Магистрат Цюриха состоял почти целиком из представителей бюргерства, в основном ремесленных гильдий. В городе и кантоне было запрещено ростовщичество, наемничество и получение иностранных пенсий.
Цвинглианская Реформация распространилась и на другие кантоны, такие как Берн, Базель, Сен-Галлен и др. Протестантские кантоны создали союз и распространили Реформацию по всей Швейцарии. Однако между Цюрихом и Берном в это время вспыхнула борьба за первенство в реформационном движении. В начавшейся войне с католическими лесными кантонами Цюрих потерпел поражение, а сам Цвингли погиб в сражении в 1531 г. После этих событий центр швейцарской Реформации переместился в Женеву.
Создателем наиболее последовательного, крайне радикального реформационного движения в Швейцарии был Жан Кальвин (1509-1564). Его учение послужило основой для создания протестантских учений многих стран (Англии, Южной Франции и др.), а также идеологии раннебуржуазных революций в Европе. Кальвин родился в г. Нуайоне на севере Франции в семье секретаря епископа. Он окончил юридический факультет Буржского университета. Получил также хорошую богословскую и филологическую подготовку. До 1534 г. Кальвин примыкал к гуманистам, был членом придворного гуманистического кружка сестры французского короля Франциска I Маргариты Наваррской. В начальном периоде французской Реформации Франциск I оказывал покровительство французским реформаторам, но под давлением Сорбонны был вынужден начать против них репрессии. Кальвин отходит от гуманистических позиций и переходит на позиции реформационные. По признанию самого Кальвина, этот переход произошел внезапно. Он не собирался становиться реформатором, и все же стал им под воздействием тяжелых внешних обстоятельств.
Покинув Францию, Кальвин поселяется сначала в Страсбурге, затем переезжает в Швейцарию, в Базель. Здесь в 1536 г. он публикует свое основное богословское сочинение «Наставление в христианской вере», которое становится катехизисом кальвинистского вероисповедания. Основным положением кальвинизма является догмат о предопределении, своими корнями уходящий в доктрину Августина. Кальвин продолжил и развил учение Августина о предопределении. Оформившееся в новых исторических условиях это учение приобрело наиболее жесткий и крайний характер, не оставив человеку свободы действий, выбора, воли.
Согласно кальвинистскому учению, участь человека в земной жизни раз и навсегда предопределена со времени творения, и ничто ее изменить не может. Никакими делами, никакими заслугами человек не может изменить изначальное свое предопределение. Одним Божье избрание дарует спасение и райское блаженство, других оно обрекает на страдания и гибель. И это предопределение не только необратимо, но и непостижимо. Однако сам Кальвин не делал из своего учения фатальных выводов. Он учил, что каждый верующий должен считать, что именно он является избранником Божьим и должен стремиться всей своей деятельностью оправдать это избранничество. Если он преуспевает, то он не должен этим гордиться и пренебрегать своими обязанностями перед Богом. Тот, кто терпит неудачу и впадает в бедность, не смеет поддаваться искушению и впадать в отчаяние.
Однако учение Кальвина было достаточно противоречивым. Уча об избранности каждого, он загонял многих в прокрустово ложе. Он писал: неудачи в жизни человека являются показателем греховности избранного человеком пути, непонимания им Божественного призвания. Иначе говоря, богатый должен преуспевать в накоплении богатства, а бедный смиренно нести бремя жизни. Учение Кальвина было религиозным выражением того факта, что в жестоком мире конкуренции удача или неудача зависят не от деятельности или способностей отдельных лиц, а от обстоятельств, от них не зависящих. Успех деятельности человека определяет не его воля, а милосердие могущественных, но неведомых сил.
В отличие от Лютера, Кальвин считал Бога неумолимым и карающим. Бог Кальвина был страшен и грозен. Страх перед Ним должен был заставить верующего каяться, хотя спасение даруется не самим покаянием, а искупительной жертвой Христа.
Если сам Кальвин считал, что человек обречен на то, на что он обречен изначально, то его последователи, не принявшие такую догматическую жесткость и крайность, делали упор на покаянии. Они создали учение о «мирском призвании», согласно которому верующий должен неутомимо трудиться на избранном поприще. Преуспевание в мирских делах являлось богоугодным делом. Благородство происхождения и сословные привилегии теряли у кальвинистов свое значение. Кальвинизм давал религиозное обоснование притязаниям бюргерства и нарождающейся буржуазии на лидерство в обществе.