Помимо преимуществ, связанных с климатом и рыболовством, Акадия еще имеет во всей Канаде наиболее благоприятные условия для морской торговли; судоходство здесь открыто в любое время года. Таким образом, все оправдывало выбор этой территории.
Первая колония была основана на острове Сент-Круа в северо-западной части залива, который колонисты назвали Французским заливом. Там была очень удобная и вместительная бухта, ее французы назвали Королевским портом, и так появилось название Пор-Руаяль (Port-Royal). Самюэль де Шамплен потом утверждал, что это была «одна из лучших гаваней», которые он когда-либо видел, и что там «могут пребывать в безопасности две тысячи кораблей».
Один из участников экспедиции, обедневший дворянин из Пикардии Жан де Путренкур, мечтавший обосноваться в Новом Свете, попросил Дюгуа де Монса пожаловать эту гавань ему в лен, и она обрела своего первого феодального собственника.
Туземцы были очарованы манерами французов и кротостью их нравов. И, прежде всего, господин де Монс настолько завоевал их доверие, что они выбирали его судьей в спорах, возникавших между ними, и охотно подчинялись его решениям.
Суровая зима 1604–1605 гг. и скудные ресурсы острова Сент-Круа привели к смерти многих поселенцев: из 79 колонистов не менее 25 умерли от цинги. Выжившие переселились на следующий год в более плодородное место на южном берегу залива.
Из Франции туда пришел корабль с продовольствием и небольшой партией рабочих и солдат. В Королевском порту закипела напряженная работа. Свежие воспоминания о зимовке в Сент-Круа заставляли людей торопиться. По периметру прямоугольного двора (65×50 футов) возводились всевозможные постройки: дома, склады, кузница, кухня и т. д. Снаружи соорудили платформу, на которой установили четыре пушки. По сравнению с Сент-Круа новое поселение было более компактным. Очевидно, при его сооружении учли опыт зимы 1604–1605 гг.
Поселение в Пор-Руаяль. По рисунку С. Де Шамплена. 1613
Новая колония получила название Пор-Руаяль. Она выстояла и некоторое время даже процветала.
Руководителем колонии стал капитан Франсуа Граве дю Пон (в некоторых источниках – Дюпон-Граве) родом из Сен-Мало. В Пор-Руаяле с ним остались, по разным данным, от 40 до 45 человек. Среди них было всего трое «ветеранов», прибывших в Акадию в 1604 году (включая Самюэля де Шамплена). Остальные выжившие участники зимовки в Сент-Круа предпочли вернуться во Францию.
Зима 1605–1606 гг. была, несомненно, значительно менее суровой, чем предыдущая, обитатели Пор-Руаяля к ней лучше подготовились, да и вообще климат в этих местах был более мягким. Первый снег выпал только 20 декабря. Всю осень поселенцы активно охотились, заготавливали рыбу. Они быстро установили дружественные отношения с местными индейцами микмаками – французы называли их souricois (по-русски их можно назвать сурикезами, по аналогии с ирокезами – iroquois). Между колонистами и аборигенами началась активная торговля.
Безусловно, и этой зимой колонисты столкнулись со множеством трудностей. Дома, построенные наспех, из непросушенных бревен, плохо защищали от холода и сырости. В поселении не хватало хлеба. Двенадцать человек заболели цингой, и, несмотря на все старания Шамплена, половина из них умерла. Сам Самюэль де Шамплен провел зиму в напряженной работе, разбирая и систематизируя материалы, собранные им во время летних путешествий. Ранней весной 1606 года вместе с Франсуа Граве дю Поном он стал готовиться к новой экспедиции в южном направлении, рассчитывая продолжить исследование атлантического побережья Североамериканского континента и, может быть, найти более удобное место для колонии.
16 марта 1606 года их корабль вышел из гавани Пор-Руаяля. Однако погода не благоприятствовала путешествию. Около острова Гран-Манан они попали в сильный шторм, который вынес их корабль на берег, в результате чего он получил сильные повреждения. Кое-как подремонтировав судно, Шамплен и Граве дю Пон попытались продолжить путешествие, однако густой туман и сильный снегопад заставили их вернуться обратно. Снова выйти в море Шамплен и Граве дю Пон решились только 9 апреля, но и на этот раз им не удалось избежать проблем. Выводя корабль из гавани в тумане и при сильном встречном ветре, лоцман Шандорэ врезался в берег. Так череда случайностей помешала Самюэлю де Шамплену в 1606 году осуществить свою мечту и добраться до Флориды.