Весной 1942 года в Брянский лес была заброшена группа офицеров для ведения разведки в интересах фронта и выявления агентуры врага. Только за июль 1942-го чекисты обезвредили 23 «перевертыша». В каждой бригаде, крупных отрядах действовали оперотделы. Их возглавляли опытные чекисты И.Е. Абрамович, А.И. Кугучев, А.И. Власов, В.З. Рашкевич, В.К. Морозов и др. Многие чекисты погибли на боевом посту, в том числе В.А. Емельянов, Д.А. Баздеркин, Е.С. Андреев, В.Н. Гичкин, В.Н. Пилюгин, И.Д. Ананьев и В.И. Суровягин — начальник Брянского горотдела НКВД.
В ночь на 25 августа с аэродрома Ворки Емлютин и группа других командиров, в том числе Ковпак и Сабуров, из украинских отрядов вылетели на Большую землю. 31 августа партизан принял Верховный главнокомандующий И.В. Сталин. Все это было как сон. Неделю назад они находились в глубоком тылу, постоянные бои, более чем скромный быт, мошкара и комары. И вот — гостиница «Москва», чистое белье, Кремль.
Сталин интересовался всем, например, выяснял такие детали: как партизаны вытапливают тол и готовят мины, какое у них вооружение, есть ли автоматы, количество боеприпасов, зачем им танки в лесу, где партизаны достают для них снаряды, как производят скипидар, какие типы самолетов могут принимать лесные аэродромы, много ли случаев предательств?
Верховный обратил внимание на слабое развитие партизанского движения вокруг городов, недостаточно эффективную разведку в городах, где находились штабы врага. Особенно подчеркнул необходимость активизации «рельсовой войны». Беседа продолжалась около четырех часов и закончилась глубокой ночью. 1 сентября Указом Президиума Верховного Совета СССР Д.В. Емлютину и другим партизанским командирам было присвоено звание Героя Советского Союза. Через два дня в Кремле М.И. Калинин вручил награды. На прощание Михаил Иванович сфотографировался с партизанскими командирами.
Ставка удовлетворила все заявки партизан, дала даже больше — всего около 400 тонн грузов. Сталин в их присутствии позвонил знаменитой Валентине Гризодубовой, чтобы она выделила пять самолетов для постоянного базирования у партизан. И грузы пошли. Иногда в ночь до 20 самолетов. Один из первых самолетов привела сама Гризодубова.
Осенью 1942 года немцы предприняли очередную попытку уничтожить партизан. В операциях «Треугольник» и «Четырехугольник» принимало участие несколько дивизий, снятых с фронтов. Фашисты проводили тактику выжженной земли, деревни в зоне действия партизан уничтожались, население угонялось в лагеря.
Но попытки уничтожить партизан провалились. Вот что доложил генерал-лейтенант Беренгардт: «Недавние акции против партизанских бесчинств показали, что уничтожены только относительно небольшие отряды. Главным силам противника, благодаря умелому руководству, удалось избежать окружения либо вырваться из кольца. Перед нами был противник очень умелый и подвижный». Кстати, автор этого доклада не избежал справедливой кары. Он был осужден как военный преступник и повешен в Брянске.
Емлютин, как командир, вникал во все, часто бывал в отрядах, иногда оставался там на все время подготовки и проведения операций. Разбирался с недостойным поведением командиров, которые вели себя порой как удельные князьки. Что греха таить — встречалось и такое. Емлютин с ними был очень строг. И очень внимателен к нуждам рядовых партизан.
В 1943 году была проведена дерзкая операция по взрыву Голубого моста, которая описана во многих источниках и вошла в историю Великой Отечественной войны. Взрыв железнодорожного моста через Десну в районе станции Выгоничи стал образцом военного искусства, заметно ослабив положение немцев на «Курской дуге». Движение фашистских поездов было остановлено почти на месяц, что во многом и привело к катастрофе. Операция в ночь на 8 марта 1943 года проведена партизанами бригады им. Щорса с приданными им группами из бригад им. Кравцова и «Смерть немецким оккупантам» под командованием Героя Советского Союза Михаила Ромашина.
Партизаны также вели «рельсовую войну» под кодовым названием «Концерт»: когда разрушались одновременно целые участки железных дорог вместе со станционным оборудованием.
Но 1943-й был и самым тяжелым годом для партизанского края. В немецких штабах разрабатывался план разгрома наших войск на Курской дуге. В преддверии операции необходимо было очистить свой тыл от народных мстителей. Началась самая тяжелая блокада, партизаны назвали ее «Большой гонкой». В ней участвовали многие фронтовые части. Ранняя весна, кончалось продовольствие, не хватало боеприпасов. Отряды несли большие потери. С утратой аэродромов скопилось много раненых. Подвижность обременяли около 40 тысяч населения, бежавшего под защиту партизан: больные и опухшие от недоедания. Все это затрудняло действия отрядов.