Из Государевой казны выделились будущие органы исполнительной власти – столы, а затем приказы.
Дьяки центрального аппарата ведали отдельными ветвями государственного управления или дипломатическими делами, организацией военной службы, ямской службой и т. д. Во главе столов и приказов стояли назначаемые великим князем (позднее царем) бояре. Так постепенно вместо территориального складывалась отраслевая структура управления.
Местное управление еще долгое время носило на себе печать феодальной раздробленности. В уезды великим князем посылались наместники из бояр или княжат. Уезды делились на волости, которые управлялись волостелями из людей не столь знатных. За службу наместники получали с местного населения корм, т. е. определенное материальное содержание. Для ограничения произвола кормленщиков от имени великого князя составлялись кормленные грамоты.
В XVI в. появляются должности городовых приказчиков, места которых занимали дворяне. Они отвечали за сбор податей, исполнение населением натуральных повинностей, благоустройство городов.
Постепенно завершается формирование государственного управления в виде приказов. К середине XVI в. существовало уже примерно два десятка приказов. Часть их ведала отраслями государственного управления – Посольский, Поместный, Разрядный приказы; другие – отдельными регионами – Казанский, приказ Сибирского дворца. Возглавлял приказ боярин или дьяк, при нем состоял штат служащих. Помимо отраслей управления, приказы ведали сбором налогов и судопроизводством.
Новыми учреждениями государства становятся в XVI в. Земские соборы – сословные представительные непериодические органы. Они созывались нерегулярно и занимались решением важных государственных дел. В их состав входили члены Боярской думы, представители духовенства, дворянства и верхушки посада. Земские соборы действовали примерно в течение 100 лет.
Первый Земский собор был созван в 1549 г. в противовес Боярской думе как совещательный орган при царе. Его работа ознаменовала начало формирования сословно-представительной монархии. На собор была возложена задача создания нового, отвечающего требованиям времени законодательства.
В результате работы собора в 1550 г. был составлен Судебник. В нем было подтверждено право перехода крестьян к другому хозяину в Юрьев день, но в связи с денежной реформой, приравнявшей новгородскую деньгу к московской, была увеличена плата за «пожилое». Для упорядочения и увеличения поступлений средств в казну была введена новая единица налогообложения – «соха» (земельная площадь). Ее размеры зависели от плодородия земель, с которых взимались подати или от количества дворов в городах.
Она началась в 1556 г. принятием «Уложения о службе. В «Уложении» было записано, что все дворяне с 15-летнего возраста были обязаны нести воинскую службу. Вооружение и воинское снаряжение они должны были приобретать за счет доходов со своих поместий. Устанавливалось, что служба передается по наследству, но при этом дворянское войско собирается только в случае войны или на ежегодные сборы. Дворянам полагалось денежное жалованье, но обычно оно не выплачивалось ввиду хронической нехватки денег в казне. Было ограничено применение местничества при занятии военных должностей. Из низших сословий набиралось стрелецкое войско, которое подчинялось лично царю; служба в нем была ненаследственной. Стрельцы представляли собой пехоту, вооруженную пищалями (кремневыми гладкоствольными ружьями). Стрельцы существовали на жалованье, также им разрешалось заниматься ремеслом и торговлей; они имели коллективные поместные дачи. Первоначально стрелецкое войско состояло из 3 тыс. человек, к концу XVI в. их численность увеличилась до 25 тыс. человек.
В 1550-е гг. была завершена реформа местного управления. Она ограничила власть наместников, введя институт выборных земских старост. В дальнейшем они были переданы под контроль губных старост (губа – административный округ), избиравшихся из местных дворян, которые в свою очередь подчинялись имевшим судебную и административную власть воеводам – служилым людям, получавшим государственное жалованье. Использование элементов выборности при формировании местной власти ускоряло процесс складывания сословно-представительной монархии. В 1555–1556 гг. была отменена система кормлений. Эти государственные меры усилили централизацию управления на местах.