Под влиянием коммунистической агитации усиливалось недовольство и в самой армии Врангеля и его флоте. С каждым днем возрастало число дезертиров. В сентябре 1920 г. в горах и лесах Крыма скрывалось до 15 тыс. дезертиров белогвардейской армии.61 В октябре число дезертиров еще более возросло. Только в районе Судака скрывалось до 10 тыс. человек. Воинские части, посылаемые для поимки дезертиров, иногда переходили на сторону последних. 26 сентября 1920 г. в Феодосии взбунтовались матросы трех канонерок. Белогвардейское командование жестоко расправилось с восставшими, арестовав до 50 человек. В сентябре 1920 г. на кораблях, находившихся в Керчи, готовилось восстание моряков. В связи с этим было арестовано 35 матросов с военного корабля «Ростислав», 40 матросов с канонерки «Грозный» и вся команда миноносца «Дерзкий».
Действия партизан и революционного подполья расшатывали тыл Врангеля, приближая момент окончательной гибели белогвардейской армии в Крыму.
24 сентября 1920 г. М. В. Фрунзе прибыл на Южный фронт. Развернулась усиленная подготовка войск для разгрома армии Врангеля. Эта подготовка происходила в трудной боевой обстановке, когда враг предпринимал все новые и новые попытки вести наступление. Задача войск фронта состояла в том, чтобы окончательно вырвать инициативу из рук белогвардейцев, разгромить врага и во что бы то ни стало освободить Крым до начала зимы. «…Эту задачу, — говорилось в обращении Реввоенсовета Южного фронта к войскам от 27 сентября 1920 г., — нам придется разрешать в тяжелой обстановке разного рода недочетов и нехваток.
Это известно и всей России, напрягающей последние усилия, чтобы помочь фронтовикам. И, тем не менее, мы ее должны разрешить: Врангель должен быть разгромлен, и это сделают армии Южного фронта».62
Командующий войсками Южного фронта М. В. Фрунзе сформировал штаб фронта, тщательно изучил обстановку и разработал план разгрома врага. В основу плана М. В. Фрунзе положил идею окружения и уничтожения белогвардейских войск в Северной Таврии. Для этого намечалось нанести концентрические удары по главной группировке врангелевцев, чтобы отрезать ей пути отхода в Крым. Главный удар предполагалось нанести с каховского плацдарма. Решающая роль в осуществлении этого плана возлагалась на кавалерию, поэтому начало операции приурочивалось к тому времени, когда на Южный фронт прибудет 1-я Конная армия. Авиация сосредоточивалась на двух направлениях — каховском и александровском. Своими ударами она должна была поддерживать действия конницы. Впредь до окончания подготовки общего наступления командование Южного фронта решило нанести по армии Врангеля ряд коротких ударов. Активными оборонительными действиями М. В. Фрунзе рассчитывал измотать и обескровить врага и одновременно собрать силы для нанесения решающего удара.
29 сентября 1920 г. в Харькове состоялось совещание командующих армиями Южного фронта, которое обсудило план, предложенный М. В. Фрунзе. Этот план был одобрен главкомом.63 В соответствии с этим планом войска развернули подготовку к контрнаступлению, которая была сопряжена с огромными трудностями. Приходилось завершать формирование органов управления, укомплектовывать части и соединения и тут же проводить в спешном порядке обучение вновь прибывших пополнений, создавать запасы продовольствия и боеприпасов. Все это проводилось в условиях, когда враг ни на минуту не прекращал своих активных действий.
Врангель стремился прорваться на Правобережную Украину для соединения с войсками польских интервентов и буржуазно-националистической контрреволюцией на Украине. План заднепровской операции Врангеля предусматривал разгром советских войск 2-й Конной и 6-й армий и выход белогвардейцев на Правобережную Украину. При вторжении на Правобережную Украину правому флангу врангелевцев грозила серьезная опасность со стороны советской 13-й армии. Поэтому Врангель решил прежде всего разгромить 13-ю армию, нанести удар советским войскам на северном (александровском) и восточном (волновахско-мариупольском) участках фронта.64 После этого белогвардейское командование намечало форсировать Днепр в районе Александровска и юго-западнее Никополя, затем разгромить 2-ю Конную армию в районе станции Апостолово, повернуть в тыл советской 6-й армии, чтобы ликвидировать каховский плацдарм. Врангель рассчитывал захватить Правобережную Украину беспрепятственно.