Из той же плеяды гениев был и Абу Наср Мухаммед ибн Тархан аль-Фараби (870–960 гг.), считавшийся до Авиценны одним из самых великих философов и оказавший на него большое влияние. Будучи переводчиком Аристотеля, он не только комментировал произведения последнего, но и создал свою собственную философскую систему, в основу которой было положено сочетание аристотелизма с неоплатоническим учением об эманации. Он сочинил множество социально-этических трактатов, а также «Большой трактат о музыке» — важнейший источник сведений о музыке Востока и древнегреческой музыкальной системе.
Эти несколько имен не исчерпывают длинный список мыслителей и ученых — выходцев из Средней Азии, которые внесли ценный вклад во всеобщую цивилизацию. Нет необходимости перечислять здесь их всех, напомним лишь, что они оставили своим народам огромное культурное наследие.
В X–XII веках отмечается появление новых тюркских династий. Это Газневиды, государство которых было основано в 962 году саманидским полководцем Алп-Тегином, объявившим себя самостоятельным правителем г. Газни (в юго-восточном Афганистане). Расцвета это государство достигло при Махмуде Газневи (998—1030 гг.) и Селъджукидах (их предводитель Сельджук жил в X — начале XI века). Последние, располагавшиеся первоначально в долине Сырдарьи, получили на вассальных условиях от государства Газневидов земли в Хорасане, а затем против них восстали. Одержав победу, династия Сельджукидов, ставшая полностью суверенной, достигает наибольшего могущества в конце XI века, распространив свое владычество не только на большую часть Средней Азии, но также на Иран, Азербайджан, Курдистан, Ирак, Сирию, Палестину, Малую Азию, Армению и Грузию. Со временем государство Сельджукидов слабеет. Раздробленное на султанаты, оно погибает под натиском каракитаев и других тюрко-монгольских племен. Примерно в это же время, после образования государства во главе с Чингисханом, начались монгольские завоевания. В 1207–1211 годах монголами были подчинены народы Сибири и Восточного Туркестана. В 1219 году монгольское войско во главе с Чингисханом вторглось в Среднюю Азию. Монгольские отряды взяли Отрар, Ходжент, Ургенч и другие города. Бухара и Самарканд сдались без боя. В 1221 году взятием Хорезма завоевание Средней Азии было завершено. Сорок лет спустя монгольская империя распространяет свою власть на огромные территории — от Кореи до Европы. Кроме Средней Азии, Ирана, Закавказья и Крыма, она включает в себя часть Китая, России, Ближнего Востока вплоть до Евфрата. Непобедимая конница монголов сокрушает и Арабский халифат. Они взяли его столицу Багдад (1258 г.), разграбили ее и казнили халифа, командора верующих.
После смерти Чингисхана, согласно распоряжениям великого завоевателя, его владения были поделены между четырьмя его потомками. Его внук Батый станет править государством Золотая Орда, под властью которой окажется южная и центральная части России. Один из его сыновей — Джагатай — станет первым монгольским ханом — правителем Средней Азии. Монголы оставят в опустошенных их войсками странах страшное воспоминание о разрушениях и бесконечных кровавых бойнях. Но, будучи немногочисленными, они вынуждены постоянно пополнять свои военные отряды местными жителями. Поэтому в армии Чингисхана очень скоро станет больше солдат тюркского происхождения, чем монголов.
Прекрасные наездники и яростные вояки, кочевники степей мало чему могли научить покоренные народы, обладавшие древней культурой. Именно этим объясняется то, что, несмотря на великие разрушения, массовые бойни и повсеместное опустошение, именно побежденные, восстав из руин, навязывают в конечном итоге победителям свои нравы, свою культуру и свою религию.
Империя, созданная Чингисханом и его наследниками, рушится в конце XIV века. Орудием этого падения явился тюрко-монгольский князь из тюркизированного монгольского племени барлас, среди предков которого, говорят, был и первый монгольский император. Его имя, Тимур-ленг («Тимур-хромец»), превратившееся во французском в «Тамерлан», как и имя Чингисхана, заставляло трепетать народы, против которых он бросал свою страшную кавалерию. За тридцать пять лет — с 1370 года, когда, избавившись от соперников, он провозглашает себя эмиром Заоксиании и начинает единолично править от имени потомков Чингисхана, до 1405 года, когда он умер, — Тимур восстанавливает, но уже под своей властью, бывшую монгольскую империю. В результате беспрестанных военных кампаний он распространяет свое владычество на территорию, раскинувшуюся от Индии до Волги и от Сирии до Китая. Смерть настигает его на семидесятом году жизни, когда, вернувшись из разрушительного похода в полностью разграбленные им Анкару, Дамаск и Багдад, он готовится возглавить уже начавшийся в 1404 году поход на Китай.