Образование княжеств не привело полной ликвидации сё̄эн принадлежавших придворной аристократии и храмовым хозяйствам. Именно поэтому в центральном Кинай, где их количество было особенно велико, в 20-х годах XV в. имели место ожесточенные «земельные восстания», направленные против администрации сё̄эн.
В 40-х годах XV в. были совершены походы на столицу, где 1447 г. вооруженные повстанцы даже напали на императорский дворец. В последующее десятилетие крестьянские восстания центральном районе страны становились все мощнее. Росло число выступлений против храмовых монастырских хозяйств, в ходе которых повстанцы захватывали рисовые склады и оружие. Особенно много выступлений («восстаний за списание долгов») было направлено против ростовщиков. Важной особенностью этого периода было выдвижение требований предоставления самоуправления как деревенским общинам, так и в городах.
«Республика Ямасиро»
Самым значительным выступлением в районе Кинай было восстание, в результате которого появилась «республики Ямасиро» (по названию провинции).
Непрерывные крестьянские восстания и феодальные распри, и провинциях Сэццу (совр. О̄сака) и в соседних с ней Кавати, Идзуми, и Ямасиро на длительный период лишили политической стабильности всю центральную часть о-ва Хонсю̄. В 1467 г. в Ямасиро (район совр. Киото) во время междоусобной борьбы между представителями феодального дома Хатакэяма население, измотанное бесконечными распрями, подняло восстание. Восставшие разбили войска обоих соперников-феодалов и установили народное управление — учредили специальный орган, который собирался для решения всех дел общины, в том числе и снижения налогообложения.
В течение 8 лет народное ополчение охраняло границы провинции и оберегало ее как от попыток Хатакэяма восстановить свою власть, так и от посягательств чиновников правительства бакуфу.
Восстание было подавлено вследствие роста противоречий и развития конфликта между его организаторами, в число которых входили, в том числе, феодалы, торговцы и ростовщики, имевшие свои собственные интересы, и основной массой крестьянства.
Второй период (с начала XVI в.), когда на первый план вышли междоусобные войны, отличался тем, что крестьянские восстания, продолжая развиваться в центральных провинциях, одновременно распространились и на окраинные районы страны. Это соответствовало картине стремительного включения в орбиту междоусобных войн все новых территорий.
Третий период развития крестьянского протеста не случайно совпал по времени с объединительной и реформаторской деятельностью Ода Нобунага и Тоётоми Хидэёси. Крестьянские выступлений этих последних десятилетий XVI в. были, по сути дела, непосредственной и быстрой реакцией крестьянства на аграрные реформы «объединителей».
Кровопролитные, с большим числом участников, среди которых были и самураи, эти восстания сливались с междоусобной борьбой многочисленных коалиций феодальных домов. Жесткие действия «объединителей», особенно Хидэёси, полностью изымавшего оружие в деревнях и неуклонно проводившего аграрные преобразования, опираясь при этом на регулярные карательные экспедиции, смогли подавить крестьянское движение. В последнее десятилетие XVI в. крестьянские восстания прекратились.
Крестьянские движения были знаковой характеристикой исторического развития Японии в XV в. При этом социальная по своей сути борьба крестьянства в феодальном обществе неизбежно принимала религиозную окраску. Проходя под религиозными лозунгами и сливаясь с религиозными движениями того времени, крестьянские восстания становились основой более широких народных движений.
Движение Икко̄ икки
С конца XV в. в Японии получило развитие сложное по своему составу религиозное движение, состоявшее из самых разнообразных элементов — так называемое Икко̄ икки. Руководящую роль в нем играла буддийская секта Икко̄ (или Монто). В основе ее деятельности лежало учение школы Дзё̄до синсю̄, созданной монахом Синран еще в XII в. и постепенно добившейся исключительного влияния и охватившей около половины последователей буддизма в Японии.
Среди крестьян секта пользовалась огромной популярностью. Их привлекала в ней простота и доступность как учения, так и религиозной практики. Учение Икко̄ не требовало обязательной отрешенности от мирских дел: важнейшей ценностью объявлялся труд, в том числе и самый простой — вроде уборки жилья и прочих помещений. Но все же на первом месте стоял духовный труд, открывавший путь к самому главному — к познанию высшей сущности бытия, т. е. природы Будды.