В апреле все активнее стали действовать и польские националисты. 19 апреля рано утром польская кавалерия под руководством полковника П.Пражмовского ворвалась в Вильнюс и заняла железнодорожный вокзал. Вечером 19 апреля в Вильнюс ворвались и два батальона пехоты, ночью к ним добавился и эскадрон кавалерии. Шли бои в разных местах Вильнюса, решительно город защищали бойцы 153 полка (командир В. Розе), отряд комсомольцев имени К.Либкнехта (вместе с мужчинами отряда город защищали с оружием в руках и немало женщин). Но вечером 21 апреля польские националисты заняли город. Тогда было принято решение созвать разные военные формирования и освободить Вильнюс. Из Укмерге в сторону Вильнюса выступили 5-й и 7-й полки, в Рокишкисе был сформирован отряд коммунистов из 120 человек (командир – П.Федаравичюс, его заместитель Й.Мацияускас). 28 апреля была освобождена Майшягала, 29 апреля – Риеше. 30 апреля советские войска вошли в пригороды Вильнюса. Но польским интервентам удалось отразить нападение. Им помогло то, что у них было значительное превосходство в численности, кроме того, они были лучше вооружены.
Польские интервенты утвердились в Вильнюсе, и начался жестокий белый террор. Были схвачены и расстреляны комиссар народного контроля С.Берсон, профсоюзный лидер П.Раманаускас, комиссар милиции Й.Мацкявичюс. В тюрьмы закрыты сотни коммунистов, комсомольцев и членов их семьей. 5 мая поляки совершили жестокий еврейский погром, убили 12 евреев, сотни ранили, ограбили много домов.
В начале мая в атаку двинулись и немецкие интервенты вместе с военным соединениями буржуазных националистов. На этот раз с воздуха их поддержала эскадрилья немецкой авиации. 5 военных самолетов сбросили бомбы на Укмерге. Вечером 3 мая немецкие интервенты заняли Укмерге.
После того как польские националисты утвердились в Вильнюсе, советское правительство Литвы, ЦК КПЛ и совет Обороны с начала мая начали работать в Минске. Здесь работал председатель правительства В.Мицкявичюс-Капсукас, члены правительства К.Циховский, А.Вайнштейн и другие их коллеги. А член ЦК КПЛ З.Алекса-Ангаретис вместе с группой соратников работал в Даугавпилс, в его обязанности входило поддерживать связи с советским правительством Латвии, он отвечал и за сектор агитации и пропаганды. В Даугавпилсе находилась и редакция издания «Коммунист».
В то время обострилось положение в городе Зарасай и его окрестностях. Это была одна из стратегически важных точек, от Зарасая сравнительно недалеко до Вильнюса и совсем близко до Даугавпилса. А в окрестностях Зарасая было сосредоточено много советских военных. 4 июня произошли важные перемены – на собрании местных коммунистов был создан новый ревком в составе трех членов. Ими стали Ю.Озарскис (председатель), Й.Груодис и И.Левин. Поскольку имелись большие проблемы с питанием военных, ревком принял решение о реквизиции продуктов питания. Так проблема с продовольствием была быстро решена, военные начали получать нормальный паек хлеба, рыбы и других продуктов. Были созданы и группы Чрезвычайной комиссии, которые эффективно боролись с саботажем и другими негативными явлениями.
В это время ЦК КПЛ принимал важные решения насчет подпольной работы на тех территориях Литвы, которые уже заняты врагами. Кроме того, предпринимались конкретные действия для усиления связи с прогрессивными немецкими военными («спартаковцами» и др.). С ответственными заданиями на оккупированные территории были посланы А.Драбавичюте, В.Ясайтис, А.Якшявичюс, Й.Думша, К.Пожела и др.
Немецкие солдаты-«спартаковцы» помогали разными способами: они собирали важные данные и передавали их советским военным, передавали оружие, распространяли агитационные прокламации. Когда их действия засекали, они иногда переходили на строну советских войск (так поступили Адолф Шель, Фридрих Шредер, Ханс Бекер и еще некоторые их коллеги). Были и случаи, когда «спартаковцы» агитировали своих друзей и переходили на советскую сторону целыми группами – так Курт Леске и Карл Ремер уговорили вместе с ними перейти линию фронта еще 8 немецких солдат. 21 июня в Шяуляй из Гамбурга прибыли 60 «спартаковцев» с 3 бронемашинами. Они напали на местную тюрьму и освободили всех политзаключенных.
Буржуазные националисты и немецкие оккупанты и дальше опирались на белый террор. Были убиты активные коммунисты С.Грибас (Шяуляй), В.Башкис, Й.Виткаускас (Паневежис), П.Мейлус, В.Климашевский (Укмерге), П.Стрепейка, К.Балтарагис (Йонишкелис) и еще много их соратников. Среди них были и коммунисты, комсомольцы, и члены их семьей, и представители прогрессивной интеллигенции, и люди, которые хотя и недолго работали в органах советской власти. Особо жестоко действовал отряд В.Григалюнаса-Гловацкиса в окрестностях Рокишкиса (их так называемый «военный суд» осудил на смертную казнь свыше 100 человек), отряд П.Плехавичюса в Жемайтии (только в период с февраля по июнь 1919 г. каратели этого отряда убили свыше 70 человек), буржуазные националисты в окрестностях Йонишкелиса (убили около 30 человек).