За пользование городскими пристанями и швартовку у них судов сборы брались с длины занятого участка. При длине 200 — 300 футов (60 — 90 м) сбор составлял 50 руб. в неделю; 300 — 350 футов — 57 руб. в неделю, и по 7 руб. в неделю за каждые следующие 50 футов. За используемые для складирования грузов пристани взималось 50 руб. с квадратной сажени за первую неделю хранения груза и 100 руб. за следующую неделю.
Остальные прибрежные суда для нахождения во Владивостоке получали ярлык. Сбор с судна, приписанного к Владивостоку, зависел от его вместимости. Для судна вместимостью до 300 пудов он составлял 15 руб., до 1000 пудов — 25 руб., от 1000 до 3000 пудов — 50 руб. и для джонок более 3000 пудов — 75 руб. Катера платили сборы за приписку к порту в зависимости от мощности двигателей: при мощности до 8 л.с. — 25 руб.; 8-15 л.с. — 50 руб.; и свыше 15 л.с. — 100 руб. (РГИА ДВ. Ф. 28. Оп. 1. Д. 344. Л. 25 — 27). Сборы за стоянку только за март — апрель 1909 г. составили 750 руб.! (там же. Л. 85).
В дальнейшем были установлены платежи не только за хранение грузов на пристанях, но и за разгрузку на них. Так, за выгрузку 1000 кирпичей платили 75 коп., песок, галька и камень оплачивались по 50 коп. за кубическую сажень; с каждого бревна или бруса длиной до 2 саженей брали 7 коп., а более длинные — по 10 коп.; каменный уголь оплачивался по 15 копеек за тонну; дрова — 50 коп. за куб. сажень; за сено, древесный уголь, овощи, хлебные грузы, консервированную и солёную рыбу — по 1/2 коп. с пуда; за лесные распиленные материалы платёж составлял 1/4 коп. за изделие; за скот по 5 коп. со штуки, а местную рыбу — по 50 коп. с лодки (там же. Л. 87—90). С 1 сентября 1909 г. по 1/2 копейки с пуда груза платили пароходы, разгружавшиеся на городской пристани (там же. Л. 124).
В городскую думу были многочисленные обращения с просьбами уменьшить сборы, так как джонка, прибывшая из Хунчуня с грузом бобов, не могла за счёт своего товара оплатить все сборы. Прошению было отказано из-за того, что обратились всего 7 владельцев джонок из 250 зарегистрированных. Однако решением думы были освобождены от платежей товары, доставленные с русского побережья (сено и съестные припасы), а для стройматериалов увеличены сроки выгрузки, бесплатного хранения груза на берегу и стоянки у него судов (там же. Л. 94—101).
Кроме сборов за пользование пристанями работающие во Владивостоке матросы-китайцы должны были платить больничные сборы (по 2 руб.). В 1909 г. сумма этого сбора составила 2358 руб. и выдано 1179 квитанций (там же. Л. 122).
Сборы за пользование городскими пристанями позволили замостить Алеутскую и Светланскую улицы, провести дноуглубительные работы и соорудить пристань. Для сторожей пристаней были заказаны 6 специальных блях.
Поскольку суммы платежей были по тем временам значительные, а определение грузоподъёмности китайских джонок производилось фактически на глаз из-за отсутствия у них документов, возникала почва для злоупотреблений и коррупции.