Эта неосторожность Уоллеса была исправлена масонской иерархией начального периода Королевского общества, которое поручило Спатту написать официальную историю Королевского общества, где уже не было упоминания о масонских правилах, о которых неосмотрительно рассказал Уоллес.
Одним из влиятельных ученых, связанных с Эшмолом, был Роберт Хук, который был назначен первым куратором экспериментов. Его блестящие эксперименты, демонстрации и лекции, продолжавшиеся следующие пятнадцать лет, были очень серьезным фактором, обеспечившим сохранение общества в начальный период. Хук был одним из трех землемеров после Великого пожара Лондона, и он был одним из первых пропагандистов применения микроскопа в биологических исследованиях, а также ввел в обиход понятие «клетка» в биологическом значении этого слова.
Великие люди того века стремились вступить в Королевское общество, и, возможно, самым великим из них был сэр Исаак Ньютон, который был автором многих открытий, включая детальный анализ гравитационной структуры Вселенной. В 1672 году Ньютон был избран действительным членом Королевского общества и позднее в том же году опубликовал свою первую научную работу о новой теории света и цвета в Философских трудах общества. Через четверть века, когда Королевское общество было утверждено королевским указом, Ньютон опубликовал свой труд «Математические принципы естественной философии», или просто «Принципы», — под таким названием этот труд известен всему миру. По всеобщему мнению, эта работа является величайшим научным трудом из когда-либо написанных.
В то время, когда все первые члены Королевского общества были масонами, по истечении некоторого времени масонство отступило в тень, поскольку это собрание интеллигенции не нуждалось более в секретности и защите Ремесла для преодоления политических и религиозных препятствий.
Новое общество отнимало очень много времени и сил у Элиаса Эшмола, Роберта Морея (согласно архивным данным, первого человека, посвященного во франкмасоны на английской земле в 1641 году), Джона Уилкинса, Роберта Хука и Кристофера Рена, который был избран его президентом в 1681 году. Из хорошо сохранившихся документов видно, что франкмасоны основали Королевское общество, и этому способствовала центральная тема Второй Ступени, через которую мир и двинулся в новый научный век. Во время президентства сэра Исаака Ньютона, которое наступило через несколько лет, хорошо известный французский франкмасон по имени шевалье Рамсей был избран членом Королевского общества, несмотря на отсутствие научного багажа. Поскольку ведущие умы франкмасонства отдавали свое время и энергию новому обществу, Ремесло в Лондоне начало страдать от некоторой доли небрежения.
К 1717 году франкмасонство в Лондоне и вокруг находи лось в упадке. Регулярно встречались только четыре ложи:
Гусь и Рашпер в церкви Святого апостола Павла;
Корона на улице Паркер Лайн около улицы Друри Лайн;
таверна «Яблоня» на улице Карла, в Ковент-Гарден;
таверны «Кубок» и «Виноград» в Ченнел Роу, Вестминстер
Не было никаких сомнений, что масонство в Лондоне переживает кризис потери традиционной самобытности. По чему оно еще должно существовать? Внезапно франкмасонство стало жертвой своего собственного успеха: была преодолена вечная угроза со стороны церкви и дан толчок демократии и созданию климата, благоприятствующего научным исследованиям. В остальной части страны масонство тем не менее было поставлено на регулярную основу и становилось все более популярным. Великая ложа, образованная в неизвестное время до 1705 года, регулярно собиралась в Йорке, и эта первая Великая ложа, которая пользовалась постоянной поддержкой аристократов, присвоила себе титул «Великой ложи всей Англии». В Лондоне решили, что надо что-то предпринять по этому поводу, и все вышеперечисленные ложи собрались в таверне «Яблоня» в феврале 1717 года и избрали старшего Масона председателем собрания. Этот старший Масон нигде в литературе по имени не назван, но собрание единодушно решило собрать все четыре ложи в Гусе и Рашпере 24 июня для избрания Великого Мастера для управления всем Братством. Соответственно, в день Святого Иоанна Крестителя того же года состоялось собрание, и мистер Энтони Сойер был избран первым Великим Мастером на этот год. Интересно отметить, что в это время они избирали Великого Мастера из своих рядов «до того времени, когда им будет оказана честь избрать Благородного Брата в качестве своего главы». Возможно, это имеет отношение к тому факту, что шотландское масонство провозглашало Благородного Брата в качестве Великого Мастера со времен Первой Хартии Сен-Клера 1601 года[115]. Новая английская ложа выработала ряд правил.