После казни Карла трон Англии опустел, и страна стала первой парламентской республикой в мире на период, известный как Английская республика. На следующий год сын казненного короля высадился в Шотландии, чтобы продол жить войну, в 1651 году он был коронован как король Шотландии и тут же вторгся в Англию. Новый парламентский режим уже хорошо устоялся и был отлично организован, по этому храброе, но плохо спланированное нападение Карла было успешно отбито в Ворчестере, ему повезло, что он сумел ускользнуть во Францию. Все эти бурные времена бывший контролер артиллерии старого короля жил не потревоженным в Лондоне Кромвеля и общался с самыми умными и влиятельными представителями и той, и другой стороны-Эшмол явно имел дозволение на осуществление своей миссии, полученное на самом высоком уровне. Он занимался чистой политикой, и, хотя все то, к чему он стремился, было взято из франкмасонства, в результате получилось что-то совершенно новое и очень важное.
Эшмол стал другом и знакомым астрологов, математиков, физиков и других людей, которые расширяли свои знания тайн природы и науки, как требовала того Вторая Ступень масонства, созданная Френсисом Бэконом. Слово вы шло на свободу, имелся «невидимый колледж» — общество ученых, которых еще нельзя назвать организованной группой, но чье присутствие явно ощущалось.
Кромвель умер своей смертью 3 сентября 1658 года и был похоронен в Вестминстерском аббатстве. Его сын Ричард, которого он назвал своим преемником, был человеком слабым и власть удержать не сумел. Страна быстро дрейфовала к анархии, но этот процесс был скоро остановлен командующим войсками в Шотландии генералом Монком, который ввел свои войска в Лондон в мае 1660 года. Он вновь созвал Долгий парламент и заставил его восстановить монархию с Карлом II на троне. Новый король не замедлил отомстить человеку, который причинил ему столько горя. Он велел вытащить полуразложившийся труп Кромвеля из могилы и повесить как предателя, а голову насадили на шест, помещенный над залом Вестминстерского аббатства.
Возврат к монархии от республики был желанным для Эшмола, не только с личной точки зрения, но и потому, что возникли благоприятные условия для «невидимого колледжа». В 1662 году Карл II королевским указом создал Королевское общество — первое в мире собрание ученых и инженеров, призванных постигать чудеса, созданные Великим Архитектором Вселенной. Свобода, встроенная в ткань франкмасонства, привела сначала к созданию республики и, когда она не сумела выжить, к появлению организации, которая раз двинет границы человеческого знания и подготовит почву для века просвещения, фундамент для индустриального общества XIX и XX веков.
Короткий период республики в Англии прошел не напрасно: с этого момента монархия навсегда забыла о понятии божественного права на власть и существовала на основе любви народа и власти палаты общин, которая была демократическим волеизъявлением народа. В последующие годы демократические права быстро распространились и на бедных, а затем и на женщин — сбылось видение человека, которого звали Иисус.
В этот момент нашего исследования мы не сомневались, что франкмасонство несет в себе семена назорейского учения, и в частности учения Иисуса. В равной степени мы были уверены, что Королевское общество есть плод мышления, которое было заложено Бэконом в определение Второй Ступени масонства задолго до того, как такие люди, как Эшмол и Уилкинс, сумели собрать всех вместе после ран Гражданской войны. Джон Уоллес, выдающийся математик XVII века, писал в своих воспоминаниях, относящихся к первым дням существования Королевского общества:
«Я думаю, основание Общества состоялось в Лондоне, который и был местом его пребывания приблизительно в 1645 году, если не раньше, когда доктор Уилкинс (в то время капеллан в Принс Электор Палатин в Лондоне) и другие встречались еженедельно в один и тот же день и час под угрозой определенного наказания и при условии еженедельного денежного вклада на проведения экспериментов. Для этого были приняты с общего согласия определенные правила. Для избежания отвлечения и всякого рода посторонних разговоров и по некоторым другим причинам мы запретили всякое упоминание о божественности, о положении дел в государстве, о новостях всяких, кроме относящихся к нашей философии».
Такое описание самых первых встреч представителей нового мышления определенно носит масонский характер. Еженедельная встреча в известный час, известное наказание и полный отказ от всех политических и религиозных тем по-прежнему остаются приметами собрания масонской ложи.