Сохранилось свидетельство и о жизни блаженной в период ее скитальчества. Однажды она попросилась на ночлег в один сельский дом, хозяева которого отличались страннолюбием. Богобоязненная хозяйка приняла ее с радостью, накормила и приготовила удобную постель для отдыха. Маленькой дочери хозяйки тоже полюбилась странница, и девочка попросила постелить ей рядом с гостьей. Вскоре ребенок заснул крепким сном, а матушка так и не прилегла на постель: всю ночь она простояла на коленях, молясь перед иконами.
Во время Великой Отечественной войны была открыта Киево-Печерская Лавра, закрытая безбожниками в 1920-е годы. Наместник обители – Архимандрит Кронид – стал духовным отцом матушки. Он же постриг ее в монашество с именем Алипия – в честь преподобного Алипия, иконописца Печерского, и благословил на новый подвиг – столпничество. Место для столпа было выбрано необычное – в дупле огромной липы, которая росла возле колодца преподобного Феодосия Печерского (к сожалению, дерево до настоящего времени не сохранилось).
В дупле можно было стоять, только полусогнувшись.
Архимандрит Кронид с матушкой был строг. По окончании службы в церкви он приносил ей сухарей и говорил:
– Ну что, нагрелась? Ешь и иди, спасайся.
Матушка Алипия покорно уходила к большому дереву и забиралась в дупло, в котором все ночи проводила в молитве. Это был очень тяжелый подвиг даже в хорошую погоду, а в ненастную – и подавно. Когда зимой выпадал снег и старица не могла выбраться из дупла, духовный отец сам пробирался к ней, неся в мантии сухари, и окликал:
– Ты не замерзла?
Убедившись в том, что матушка жива, он говорил свое неизменное «Спасайся!» и уходил. Ночью под самым дуплом выли голодные бродячие собаки. Сильный мороз пронизывал до костей полусогнутое тело подвижницы. И в такие ночи только непрестанная Иисусова молитва утешала, согревала и укрепляла хрупкую монахиню и поддерживала в ней жизнь.
В это время матушку уже начинали почитать как подвижницу и молитвенницу.
По воспоминаниям современников, она хотя и была похожа на странниц послевоенного времени, но в то же время очень отличалась от них своей аккуратностью, собранностью, сосредоточенностью и доброжелательностью. Ее часто обижали и не понимали, но сама она не обижалась ни на кого. Тех людей, кто встречал матушку в те годы, особенно поражал ее взгляд: глубокий, чистый, ласковый, любящий. По нему трудно было определить, сколько старице лет: иногда она казалась подростком, а иногда – пожилой женщиной, особенно после зимних безсонных ночей, проведенных в дупле.
Подвиг столпничества матушка совершала в течение трех лет, до 1954 года, когда отошел ко Господу отец Кронид. После него она окормлялась у старца схимонаха Дамиана. Ночевала в братском корпусе под лестницей, а если было очень холодно, духовный отец благословлял ей ночевать под дверью старца Андрея, где было теплее. Это было неслучайно: двери келлии отца Андрея, в полном смысле, никогда не закрывались, у него всегда было множество посетителей. Старец исцелял больных, помогал нищим, кормил голодных Лаврской трапезой, отчитывал бесноватых. Вся жизнь отца Андрея проходила на людях. К его порогу и послал схимонах Дамиан осиротевшее чадо отца Кронида. Последние годы жизни старицы Алипии тоже пройдут на людях, и дверь ее домика-келлии будет открыта тоже для всех.
В Киево-Печерской Лавре матушка в трудах и подвигах провела около 15 лет. Послушная всегда воле Божией, старица никогда не самочинничала и всегда на все испрашивала благословения Божия и извещения о Его святой воле через своих духовных наставников.
В 1961 году власти снова закрыли святую обитель, под предлогом ремонта. Насельникам Лавры пришлось надолго ее покинуть. Их участь разделила и блаженная старица.
Закрытие Киево-Печерской Лавры матушка перенесла тяжело. Всегда незаметная и тихая, она в эти дни привлекла внимание к себе тем, что падала на улице на колени, обливаясь слезами и воздевая руки к небу, и что-то кричала на мордовском языке.
Вновь началась ее многострадальная скитальческая жизнь. Как ни тяжелы были годы, проведенные матушкой в Киево-Печерской Лавре, но они проходили в святой обители, на одном месте. А теперь – снова по миру, без документов, без прописки, без денег, без вещей. Если в сталинское время это грозило тюремным заключением, то в 1960-е годы чаще всего – психиатрической больницей, куда власти отправляли верующих «для лечения».