Начав оперативную работу практически с нуля, Горский снова поставил перед Центром вопрос о дальнейшем расширении оперативного состава резидентуры. Москва удовлетворила просьбу резидента, и в начале 1941 года в помощь ему были направлены еще четыре оперработника. Сотрудники резидентуры в короткий срок восстановили связь с ранее законсервированной агентурой и приступили к получению важной внешнеполитической информации, значение которой трудно было переоценить. Среди вновь прибывших сотрудников резидентуры был Борис Крешин (оперативный псевдоним «Боб»), который, изучив обстановку и город, принял от Горского часть агентуры. С лета 1942 года он начал работать и с Кимом Филби.
С началом Великой Отечественной войны Центр направил в зарубежные резидентуры, включая лондонскую, ряд директив о перестройке работы на военный лад. В директивах подчеркивалось, что вся разведывательная работа в Англии должна подчиняться главной задаче — оказанию реальной помощи Красной армии в разгроме врага. Центр интересовали в первую очередь разведывательные данные по Германии и оккупированным ею странам. Представляли интерес также сведения о реальных планах британского правительства в отношении нашей страны.
И действительно, в самый тяжелый начальный период войны, когда разведывательная работа в других странах была парализована или велась слабо, руководимая Горским резидентура обеспечивала Кремль всей необходимой военно-политической информацией.
Резидентурой, в частности, было добыто и направлено в Центр около восьми тысяч документальных материалов по политическим, свыше ста — по экономическим и 715 — по военным вопросам. Одновременно из резидентуры поступило 50 документальных материалов о деятельности разведывательных органов Англии и других стран. В условиях острого дефицита достоверной информации эти сведения представляли для Москвы исключительную ценность. Таким образом, в 1941—1942 годах лондонская резидентура являлась основным источником информации советского руководства по Германии и странам антигитлеровской коалиции.
В январе 1944 года Горский возвратился в Москву и был назначен заместителем начальника одного из отделов центрального аппарата разведки. Его работа в лондонской резидентуре получила положительную оценку. За добытую упреждающую информацию о летнем наступлении вермахта в районе Курской дуги он был награжден орденом. В характеристике на Горского того периода, в частности, подчеркивалось: «А. В. Горский политически развит, дисциплинирован, скромен, трудолюбив. К выполнению заданий относится с увлечением. Морально выдержан, честен, предан Родине. Успешно справлялся с обязанностями резидента. Работая в трудных условиях военного времени, добился хороших результатов».
В октябре 1944 года Горский был назначен руководителем вашингтонской резидентуры и выехал в США под прикрытием должности советника посольства СССР. В США он курировал переведенного на дипломатическую работу в Вашингтон члена «Кембриджской пятерки» Дональда Маклина. Горский значительно увеличил информационную отдачу источника. Так, за первое полугодие 1945 года от него только по телеграфу в Центр было передано содержание 191 секретного документа и 26 агентурных сообщений. Из этих материалов 146 были направлены Сталину и другим высшим руководителям страны. Одновременно Горский внес значительный вклад в обеспечение Центра информацией по созданию атомной бомбы.
С 1947 по 1953 год Горский находился на руководящих должностях в центральном аппарате разведки. Неоднократно выезжал в краткосрочные командировки в зарубежные страны для выполнения ответственных разведывательных заданий. В 1953 году был переведен на руководящую работу во 2-е Главное управление МГБ СССР, где трудился до выхода в отставку.
Заслуги полковника Горского в разведке были отмечены орденами Ленина, Красного Знамени, Трудового Красного Знамени, Отечественной войны II степени, Красной Звезды, «Знак Почета», многими медалями, а также нагрудным знаком «Заслуженный работник НКВД».
Скончался Анатолий Вениаминович Горский в 1980 году.
В ходе первой встречи с Горским Филби рассказал ему, что осенью 1940 года секцию «D» и школу по подготовке диверсантов ликвидировали в связи с отсутствием практических результатов, а личный состав передали из СИС в ведение Министерства экономической войны. Большинство сотрудников были уволены, в том числе и Гай Бёрджесс, который устроился на работу в Министерство информации. Что касается Филби, то он был оставлен в качестве инструктора в тренировочном центре «СО-2» (отдел саботажа и диверсий). Школа стала именоваться «Станция 17» и размещалась в Гэмпшире.