После военного совета, который провел вице-адмирал Корнилов 9 сентября 1854 г., было решено заградить проход в Севастопольскую бухту потоплением парусных кораблей и выйти на берег с оружием, чтобы сражаться на суше. 13 сентября 1854 г. на рейде Севастополя было затоплено 5 линейных кораблей и 2 фрегата, в том числе корабль «Варна». Накануне затопления судна Иван Яновский вместе с другими офицерами руководил снятием с корабля орудий, боеприпасов и всего того, что могло служить обороне от врага на суше.
Из офицеров и матросов 45-го флотского экипажа сформировали 45-й флотский батальон (всего 442 человека), который был переправлен на северную сторону для защиты Северного укрепления. Но в связи с тем, что неприятельские войска отказались от штурма укреплений северной стороны, батальон был переброшен на Корабельную сторону в район Пересыпи (в настоящее время там находится железнодорожная станция).
20 сентября 1854 г. батальон занял позиции на фланге 3-й дистанции. В конце сентября в траншее, примыкающей к 3-му бастиону, с левой стороны была заложена батарея № 21 на пять орудий (рис. 2). Со временем количество орудий на ней увеличилось.
Эта батарея строилась войсковыми саперами и матросами «Варны» под руководством мичмана Ивана Яновского, поэтому и получила впоследствии его имя «батарея Яновского». Она противостояла английским батареям, которые по количеству орудий и общему их калибру значительно превосходили русские. Но у защитников Севастополя, среди которых находились лучшие комендоры (артиллеристы) российского флота, было больше боевого опыта и самоотверженности, поэтому намерения союзных войск сходу взять Севастополь, имевший надежные укрепления только со стороны моря, с треском провалились. Началась длительная 11-месячная осада города, которая свела на нет стратегические планы Франции и Англии, несмотря на их военное превосходство.
Мичман Иван Яновский постоянно пребывал на своей батарее, которая вела обстрел неприятеля и сама находилась под огнем. В начале октября 1854 г. на бастионах Севастополя и укреплениях Малахова кургана разгорелся крупный бой, который начался массированным артиллерийским обстрелом англичанами наших позиций. Как писал в своих воспоминаниях капитан-лейтенант Александр Жандр:
«…Всего действовало с английских батареи по нашим укреплениям 71 орудие, а с нашей стороны отвечали им только 54 орудия… Как мы видели, 3-й бастион был приведен в полуразрушенное состояние. Смежные батареи: № 27 (Артюхова) и № 21 (Яновского) также были сильно повреждены…».
Однако русские ночью быстро восстановили свои бастионы, заменили подбитые орудия и не уступили своих позиций. Хотя гарнизон Севастополя и имел потери, но ни одна батарея не была полностью подавлена. Напрасно пехота союзников весь день простояла под ружьём, ожидая возможности броситься на штурм. Штурма не состоялось, но погиб от осколков вражеской бомбы организатор и руководитель обороны Севастополя вице-адмирал В. А. Корнилов.
Рис. 2. Оборонительные сооружения Севастополя.
В конце октября 1854 г. позиции, которые занимала батарея Яновского, были значительно укреплены и расширены. На новом участке обороны мичман Яновский с матросами в ночное время установил еще три 36-фунтовые пушки-карронады. Полное вооружение батареи Яновского к ноябрю 1854 г. уже составляло 8 орудий. Были также усилены и соседние батареи.
4 апреля 1855 г. во время боя Иван Яновский был ранен, но остался на своей батарее, руководя огнем пушек. Особенно жарким был бой на батарее Яновского 6 июня, когда англичане открыли ураганный огонь по позициям 3-го бастиона и прилегающих к нему батарей, пытаясь полностью подавить и прорвать оборону на этом участке. В этот день все комендоры у орудий на батарее Яновского были перебиты. Но пушки продолжали вести прицельный огонь по врагу. Иван Яновский, оставшись в одиночестве у орудий, сам поочередно заряжал их и стрелял. На помощь Яновскому пришли пехотинцы Суздальского пехотного полка под командованием Фёдора Ивановича Дарагана и солдаты 6-го саперного батальона, возглавляемые прапорщиком Михаилом Ксаверьевичем фон Зиген-Корном. В ходе жестокого боя, перешедшего в рукопашную схватку, войска противника понесли большие потери и были отбиты.
Во время вражеского обстрела батареи 8 июля 1855 г. (по старому календарному стилю) Иван Семенович Яновский был ранен вторично. На этот раз очень тяжело.