Практическое руководство к разведению мериносовых овец (по Мичке-Колланда). Перевод-извлечение. «Сел. хоз-во и лесоводство», 1884, январь, стр. 37–53; апрель, стр. 237–270; май, стр. 61–89; июнь, стр. 145–159; сентябрь, стр. 43–64; октябрь, стр. 89—108; ноябрь, стр. 237–258.
Учение о механической обработке почв. СПб., 1885.
Что такое подзолистая почва. «Земледельческая газета», 1886, № 42, огр. 883.
Возделывание важнейших кормовых трав и сохранение их урожаев (силосование и приготовление сена). 1-е изд., 1886, 2-е изд., 1895; 3-е изд., 1912.
Почвы черноземной области России, их происхождение, состав и свойства. Ч. I. Образование чернозема. СПб., 1886.
О прививках антракса в больших размерах. Исследование проф. Ценковского относительно предохранительных прививок сибирской язвы овцам. «Сел. хоз-во и лесоводство», 1887, февраль, стр. 143–152.
Алешковские пески. «Ежегодник Лесного института», 1888 год 2-й, стр. 185–228.
К вопросу о степном лесоразведении. «Лесной журнал», 1888, № 2, стр. 216.—236; № 6, стр. 892–897.
На каких почвах фосфоритная мука увеличивает урожай. Исследование подзола и причин улучшения его фосфорной мукой. (Посвящается Александру Николаевичу Энгельгардту.) «Сел хоз-во и лесоводство», 1888, апрель, стр. 351–370; май, стр. 1—11.
Образование и свойства перегноя (статья первая). «Тр. СПб об-ва естествоиспытателей», том XX, 1889, отд. ботаники, стр. 123–168.
Связь между почвами и некоторыми растительными формациями. «Тр. VIII съезда естествоиспытателей и врачей», секция ботаники, отд. V, 1890, стр. 37–60.
О некоторых свойствах и составе перегноя. «Сел. хоз-во и лесоводство», 1890, октябрь, стр. 115–134.
Об обводнении южной степной полосы России. «Записка Русск., техн. об-ва», 1891, вып. 2, стр. 56–59.
О вредности выворачивания подземного слоя. «Земледельческая газета», 1891, № 7, стр. 143.
Обработка и удобрение чернозема. СПб., 1892.
По поводу неурожая в 1891 г. «Земледельческая газета», 1892, № 44, стр. 866–869; № 45, стр. 885–887; № 46, стр. 907–909. Исследование почв из виноградников Крыма и Кавказа. «Вестник виноделия», 1892, № 1, стр. 15–27; № 2, стр. 76–86; 1893, № 12, стр. 707–711.
О борьбе с засухами в черноземной области посредством обработки полей и накопления на них снега. СПб., 1893.
О сельскохозяйственном значении прудов. Стенограф, отчет о совещаниях при МОСХ в 1892 г. М., 1893, стр. 19–23.
Отзыв о сочинении г. Пономарева «Исторический обзор правительственных мероприятий к развитию сельского хозяйства в России от начала государства до настоящего времени» (СПб. 1888), представленном для соискания премии Д. Л. Толстого в 1889 г. СПб., 1893.
Естественноисторическая классификация почв и географическое распространение различных типов. Происхождение главнейших типов и характеристика их в физическом, химическом и биологическом отношениях. Залежи фосфоритов В кн.: «Сельское и лесное хозяйство России». СПб., 1893, стр. 21–50.
То же на английском языке. 1893.
Состав Днепровских песков. «Вестник виноделия», 1894, № 1 стр. 13–18.
Заметка относительно употребления глауконитовых песков. «Хозяин», 1894, № 19, стр. 370–375.
Полеводство и луговодство. В кн.: «Вся Россия». СПб., 1895, стр. 69–78.
О walce z posucha w pasie czarnoziemnym za pomoca uprawy roli i nagromadzenia na niej sniegu. Warszawa, 1896 (на польском языке).
Czarnoziem, jego uprawa i nawozenie. Warszawa, 1897 (на польском языке).
Почва, ее обработка и удобрение. Практическое руководство. Посмертное издание с предисл. Д. Н. Прянишникова. 1-е издание, СПб., 1898; 2-е изд., М., 1905; 3-е изд., М., 1908; 4-е изд., М., 1912.
Соображения относительно способов удобрения крымских виноградных почв. Одесса, 1898.
Земледелие. 7 бесед (выдержало 5 изданий). М., 1908–1915.
Рудзкий А. Ф. Памяти преждевременно отошедшего. «Земледельческая газета», 1895, № 48, стр. 989–990.
Бычихин А. А. Краткий обзор научной и педагогической деятельности П. А. Костычева. «Записки об-ва сельского хозяйства южной России», № 11–12, 1895 (1896), стр. 1—15 (портрет, список работ).
Никитин С. П. А. Костычев (некролог). Известия Геологического комитета, т. XIV, № 8–9, 1895 (1896), стр. 3—15.
Сибирцев H. M. Памяти П. А. Костычева. К годовому дню кончины П. А. Костычева. «Тр. Вольного экономич. об-ва», № 5, 1898 журн. заседаний, стр 219–223.
Коссович П. С. Краткий очерк работ и взглядов П. А. Костычева в области почвоведения и земледелия. «Тр. Вольного экономич об-ва», № 5, 1898, журн. заседаний, стр. 223–249.
Исторический очерк развития Петербургского лесного института (1863–1903). СПб., 1903.
Винер В. В. Сельскохозяйственное опытное дело (краткий исторический очерк и обзор программы русских сельскохозяйственных опытных учреждений. 1840–1910). М., 1922 (роль Костычева в организации опытного дела в нашей стране).