Скоро после похода своего умер Богдан, и родственник Господарей Волошских, Павел Подкова был избран Гетманом из Полковников. Подковой прозвали его за силу Малороссияне, у которых он в войске долго служил и ознаменовал себя отличными подвигами. Он конские подковы ломал одной рукой, и росту был необыкновенного. В то время, будучи низложен своими подданными, Господарь Петр Подкова бежал из Валахии к Гетману; этот был ему племянник. Снарядив семь полков регистровых и два охочекомонных, Гетман выступил, разбил Волохов в двух сражениях и подступил к Букаресту; но из города вышло духовенство, чины и народ, начали просить Гетмана на Господарство; с согласия дяди, с убеждения всеобщего, наконец Гетман принял достоинство и вступил в Букарест. По окончании обрядов и пиров, он, удержав при себе не более 20 человек, отправил войска в Малороссию; но едва они выступили из города, как получили известие о смерти Гетмана. Возвратившиеся с телом его козаки разсказали, что он убит предательски: один вельможа зазвал его в свой загородный дом крестить младенца; тут напав на него, предатели повалили его на порог и отрубили ему голову. Бывшие при нем старшина и два козака умерщвлены тоже. Другие историки описывают это произшествие иначе: они говорят, что Подкова с 1400 козаками вторгнулся в Молдавию, что, видя свое безсилие, козаки победили Молдавско-Турецкое войско хитростию: при первом залпе частию разсеялись, частию попадали на землю; неприятели бросились на мнимые трупы, которые, вскочив на ноги, разбили их и вступили в Яссы. Тамошний Господарь Петр VI Хромый, бежал из города. Подкова принял правление, но чрез месяц возвратился в Польшу, был закован Каменец-Подольским Комендантом Синявским, отвезен в Львов, и, в присутствии посла Султанского, ему отсекли голову. Как бы то ни было, все историки согласны, что Подкова был обезглавлен и что он погребен в монастыре Каневском с честию. С его смертию получил булаву Гетманскую друг и мститель за него, Генеральный Асаул Шах или Шех.
Первым его старанием было отомстить Волохам и Молдаванам за смерть друга и любезного козакам своего предшественника. Он донес Королю, что Турки, покровительствуя Молдавии и Валахии, приближаются к границам Польским и Малороссийским. Король дал повеление беречь границы, умножить войско и разъезды. Умножа войска, Гетман послал иные с разъездами вниз Днепра; а сам, с многочисленными силами, отправился вверх по Днепру. Поймав несколько военных Турков у границ своих, отослал их к Королю в доказательство своей правоты; потом, ворвавшись нежданно в Валахию, напал на Букарест, избил и выжег предместья, осадил замок и потребовал у граждан виновников смерти Гетмана и Господаря Подковы, грозясь, в противном случае, все превратить в груду камней и в пепел. Боярин и 17 чиновников были выданы. Обрезав им уши и ноги их повесили пред Никольского церковью, с надписью, прибитою на церкве: «тако караются вироломци п зрадци, пролывающие кров хриистианскую неповынную. «Немедленно Султан потребовал удовлетворения за это нападение, и велел арестовать всех купцов Польских и Малороссийских, в обоих Княжествах и в Крыму. Король предал суду Гетмана в силу универсала, присланного им в войсковой Малороссийский Трибунал. Гетман был судим Генеральными Старшинами и войском, отрешен от Гетманства и отослан в Каневский монастырь на вечное заточение. Там, по доброй воле, постригся в монахи и спокойно окончил жизнь, у могилы друга своего и предшественника. В его время скончался Князь Михаил Вишневецкий, бывший Гетманом Малороссийским и перед смертию именовавшийся Кастелланом Киевским, Старостою Черкасским, Любецким и Каневским; он погребен в Киево-печерском монастыре.
После него вступил на Гетманство из Прлковников Демьян Скалозуб. При этом новом Гетмане, Крымцы, напав на границы Малороссийские, взяли в плен несколько сот человек близ местечек Котельвы и Опочинного. Получив о том известие, Скалозуб отправился с конницею, чтобы в степи Крымской перенять Татар; но хищники перешли уже за Перекоп, и на день пути до Перекопа, всю степь выжгли. Гетман писал о том в Варшаву донесение; ему было повелено освободить пленников хитростию, не открывая войны явной. Король боялся, чтобы Турки, ничем тогда незанятые; не вмешались в дело. Не зная других хитростей, кроме военных, Гетман приказал Нечаю, Кошевому Запорожскому, умножить лодки и приготовить войско к тайной экспедиции; а вскоре и сам прибыл к Сече с конницею; тут он спешил три полка и, с равным числом Запорожцев, посадил их в лодки; они отправились в море, под командою войскового Запорожского писаря, Ивана Богуславца, и Полковника Малороссийского, Карпа Перебыноса. Охочекомонным приказал Гетман идти лиманом и морским берегом до Крымкого приморья, запереть тамошние гавани, осматривать все суда, из них выходящие, и отбирать Русских пленников, если найдутся в них. Тогда же отправя один отряд судов в вершину Перекопского залива, повыше Сербулатской крепости, Гетман, с значительною пехотою и конницею, подошел к Орской линии, запер ее вороты и показал вид, что хочет перебираться чрез нее. Между тем приплыл в залив Перекопский отряд судов Запорожских. Не извещая о том войска, Гетман велел Обозному Генеральному, Якову Сурмыле, продолжать покушения за линию, чтоб тем заставить Крымцев отвезти пленников в приморские города; а сам перебрался ночью на Запорожские лодки и, отплыв в море, соединился с своею флотилиею. Тут назначил он ей разные гавани и поплыл в залив Керченский, где надеялся застать самую значительную переправу пленников. Но, как только он вошел в залив, Турецкие суда, вышедши из морей Черного и Азовского, окружили его и, по долгом сражении, взяли в плен со всеми пережившими битву. Гетман был отвезен в Цареград и уморен голодом. В тоже время писарь Богуславец был схвачен у Козлова Турками; но с помощию Запорожцев и Семиры, жены Паши Турецкого, был выручен, возвратился в Малороссию и женился на своей избавительнице. Сурмыло и Перебынос возвратились так-же в границы с войсками.
Здесь времена изменяются: любезный своим подданным Батори скончался 12 Декабря, в 1586 году. Год продолжалось междуцарствие, и наконец корону Польскую принял сын Короля Шведского Иоанна III-го и Екатерины, дочери Сигизмуда I-го, Король Сигизмунд III-й. Это тот счастливец, который несколько раз мог соединить с Польшею, Литвою и Малороссиею — Россию и Швецию, и который заложил основание гибели Польши. Историки Польские говорят об нем, что кто не умел льстить ему, тот был ему противен, что при самом въезде его в Краков он показал неспособность к правлению; «высокомерие и гордость, свойственные низким душам, владычествовали над ним и управляли всеми его действиями. Сигизмунд, потворствуя одним только льстецам но врожденной малоумным, людям самонадеянности, хотел сам во всем распоряжаться. В довершение этого описания вспомним, что Король был покорный поклонник Папы, ученик Иезуита Петра Скарге, и страстный Алхимик. В его-то время открылась Уния, т. е. соединение Греческого исповедания с Римским. Эта Уния отняла у него наследство его — Швецию, не допустила сына его Владислава быть Царем Русским и заставила Малороссию, бывшую триста лет в соединении с Литвою и Польшею, отложиться от Королевства. Так этот Миссионер Папы, на Польском престоле почти полвека царствовавший, основал разорение Государства, которое призвало его на престол.
Он начал угнетением своей телохранительницы, Малороссии; бывало Король Стефан оправдывался независимостью Запорожцев, когда Турки, случалось, изъявляли на козаков неудовольствия; он не мешал Туркам и Татарам преследовать и брать козаков даже на порогах, не входя впрочем в области Польские Сигизмунд поступил иначе.
Татаре вторгнулись в Литву в 1589 году; за вторжение козаки должны были тем же заплатить; но Король немедленно сделал все возможные на то время утеснения; козакам, его постановлением объявлено было следующее: козаки должны находиться под начальством Коронного Гетмана, от которого должны быть поставлены начальники их. Они дадут присягу, что без воли того Гетмана не будут воевать ни на море ни на суше, и не примут никого в свое товарищество. У Гетмана должен храниться казачий реестр. Осужденные на казнь не могут быть приняты в козаки. Козаки не могут отлучаться никуда без воли Старшин. Управители частных владений должны удерживать крестьян от бегства на острова Днепровские, наказывать тех, кто с добычею возвращается, или кто продает козаку порох, селитру, оружие и даже жизненные припасы. За преступление против сих обязанностей владельцы могут казнить смертию управителей. Сокрыватели награбленных козаками вещей и владельцы, поступающие против сих постановлений, предаются военному суду. Крестьянам запрещено отлучаться из селений; права владельцев оставались неограниченными; кроме десятины с конских и прочих стад и с ульев, положены налоги звериными шкурами, подати с рыболовства и отяготительные штрафы.