Карапасная (фр. carapace — панцирь черепахи) броневая палуба по всей длине корабля закрывала собой его жизненно важные участки: рулевой привод, машины, котлы и погреба боезапаса. Она располагалась на 1,75 м ниже ватерлинии и изготавливалась из гарвеированной стали. При гарвеизации (harveyiing) наружная часть стального листа насыщалась углеродом под воздействием высокой температуры (закаливалась), придавая ему повышенную ударостойкость. Плоская в средней части крейсера (общей толщиной 40 мм), палуба изготавливалась из 20-мм плит, приклёпанных к двойной стальной подкладке, толщина каждого слоя которой составляла по 10 мм. [35]
По первоначальным данным, 20-мм листы соединялись болтами в стык с 10-мм и размещались между ними. [6] Вся конструкция поддерживалась снизу набором трубчатых железных пиллерсов, Ближе к бортам кромки горизонтальных палубных листов плавно загибались, переходя в 30-мм бортовые скосы. [21, 35]
Здесь 20-мм плиты склёпывались с однослойной 10-мм подкладкой.
В стороны штевней плоские листы также плавно переходили в наклонные 30-мм участки, носовой из которых опускался вниз и стыковался с остриём тарана, придавая тому дополнительную прочность, а кормовой поднимался вверх для прикрытия рулевой машинки и приводов, жёстко связываясь с ахтерштевнем. По другим данным, толщина броневой палубы везде оставалась одинаковой — 38 мм [38], 40 [5] или 51 мм [34,37]. Палубные скосы делались для того, чтобы летевшим в основном по настильной траектории снарядам приходилось преодолевать более толстую в горизонтальном сечении защиту, либо рикошетировать.
В образованных скосами (выше и ниже) и бортами углах начинались коффердамы, заполненные кокосовой целлюлозой. Различные отверстия в броневой палубе, комингсы люков в районах котельных и машинных отделений, основания дымовой трубы и воздухозаборников котельных вентиляторов защищались 50-мм броневыми гласисами (фр. glacis — скат, откос). [5, 35] Согласно иным сведениям — 300- [37], 125-[36] или 127-мм. [38]
Барбет, внутри которого размещалось 320-мм орудие, устанавливался на верхней палубе и бронировался 300-мм (305 мм [34,35,38]) стальными плитами. [5, 6,21] Огромный для второклассного крейсера вес пушки с защитой, влиявший на остойчивость, вынуждал Бертина по примеру мониторов размещать их как можно ниже, что ухудшало как мореходность корабля, так и применение главного калибра на волнении. Вертикальная ось барбета находилась на расстоянии 1/3 наибольшей длины корпуса от форштевня. Центральная неподвижная труба защиты системы подачи боеприпасов, имевшая примерно втрое меньший, чем барбет диаметр и проходившая от его основания до броневой палубы, прикрывалась 250-мм сталью (260- [35], 300-[36] или 305 мм [38]). [5] Внутри неё от трюма до основания поворотного стола и вращавшаяся вместе с ним размещалась шахта подачи снарядов и зарядов диаметром 1,86 м, которая обшивалась 14-мм стальными листами. Основание вращавшегося орудийного стола не бронировалось. Поэтому снаряд или даже осколок, проникший под барбетный пояс и даже не пробивший трубу подачи, мог вывести орудие из строя, повредив стол снизу.
Толщина щита 320-мм орудия "Ицукусимы" равнялась 110 мм (100136]). Для его купола, вращавшегося вместе с поворотным столом и защищавшего пушку и прислугу от атмосферных осадков, пуль и снарядных осколков, эта величина составила 40 мм. [35] Сверху над куполом и казённой частью ствола на пиллерсах дополнительно монтировался лёгкий наклонный козырёк. Он прикрывал наблюдательную (индикаторную) рубку с мостиком внизу, на котором находились офицеры, управлявшие стрельбой, и комендор, накатывавший штурвалом ствол орудия после выстрела. По периметру мостик обшивался деревянными планками. Рубка оснащалась дальномером.
Во второй половине марта 1891 года, в Кваннонсаки, в Японии, были произведены опыты для определения действия изготовленных в Японии мортир по броневым палубам современных судов.
Стреляли из 28-см (11,02-д.) чугунной нарезной мортиры, заряжаемой с казенной части, и длиною в 9 калибров. Мортира эта изготовлена на пушечном заводе в Осака, по чертежам мортир, изготовленных фирмой Армстронг, Митчель и К°, по заказу итальянского правительства. Заряд был в 9,5 кг (23,2 р.ф.) крупнозернистого пороха, изготовленного в Японии в прошлом году. Вес снаряда 217 кг (13,25 пуд.) и разрывной заряд в 9 кг {22 фунт.). Снаряды также изготовлены в Осака из охлажденного чугуна (местной руды).