В отличие от низаритов ходжа Синда, часто подвергавшихся преследованиям со стороны местных суннитских правителей, таййибиты Гуджарата не испытывали притеснений региональных индуистских правителей. Последние явно не ощущали тревоги от фукционирования в их среде таййибитского да'ва. В результате таййибитская община разрасталась, не встречая серьезных препятствий, вплоть до мусульманского завоевания Гуджарата в 697/1298 году, когда была уничтожена главенствовавшая местная индуистская династия Вагхела из Анахилвары. Таким образом, местные да`и таййибитов, в отличие от низаритских пиров в Синде, не были поставлены перед необходимостью сокрытия своего вероисповедания. Позже, когда в Гуджарате была применена такта, она приняла формы суннитского ислама. Всё это объясняет, почему, например, сведения об индуистско-мусульманском переплетении отсутствуют в религиозной литературе общины исма'илитов бохра. Как уже отмечалось, эта литература основывалась на раннем наследии Фатимидов и исма'илитов таййибитов Йемена. С этого времени деятельность да'ва в Западной Индии стала объектом пристального внимания со стороны мусульманских губернаторов региона, назначавшихся правителями Делийского султаната. Положение исма'илитов бохра значительно осложнилось, когда Зафар-Хан (793–806/1391—1403) основал независимый Гуджаратский султанат. Правление суннитских султанов Гуджарата фактически прекратилось в 980/1572 году, когда этот регион был присоединен императором Акбаром к государству Великих Моголов.
Зафар-Хан оказался первым правителем Гуджарата, который встал на путь преследования ши'изма. С приходом к власти внука Зафар-Хана, Ахмад-Шаха I (814–846/1411—1442), построившего новую столицу в Ахмадабаде взамен Анахилвары, исма'илиты также стали подвергаться массовым гонениям. С этого времени исма'илиты бохра были вынуждены прибегнуть к такийа под маской суннизма. В период репрессивного правления Ахмад-Шаха многие исма'илиты бохра приняли суннизм. В то же самое время разногласия между таййибитским вали и диссидентами из среды исма'илитов бохра привели к дальнейшему обращению их в суннизм и выходу из общины. Согласно некоторым подсчетам, в этот период более половины членов общины вышли из ее состава и стали суннитами48. Эти изменения служат еще одним примером того, как сокрытие, проведенное в широких масштабах, может привести в особых условиях к интенсивной и всевозрастающей аккультурации и в конце концов завершиться полной ассимиляцией. Только с приходом к власти Моголов община бохра получила определенную степень религиозной свободы.
Двадцать третий да`и мутлак Мухаммад б. ал-Хасан ал-Валид стал последним да'и из бану'л-валид ал-анф, а также последним йеменским да`и, руководившим объединенными исма'илитами таййибитами Йемена и Индии. После его смерти в 946/1539 году руководство общиной перешло к индийцу из Сидхпура Йусуфу б. Сулайману. К тому времени в традицию вошла отправка талантливых бохра в Йемен для полу- чения исма'илитского образования; эти визиты также крепили религиозные и литературные связи между фракциями йеменской и индийской общин. Иусуф 6. Сулайман стал одним из таких бохра, выбранных вали для учебы в Йемене. Признав образованность Йусуфа, двадцать третий да`и назначил его своим преемником. Иусуф, первый индийский да`и мутлак, поселился в конце концов в Йемене, и, когда он умер в 974/1567 году, штаб-квартира таййибитского да'ва была переведена его индийским преемником, другим индийцем, Джалал 6. Хасаном, в Ахмадабад. К этому времени, несмотря на продолжающиеся гонения и выходы из общины, таййибиты бохра Индии значительно превзошли по численности своих единоверцев в Йемене, готовя тем самым почву для новой фазы в истории таййибитского исма'и-лизма.