Как указывает историк Джабраил Гакаев, "Государство Ичкерия не состоялось как с точки зрения международно-правового признания (де-юре), так и с точки зрения конструирования институтов публичной власти, защиты основных прав и свобод граждан" [Культура Чечни: история и современные проблемы/Отв. ред. Х. В. Туркаев; Ин-т этнологии и антропологии. — М.: Наука, 2002. - 382 с — ISB№ 5-02-008832-3]. Политолог В. Максименко полагает, что данный договор был шагом на пути к территориальной дезинтеграции России и был одной из причиной теракта на Дубровке. По его мнению, не следует приравнивать "уголовное преступление — организацию вооруженного мятежа с целью отторжения от России части ее территории — к политическому движению за национальное самоопределение". [Максименко В. Война и мир в Чечне] // Российская Федерация сегодня. — № 3. - 2003.]
Через 2 года началась вторая чеченская кампания.
В сентябре 1999 премьер-министр В.Путин произнес знаменитую фразу: "Если надо, мы их в сортире мочить будем!" И началось.
1998 — Пауза. Криминализация Чечни. Межвоенный кризис в Чечне и в России.
3 февраля 1999 года Масхадов издал указ о введении в республике шариатского правления "в полном объеме". Он поручил парламенту и муфтияту в течение месяца разработать проект шариатской Конституции (впоследствии она была разработана на основе исламского законодательства Ирана и Пакистана).
7 февраля — оппозиционные полевые командиры начали формирование параллельной Шуры (совета) во главе с Басаевым.
9 февраля — первое заседание Государственного совета (официальной Шуры)
30 сентября — начало второй войны.
В 1999 (по 2001) г.г., после налета боевиков Басаева и Хаттаба на Дагестан начинается вторая чеченская война. Ранее сепаратисты на приграничной территории неоднократно совершали теракты, похищения мирных жителей и журналистов с целью получения выкупа, угоняли скот, а также совершали иные преступления. Федеральные силы восстановили контроль над большей частью территории Чечни и её главой был назначен бывший лидер боевиков, сепаратист Ахмат — хаджи Кадыров.
В 2004 году, после гибели Ахмата Кадырова в результате террористического акта новым президентом Чеченской Республики стал железнодорожно — милицейский генерал Аллу Алханов.
В 2007 — после отставки Алханова президентом Чечни стал Рамзан Кадыров, сын Ахмата Кадырова.
11 декабря 1994 президент РФ подписал Указ № 2169 "О мерах по обеспечению законности, правопорядка и общественной безопасности на территории Чеченской Республики", отменяющий Указ № 2137с. Группа руководства действиями по разоружению и ликвидации вооруженных формирований, согласно этому Указу, должна была теперь действовать вне режима чрезвычайного положения в течение неопределенного времени. В тот же день президент РФ выступил с коротким обращением к гражданам России, в котором объяснял, с какой целью на территорию ЧР вводятся федеральные войска: "Наша цель состоит в том, чтобы найти политическое решение проблем одного из субъектов Российской Федерации — Чеченской Республики, защитить ее граждан от вооруженного экстремизма. Но сейчас мирным переговорам, свободному волеизъявлению чеченского народа препятствует нависшая опасность полномасштабной гражданской войны в Чеченской Республике. На 12 декабря намечены переговоры между представителями России и Чечни. Мы должны предотвратить их срыв".
11 декабря части войск МО и ВВ МВД РФ вошли на территорию Чечни. Войска продвигались тремя колоннами с трех направлений: Моздокского (с севера через районы Чечни, контролируемые антидудаевской оппозицией), Владикавказского (с запада из Северной Осетии через Ингушетию) и Кизлярского (с востока, с территории Дагестана).
Войска, двигавшиеся с севера, беспрепятственно прошли по территории Чечни до населенных пунктов, расположенных примерно в 10 км к северу от Грозного, где впервые столкнулись с вооруженным сопротивлением. Здесь у поселка Долинский 12 декабря российские войска были обстреляны из установки «Град» отрядом полевого командира Вахи Арсанова. В результате были убиты 6 и ранены 12 российских военнослужащих, сожжено более 10 единиц бронетехники. Ответным огнем установка «Град» была уничтожена. Колонна российских войск, двигавшаяся с запада через Ингушетию, 11 декабря была блокирована толпами местных жителей и обстреляна у села Барсуки (Ингушетия). Повреждены три БТРа и четыре автомашины. Жертв среди военнослужащих не было. В результате ответного огня появились первые жертвы среди мирного населения. С вертолетов было обстреляно ингушское село Гази-Юрт. Применив силу, российские войска прошли через территорию Ингушетии.
Всего в эти дни на территории Ингушетии были уничтожены или повреждены 28 единиц армейской техники.
12 декабря эта колонна федеральных войск была обстреляна со стороны станицы Ассиновская (Чечня). Среди российских военнослужащих были убитые и раненые, в ответ по станице был также открыт огонь, приведший, в том числе, и к гибели мирных жителей; Ассиновская была окружена. У с. Новый Шарой толпа жителей близлежащих сел блокировала дорогу (заявления российских должностных лиц о том, что боевики силой заставили мирных жителей идти впереди себя, не соответствуют действительности). Дальнейшее продвижение российских войск неизбежно привело бы вначале к необходимости стрельбы по невооруженным людям (к чему в то время солдаты и офицеры не были готовы), а затем — к столкновению с организованным в каждом из сел отрядом ополчения. Эти отряды имели на вооружении автоматы, пулеметы и гранатометы. В районе, расположенном к югу от села Бамут, базировались регулярные вооруженные формирования ЧРИ, имевшие тяжелое вооружение. В результате на западе Чечни федеральные силы закрепились вдоль линии условной границы Чеченской Республики перед селами Самашки — Давыденко — Новый Шарой — Ачхой-Мартан — Бамут. Здесь временно установился режим "ни мира, ни войны".
15 декабря П.С.Грачев отстранил от управления войсками группу старших офицеров, отказавшихся вводить войска в Чечню и выразивших желание "перед началом крупной войсковой операции, способной повлечь за собой большие жертвы среди мирного населения", получить письменный приказ Верховного Главнокомандующего. Руководство операцией было возложено на командующего СКВО генерал-полковника А.Н.Митюхина.
15 декабря в Грозном начала работу группа Уполномоченного по правам человека РФ С.А.Ковалева, в состав которой входили депутаты Государственной Думы РФ и представитель "Мемориала".
17 декабря Б.Н.Ельцин отправил Д.Дудаеву телеграмму, в которой последнему предписывалось явиться в Моздок к полномочному представителю президента РФ в Чечне, министру по делам национальностей и региональной политике Н.Д.Егорову и директору ФСБ С.В.Степашину и подписать документ о сдаче оружия и прекращении огня. В тексте телеграммы, в частности, дословно значилось: "Предлагаю без промедления Вам встретиться с моими полномочными представителями Егоровым и Степашиным в Моздоке". Начиная с 18 декабря по Грозному многократно наносились ракетно-бомбовые удары. Бомбы и ракеты падали в основном на кварталы, где располагались жилые дома и заведомо не было военных объектов. В результате этого появились большие жертвы среди мирного населения.
Несмотря на заявление президента России от 27 декабря о прекращении бомбардировок города, авиация продолжала наносить удары по Грозному.