Первой экспедиционной поездкой, давшей достоверные сведения о географических особенностях Ладожского озера, было путешествие академика Н. Я. Озерецкозского. В 1785 году исследователь на лодке проплыл вдоль берегов Ладоги и дал их описание.
Но и после поездки Н. Я. Озерецковского еще три четверти века не существовало надежной навигационной карты для плавания по Ладожскому озеру, что сильно тормозило освоение водоема. Толчком для обстоятельного, действительно научного изучения Ладоги послужило датированное 1857 годом письмо жителей города Сердоболя (ныне - Сортавала), в котором они обрисовали жалкое состояние судоходства на озере и доказывали необходимость его расширения и улучшения для развития экономики Приладожья. В том же письме подчеркивалось, что необходимы реформы в постройке судов для плавания по бурным водам Ладоги и создание надежных карт. Письмо возымело действие, и в 1858 году Гидрографический департамент Морского министерства организовал экспедицию, положившую начало научному изучению Ладожского озера. Экспедиция, которую возглавил А. П. Андреев, работала в течение 10 лет, до 1867 года, а затем после пятилетнего перерыва завершила свои исследования в 1873 году.
Экспедиции поручалось сделать астрономические определения ряда пунктов, расположенных по берегам озера, промерить глубины, произвести съемку береговой линии материка и островов, исследовать грунты, составить по новейшим данным карту озера с обозначением на ней мелей, банок, рифов и бухт и представить подробное описание всего озера и руководство для плавания по нему.
Участники экспедиции успешно справились с возложенными на них задачами. Астрономические определения географического положения тех пунктов Ладожского озера, которые послужили отправными точками для съемки береговой линии и промера глубин, были выполнены в 1858 - 1859 годах отрядом под руководством штабс-капитана А. А. Коргуева. Отчет об этих работах, опубликованный в 1863 году, получил высокую оценку Русского географического общества, присудившего А. А. Коргуеву Малую золотую медаль.
Гидрографическим отрядом руководил А. П. Андреев. Собранные за десятилетие и обработанные материалы дали ему возможность написать книгу, озаглавленную «Ладожское озеро».
В первой части книги, напечатанной в 1875 году, кратко, но довольно метко охарактеризованы присущие Ладоге явления - особенности распределения температуры воды, характер вскрытия и замерзания озера, течения и волнения. Для систематического наблюдения над колебанием уровня озера Андреев организовал первый на Ладоге постоянный водомерный пост. На гладкой отвесной каменной стене в Монастырской бухте Валаамского архипелага была выбита горизонтальная черта, соответствующая уровню воды 1860 года. От нее вверх и вниз отмечены футы и дюймы. Пост этот сохранился до настоящего времени, правда сейчас им не пользуются.
Специальные главы книги посвящены описанию метеорологических условий над озером - режиму ветров, туманов, облачности - и таких явлений, как миражи, полярные сияния и т. д. Андреев охарактеризовал на современном для того времени уровне геологическое строение бассейна Ладоги, флору и фауну побережий и островов, а также животных, населяющих воды озера. Андреева волновала судьба Ладоги. Изучив характер судоходства и особенности конструкций судов, он сделал ряд ценных критических замечаний и внес предложения по улучшению судов и использованию озера. Эта часть его книги долгое время оставалась единственным всесторонним описанием водоема, она не утратила ценности до настоящего времени.
Вторая часть книги Андреева представляет собой лоцию для плавания по Ладожскому озеру и служит пояснительным текстом к им же составленной карте, впервые увидевшей свет в 1875 году.
Исследование и съемка Ладожского озера, осуществленные под руководством А. П. Андреева, были крупным научным событием. Русское географическое общество наградило Андреева золотой и серебряной медалями. На Всемирной выставке в Париже книга «Ладожское озеро» получила золотую медаль.
Итак, гидрографическая экспедиция Андреева положила начало научному изучению Ладожского озера. После нее не раз работали на озере как отдельные ученые, так и целые экспедиции. В результате их деятельности некоторые природные особенности озера были довольно хорошо изучены.
Наибольший вклад в изучение Ладоги внесли две экспедиции Ю. М. Шокальского (1897 - 1899 и 1901 - 1903 годов), финская экспедиция проф. Хомена (1890 - 1903 годов), Ладожская экспедиция Государственного гидрологического института под руководством И. В. Молчанова, гидробиологические и рыбохозяйственные исследования Государственного океанографического института и Всесоюзного научно-исследовательского института озерного и речного рыбного хозяйства.