Пытаясь, в свою очередь, вместе с пятью бойцами вырваться силой из оврага, Эрнесто шел, поддерживая Чино. Этот партизан очень плохо видел, невзирая на толстые стекла очков, к тому же ноги у него были сломаны во время допроса в Лиме (столица Перу). Отряд Че состоял из кубинцев, боливийцев, чилийцев, перуанцев, то есть была представлена вся Латинская Америка. К несчастью, Чино поскользнулся, потерял очки и опустился на колени, пытаясь найти их. Че попытался ему помочь. В этот момент они оказались на линии огня пулеметного гнезда, которым командовал сержант Бернардино Хуанса, солдаты открыли огонь, и Че был ранен в правую лодыжку. Он ответил огнем, но его карабин «М-1» был внезапно пробит пулей и выведен из строя. Револьвер Че уже лишен патронов. Остается кинжал «золинген». Че пытается остановить кровь. Возле потока, несущего серную воду, негодную для питья, он садится, достает носовой платок и перетягивает ногу выше раны. Шум выстрелов и разрывов гранат мешает ему услышать приближающегося врага.
Солдат трое. Они уже некоторое время наблюдали за двумя силуэтами — один поддерживает другого, опираясь на карабин. Солдаты держат их на прицеле. Они еще не знают, что перед ними «команданте Че». Сержант Хуанса первый узнает об этом и докладывает капитану Прадо, тот приказывает присоединить Че к группе троих взятых в плен партизан и доставить к нему, командный пункт в двухстах метрах внизу. Прадо посылает в штаб армии в Валье-Гранде донесение: «15:30. Падение Рамона подтверждено, я ожидаю приказа. Он ранен». (Рамон — одна из партизанских кличек Че.) В 16:30 вертолет направлен забрать Че, но вынужден улететь ни с чем, потому что все еще обороняющиеся здесь и там партизаны стреляют по вертолету. Че видит солдат, несущих трупы его боевых друзей Антонио и Артуро и тяжело раненного Пачо. Он требует, чтобы солдаты оказали медицинскую помощь его товарищу, но ему отказывают, и скоро Пачо умирает.
В 17:30 ночь уже опустилась, армейская колонна покидает зону боевых действий и спускается к Ла-Хигуэре, она в восьми километрах. Пленные — Че, Чино и Вилли идут пешком, руки связаны, и спуск тяжелый. Вилли, не раненый, поддерживает своих товарищей как может, и в очень сложных местах их поддерживают солдаты. На подходе к деревне их встречают Мигель Ауароа — командир батальона рейнджеров и Андрес Селич — командир полка Валье-Гранде (они прилетели на вертолете), мэр деревни и крестьяне с мулами, чтобы погрузить трупы. Колонна вступает в 19:30 в Ла-Хигуэру, в деревушке слабо мигают огоньки керосиновых ламп. Жители молчаливо выходят из ночи, чтобы увидеть остатки партизан, со смешанным чувством уважения и страха.
Военные сопровождают Че до маленькой местной школы с глиняным полом и приказывают ему сесть в одном из школьных классов. Вилли препровожден в другой класс, Чино — в третий. Около 21 часа офицеры, отобедав, возвращаются, чтобы вырвать из Че сведения, могущие помочь им поймать партизан, все еще не захваченных. Они натыкаются на стену. Андрес Селич оскорбляет Че, заставляя его говорить, хватает его за бороду с такой силой, что вырывает клок волос. Ответом служит пощечина обратной стороной двух связанных рук. Руки Че связывают за спиной. Военные возвращаются в дом телеграфиста, где имеет место раздел добычи: четверо часов «Ролекс», кинжал «золинген», немецкий пистолет калибра 45, деньги: американские доллары и боливийские песо. Селич присваивает себе бумажник Че, содержащий ролики фотографий и маленькую зеленую книжку, где он переписал множество стихотворений, среди прочих «Канто Женераль» Пабло Неруды, а также карты района с заметками Че. Мелочь оставлена солдатам, но до того, как они ее поделят, Нинфа Артега, жена телеграфиста, сохраняет несколько вещей как реликвии, нож Эрнесто Че Гевары среди них. Около 23 часов из Валье-Гранде приходит приказ: «Поддерживайте Фернандо живым до моего прибытия завтра утром вертолетом. Полковник Зентено Анайя». (Фернандо — еще одно боевое имя Че.) Около полуночи майор Мигель Ауароа обходит посты. Он слышит шум из помещения, где военные и мэр Анибаль Кирога надираются, и, вслушавшись в крики, понимает, что они собираются прикончить Че. Унтер-офицеры Бернандино Хуанка и Марио Теран наиболее взвинчены и непримиримы. Дабы выполнить приказ оставить Че живым, Ауароа выбирает среди унтер-офицеров самых сознательных и дисциплинированных парней и окружает ими Че. Один из таких — Марио Хиерта Лорензетти. Он до такой степени восхищен Героическим воином, что, как он впоследствии рассказывал, у него впечатление, что Че гипнотизирует его. «Его боли усилились, и он прошептал что-то. Я приблизил ухо к его рту и услышал: «Я себя чувствую очень плохо. Я тебя прошу сделать одну вещь для меня». Я не знал, что он хочет, и он дал ответ: «Сюда, в грудь, пожалуйста…» Не имея возможности удовлетворить просьбу Че, молодой офицер принес ему одеяло и дал сигарету.
На рассвете 9 октября помощница учителя Джулия Кортес пришла посмотреть на Че. Он говорил ей низким голосом о том, что в школе происходит событие, каковое будет принадлежать истории Латинской Америки. В 6:30 вертолет доставляет полковника Зентено Анайю и кубинца — агента ЦРУ Феликса Рамоса. Зентено обменивается несколькими ничего не значащими фразами с Че, затем между Че и Рамасом происходит яростная перепалка. Агент ЦРУ устанавливает фотоаппарат на учительском столе и фотографирует журнал Че. В это же самое время в столице Ла-Пас президент Барриентос разговаривает со своим министром иностранных дел доктором Вальтером Геварой Авсе. Он в Вашингтоне, и министр советует ему сохранить жизнь Че, «потому что в противном случае мы дадим миру очень плохой имидж этой маленькой Боливии». Но боливийский президент со вниманием отнесся к другому «совету», данному послом США в Боливии Дугласом Хендерсоном, тот еще в 23 часа накануне вечером известил президента США Линдона Джонсона о захвате Че. Вашингтон полагает необходимым ликвидировать Че. Причины: его смерть нанесет страшнейший удар по Кубинской революции, важно выставить на обозрение миру Че абсолютно побежденного, убитого в бою. Президент Барриентос созывает заседание Генерального штаба с генералом Альфредо Овандо Кандией, шефом вооруженных сил, и объявляет о своем решении ликвидировать Че. Затем он отсылает шифрованный приказ о казни в Валье-Гранде, куда немедленно вылетает и генерал Овандо с несколькими военными.
В 10 часов приказ покончить с Че прибывает в Ла-Хигуэру. Марио Лорензетти вступается за Че, когда агент ЦРУ набрасывается на Че, чтобы вытащить из него сведения. В 11 часов полковник Зентено поставлен в известность о решении уничтожить Че. В то время как юная учительница Элида Хидальго приносит Че суп, Зентено предлагает Феликсу Рамосу покончить с делом самому, если тот желает. В конце концов Зентено, Селич и Ауароа решают выбрать одного из трех унтер-офицеров, которые добровольно вызвались выполнить приказ, и их выбор падает на Марио Терана: у него в этот день — день рождения. Он начинает с того, что помогает Че подняться со скамьи, на которой команданте спокойно ожидает. Но страх наполняет Терана до такой степени, что он не может сделать и жеста. Че воодушевляет его: «Стреляй, не бойся! Стреляй!»
Солдат дрожит. Позднее он вспоминает: «Его глаза ярко горят. Он меня завораживает. Я его вижу большим, огромным». Терану дают выпить, но этого мало, его палец отказывается нажать спусковой крючок. В этот момент раздается очередь в соседнем зале, потом во втором, и Че понимает, что это покончили с Вилли и Чино.
В 13:10 боливийские офицеры и агент ЦРУ так наезжают на Терана, что тот подчиняется. Он выпускает очередь из «узи» бельгийского производства, закрыв глаза, автомат плохо пристрелян, и Че все еще жив. Пуля в сердце приканчивает его. Ни один из присутствующих не сознается в этом выстреле, но секретный рапорт кубинской разведки G-2 считает его делом рук Феликса Рамоса. Всего в Че попало девять пуль.
Место захоронения Че неизвестно. По одним сведениям, его труп был сожжен, по другим — захоронен вблизи аэропорта Валье-Гранде, третья версия — сброшен с вертолета над непроходимыми лесами у реки Бени, на границе с Бразилией. Достоверно известно, что у трупа были отрезаны руки, для того чтобы прибывшие позднее агенты аргентинской полиции могли подтвердить по отпечаткам пальцев, что действительно речь идет о трупе аргентинского гражданина Эрнеста Гевары, родившегося 14 июня 1928 г. в г. Розарио, номер идентификационной карты: 3524272.