Как и в случае с прототипом, в конструкцию «Адмирала Макарова» в ходе постройки вносилось множество изменений, не всегда, впрочем, реализуемых на практике. Так, ещё летом 1905 г. наблюдающий за постройкой капитан 2-го ранга Лазарев подал на имя начальника отдела сооружений ГУКиС рапорт, в котором указывал на необходимость усиления броневой защиты рулевых приводов крейсера. Идея прикрытия румпельного отделения вертикальной бронёй по проекту «Форж э Шантье», подкреплённая собственным боевым опытом старшего офицера крейсера «Новик» (получившего в сражении 27 января 1904 г. серьёзные повреждения и потерявшего на время способность управляться) была позитивно воспринята в МТК, признавшего в своем журнале от 23 августа 1905 г. за № 17 «желательным закрытие борта в кормовой части «Адмирала Макарова» броневыми плитами толщиной 50 мм на протяжении от 52 до 72 кормовых шпангоутов». 1 сентября по этому вопросу последовало положительное решение морского министра.
Дополнительные поясные плиты предполагалось наложить непосредственно на наружную обшивку безо всяких дополнительных изменений и переделок. Однако вскоре кораблестроительный отдел МТК, руководствуясь существенным дополнительным расходом (135,34 тыс. руб или 360 тыс. франков), трёхмесячной задержкой готовности и значительной перегрузкой, отменил своё решение, как «не вызванное настоятельной необходимостью... [в то время как] предлагаемый «Форж э Шантье» способ бронирования не оправдывается дополнительным расходом, который пришлось бы произвести названному заводу».[6 РГАВМФ, ф. 427, оп. 1, д. 1146, л. 125.]
Гораздо более существенным признали вопрос о защите кормового дальномера посредством установки на корабле специальной бронированной рубки, о необходимости которой командир «Адмирала Макарова» капитан 1-го ранга В.Ф. Пономарёв, вступивший в должность 2 октября 1906 г., доложил в МТК. В ответ ему было предложено обсудить этот вопрос на месте с руководством завода, выяснив ориентировочную стоимость работ и возможную задержку в сдаче крейсера. В июле 1907 г. в комитет был представлен подробный чертёж рубки из крупповской нецементированной стали, а спустя некоторое время «Форж э Шантье» получила заказ на её изготовление в течение пяти месяцев, обошедшееся русской казне дополнительно в 10,9 тыс. руб. (29000 франков), причём из-за незначительного количества брони последнюю решено было не испытывать стрельбой, ограничившись лишь химическим анализом.
Создавшая «Баян» и «Адмирал Макаров» французская компания «Форж э Шантье де ла Медитеррани» (Forges et Chantiers de La Mediterranie - «Общество заводов и верфей Средиземного моря») была основана в 1855 г. и первоначально носила название Societe nouvelle des Forges et Chantiers de La Mediterranie. Законодательным актом от 5 июля 1882 г. она была преобразована в анонимное общество (Societe anonyme des Forges et Chantiers de La Mediterranie). Машиностроительный завод компания открыла в Марселе, в предместье Менпенти, а верфь - на берегу Тулонской бухты, близ городка Ла-Сен.
Во время франко-прусской войны «Форж э Шантье» в конце 1870 г. получает крупный чрезвычайный правительственный заказ на полевую артиллерию и предметы артиллерийского снабжения. Быстро модернизировав станочный парк, компания в течение нескольких месяцев успешно выполняет заказ и представляет для национальной обороны 300 орудий и 1200 артиллерийских повозок. Утвердившись в репутации поставщика артиллерии, «Форж э Шантье» с этих пор получает всё более значительные правительственные заказы. Развитие артиллерийского производства особенно нарастает при директоре инженере Г.Канэ (Gustave Canet). В 1872 г., когда «Компания океанских заводов и верфей» (Compagnie des Chantiers et Artiliers de ГОсеап) ликвидировала свои дела, «Форж э Шантье» приобретает их Мазелинские механические заводы в Гавре. Здесь основывается вторая группа заводов и при них, в Гравильском округе при Мазелинском заводе, создаётся большая судостроительная верфь (постройка миноносцев и малых судов).
Выполняя крупные судостроительные заказы иностранных государств, «Форж э Шантье» в 70-е гг. приобретало предметы артиллерийского вооружения для них на стороне - в основном в Англии. В начале 80-х в Гавре вступает в строй собственный крупный артиллерийский завод, являвшийся продолжением Мазелинского механического завода и способный выпускать как орудия всех калибров, от горных пушек в 100 кг до 100-тонных морских и береговых орудий, так и станки для них. Производство орудийных установок и гидравлических приводов сосредотачивается на заводе компании в Марселе. В конце 80-х гг. при артиллерийском заводе, в 4 км от него, открывается полигон на высоте Гок (point du Нос) у устья реки Сен, соединённый с заводом железнодорожной веткой и оборудованный для испытания орудийных стволов и станков любых калибров.