Разруха, постигшая страну в 90-х годах XX века, не миновала и коневодческую отрасль. С 1991 по 2000 год на главном ипподроме страны в Москве не проводились скаковые испытания. Конные заводы и племенные фермы, оказавшись на грани выживания, были вынуждены продавать лучших лошадей, особенно спортивных пород, на Запад. Так за границей оказались, например, тракененский Биотоп и латвийский Роторс, переименованный в Расти. Биотоп стал бронзовым призером чемпионата Германии и использовался как тракененский производитель. Расти, выступавший под седлом немецкой спортсменки Уллы Зальцгебер, долгое время официально считался лошадью неизвестного происхождения. После победы на Кубке мира по выездке в 2001 году мерин возглавил рейтинг выездковых лошадей мира, и Зальцгебер пришлось открыть правду о его происхождении. Другая русская лошадь Зальцгебер — Уолл Стрит, он же Бах, ранее выступала под седлом призера московской Олимпиады Ковшова. И таких примеров много. Разоренная страна теряла своих лучших лошадей.
На организацию новых хозяйств в ненадежных экономических условиях никто не решался. Многие племенные хозяйства, находившиеся на территории бывших союзных республик, оказались изолированы от России. Снова пострадала тракененская порода: несколько крупных заводов остались на территории Белоруссии, Литвы, Латвии и Украины. Это привело к прекращению обмена племенным материалом и очень плохо сказалось на селекционной работе. В отношении такой немногочисленной породы, как донская, которую разводили на юге России, а также в Казахстане и Киргизии, вообще встал вопрос о выживаемости. Не лучше обстояло дело и с буденновской породой, изначально создававшейся для кавалерии и в 90-е оказавшейся практически невостребованной.
В начале XXI века ситуация начала понемногу улучшаться: стали открываться новые племенные хозяйства, развиваться спорт, в том числе и детский. В Россию для разведения или просто ради экзотики стали завозить породы, которых здесь раньше не было. В то же время поголовье большинства отечественных пород продолжает уменьшаться. Число маток донской, буденновской и орловской рысистой пород приближается к критическому, после которого возврат, то есть восстановление и дальнейшее разведение породы, будет невозможен. Энтузиасты-любители этих пород всеми силами стараются изменить ситуацию. Получится это или нет, покажет время.
Сфера спортивного применения лошадей с середины XX века продолжает расширяться. Кроме дисциплин, о которых уже рассказано, существует драйвинг — экипажная езда, соревнования по которой проводятся в три этапа. Первый этап — дрессаж, фигурная езда по площадке с переменами направления и аллюров, второй — марафон по пересеченной местности, третий — паркур, или езда по площадке между конусами, расположенными в определенном порядке.
Отдельной дисциплиной являются многокилометровые дистанционные пробеги. Они требуют от лошади большой выносливости, а от всадника — умения грамотно распределить ее силы, вовремя ускорять и замедлять движение. На дистанции есть контрольные пункты, где лошадей поят и подвергают ветеринарному осмотру. Лучшими лошадьми для таких пробегов считаются арабские.
Международная Федерация конного спорта (Fédération Equestre Internationale — FEI) признает также рейнинг — выездку в стиле вестерн. В рейнинге есть много специфических элементов, восходящих к ковбойским приемам работы со скотом, которых нет в спортивной выездке: резкие развороты на 180 градусов, скользящая остановка на полном скаку, при которой задние ноги лошади проезжают по земле под ее брюхо, быстрые вращения на месте. При этом седла, уздечки и костюм всадника должны быть в ковбойском стиле.
К рейнингу примыкают не признаваемые FEI, но от этого не менее популярные вестерн-дисциплины. Это ловля бычков при помощи лассо, скачки на скорость вокруг бочек или жердей и т. д. Для этих дисциплин больше всего подходят лошади пастушеского типа — кватерхорсы, индейские аппалузы, хотя в Австрии, где они развиты, немало всадников выступают на местных небольших упряжного типа конях породы гафлингер.
Активно развивается детский конный спорт, и под него выведены отдельные породы высоких пони (выше шетлендских), больше похожих на уменьшенных верховых лошадей. Продолжается скаковое и рысистое дело. В странах, где развит так называемый «ипподромный спорт», годовой оборот тотализатора исчисляется сотнями миллионов евро.
Отдельно следует сказать о роли лошади в реабилитации и социальной адаптации больных и инвалидов. Еще Гиппократ рекомендовал верховую езду больным и раненым, отмечая ее воздействие на душевное состояние пациентов. Французский энциклопедист Дени Дидро в XVIII веке написал трактат «О верховой езде и значении ее для сохранения здоровья и обретения его снова», причем особенно рекомендовал верховую езду нервным дамам. Интенсивное развитие реабилитационной верховой езды началось во второй половине XX века, а в СССР ее впервые начали применять в 80-е годы в Грузии. Мы уже говорили о Лиз Хартель, завоевавшей «серебро» на Олимпиаде в Хельсинки. В 1956 году в Стокгольме она повторила свой успех. Но Хартель выступала в одном зачете со здоровыми всадниками; теперь же существует Международная федерация верховой езды для инвалидов, проводятся соревнования по программам Паралимпийских игр (для страдающих соматическими заболеваниями) и Специальной Олимпиады (для больных с интеллектуальными расстройствами). Соревнования Паралимпиады — это аналог соревнований по выездке, разделенные на уровни, участие в которых зависит от физического состояния всадника. Соревнования по программе Специальной Олимпиады представляют собой полосу препятствий-заданий: например, нужно проехать «змейкой» вокруг тумб, остановить лошадь над лежащей на земле жердью и т. д.