 года лично явился на заседание Супремы и выразил удовлетворение в отношении ее деятельности. Супрема, в свою очередь, известила об этом трибуналы, заявив, что королевская милость должна послужить сигналом к их более решительным действиям. И действительно, в 1815 году активность инквизиции заметно усилилась, причем дела были достаточно разнообразны. На Канарских островах подверглись преследованию три Канарских поэта, воспевших в стихах эдикт кортесов об отмене инквизиции. В Мадриде перед трибуналом предстал генерал Кастрильо за приказ войскам повиноваться кортесам. Толедский трибунал разбирал дела офицера Мануэла Лопеса и писателя Мануэла Садаманги, обвиненных в богохульстве; им же Маргарита Борха и Андреа Торес были привлечены к ответственности за колдовство, профессор Альфонсо — за чтение запрещенных книг, священник Бустаменте — за соблазнение женщин во время исповеди и т. д. Немало дел было связано с принадлежностью обвиняемых к масонским ложам; впрочем, за это нередко преследовались лица, никогда не бывшие масонами, но которые явно или тайно отказывались признавать власть реставрированного короля. По сути, все собрания, носившие революционный либо даже умеренно-конституционный характер, связывались с масонами и жестоко преследовались правительством Фердинанда, от которого инквизиция по мере сил старалась не отставать.
Мы уже говорили, что в 1814 году папа Пий VII резко выступил против масонов, требуя для них самых тяжелых наказаний. Во исполнение этого требования инквизиция издала 2 января 1815 года эдикт, предоставивший масонам определенный срок, в течение которого они могли безнаказанно покаяться в грехах. Строгость правительства по отношению к масонам освобождала инквизиционные трибуналы от чрезмерных усилий по их выявлению: часто инквизиторы вступали в дело уже после того, как светская власть обнаружила преступника и даже по-своему наказала его. Тем не менее именно им удалось в начале 1817 года арестовать в Мурсии Галена, одного из руководителей испанских масонов. Находясь в инквизиционной тюрьме, он заявил, что скажет правду одному лишь королю, и был отправлен в Мадрид. Фердинанд лично допросил его, и это некоторым образом повлияло на короля, который уменьшил надзор светской власти над масонами и тем самым предоставил в их отношении большую свободу инквизиции.
Казалось бы, инквизиция находится на пути к возрождению своего былого могущества, но беда пришла откуда не ждали. В 1819 году правительство собралось отправить в Америку экспедиционный корпус для подавления волнений в колониях. Местом отправления назначили провинцию Кадис, куда стали со всей Испании стекаться солдаты и офицеры. Праздные вояки, голодные и не экипированные должным образом, без дела слонялись по городу и все как один были охвачены чувством ненависти к правительству, которое никак о них не позаботилось. Предстоящий поход за океан в этом войске не пользовался популярностью; мало того, среди солдат ходили слухи о свирепых колонистах, с которыми им вскоре предстояло столкнуться, и заокеанской природе, которая во множестве порождает опасные болезни. Сюда же, точно искры в порох, попадали известия из полков, расставленных в глубине страны, о том, как желтая лихорадка сотнями валит солдат, а народ, боясь заразы, гонит их от своих дверей, и купцы отказываются продавать им хлеб.