По окончании рассмотрения вопроса об Иве и его послании, собор приступил к произнесению приговора относительно трех глав. Это происходило на 8 заседании собора. В определении соборном говорилось:
«Осуждаем и анафематствуем вместе со всеми другими еретиками и Феодора, который был епископом в Моисуесте и его нечестивые сочинения, и то, что нечестиво написал Феодорит против правой веры, против 12 глав святого Кирилла и против Ефесского собора, и что написано им в защиту Нестория. Кроме того анафематствуем и нечестивое послание, которое написал Ива к Марию, отвергающее, что Бог-Слово, воплотившись от св. Богородицы и Приснодевы Марии, сделался человеком, и порицающее св. памяти Кирилла, учившего православно, как еретика и как писавшего подобно Аполлинарию, и обвиняющее Ефесский собор в том, что им низложен Несторий без суда и следствия, и защищающее Феодора и Нестория и их нечестивые учения и сочинения. Итак анафематствуем вышеупомянутые три главы, т. е. нечестивого Феодора с его непотребными сочинениями, и то, что нечестиво написал Феодорит, и нечестивое послание, которое приписывается Иве, и их защитников, и тех, которые писали или пишут в защиту их, или дерзают называть их православными, или вообще защищая их, стараются защитить их нечестие именем св. отцев и св. Халкидонского собора» (Деян. V. 371–372).
Отсюда видно, что собор, осудив лицо и сочинения Феодора, не осудил лица Феодорита и Ивы, пощадил их, а осудил только некоторые сочинения одного и одно письмо другого.
На востоке, где с самого начала церковь соглашалась на осуждение трех глав, утверждение V Вселенского собора не встретило себе противодействия. Иначе дело было на западе. Запад до времени и во время V Вселенского собора решительно противился осуждению трех глав, даже сам папа колебался осудить их, и скорее склонялся к требованиям запада, чем востока. Поэтому собор V Вселенский не тотчас приобрел себе авторитет на западе наравне с прежними четырьмя Вселенскими соборами. Проходит целое полстолетие, прежде чем защитники трех глав согласились на признание V Вселенского собора. Римские папы показали себя деятельными защитниками авторитета V Вселенского собора. Сам папа Вигилий, который даже во время собора не чужд был симпатий к трем главам, после собора оказался поборником осуждения трех глав. Папа этот писал патриарху Константинопольскому: «итак нечестивые три главы мы анафематствуем и осуждаем, т. е. нечестивого Феодора вместе с его сочинениями, и все, что нечестиво написал Феодорит, и послание, которое написано Ивою, и в котором содержатся нечестивые хулы». При этом папа прибавляет: «что же сделано было или мною или другими в защиту трех глав, то мы упраздняем определением настоящей нашей грамоты» (Деян. V, 408. 409). В том же духе действовал и преемник Вигилия папа Пелагий I. Он обращается к некоторым западным епископам (в Истрии) с увещанием последовать V Вселенскому собору. Из его послания к этим епископам видно, что в это время большинство западных епископов соглашались уже на признание V Вселенского собора, ибо папа замечает в этом послании, что «хотя после долгого труда и после долгого времени, прошедшего в препирательствах даже до обид, западные епископы однако же согласилось на осуждение трех глав, познав истину». Причиною такого сопротивления Пелагий выставляет незнание латинянами греческого языка, вследствие чего они долгое время должны были руководиться ошибочными слухами (Деян. V. 421 — 422). Папа Григорий Великий (в конце VI века) борется с остальными защитниками трех глав. Это были отдаленные епископы Ирландские. Григорий разъясняет им, что в вопросе о трех главах «ничего не было нарушено в деле веры или каким-нибудь образом изменено»; призывает их к единению с церковью и надеется, что они послушно последуют её голосу (Деян. V. 458–9). После времен папы Григория авторитет V Вселенского собора непререкаемо утверждается во всей церкви наравне с первыми четырьмя Вселенскими соборами.