На Ладоге тростник может расти и на глубинах до 2,3 метра, но обычно уже на глубине около 2 метров он уступает место группировкам растений с плавающими листьями и погруженным макрофитом.
В заливе Янхинселькя тростник сменяется плавающим рдестом, овальные листья которого покрывают почти всю водную поверхность. Резкий контраст блестящим буроватым листьям рдеста создают длинные светло-зеленые ленточки, колышущиеся на воде, - это листья ежеголовника, получившего такое название из-за своих плодов, имеющих вид свернувшегося в клубок и ощетинившегося ежика.
Среди этого царства листьев у самой поверхности воды качается на тонком стебельке оранжевый с фиолетовым краешком неправильной формы цветок. Это пузырчатка. У нее нет корней. Поддерживать взвешенное состояние помогает растению воздух в пузырьках. Внутрь пузырьков ведет небольшое отверстие, прикрытое клапаном. Пузырьки - оригинальный аппарат для ловли мелких водных животных, которые, отодвигая клапан, легко попадают внутрь мешочка, но обратно выйти не могут. Пойманные животные в конце концов погибают в пузырьке и частично используются растением на питание.
Группировка плавающего рдеста состоит из 40 видов растений и тянется полосой, ширина которой меняется от 8 до 15 метров. Затем начинается господство желтой кубышки, которая произрастает на глубине до 3 метров. Плавающие листья кубышки не создают сплошного покрова на поверхности воды и этим способствуют совместному с ней произрастанию других видов макрофитов.
Из спутников кубышки наиболее интересен телорез алоэвидный, получивший такое название из-за своих желтых, остро зазубренных по краю листьев, которые при неосторожном прикосновении могут нанести глубокие порезы. В начале вегетации растение, напоминающее собой алоэ, произрастает на дне водоема. В середине лета телорез отрывается ото дна и всплывает, выставляя из воды концы колючих листьев. Растение зацветает. Над поверхностью воды появляется белый крупный цветок с тремя лепестками. Телорез - двудомное растение: пестичные и тычиночные цветы развиваются на различных экземплярах. Интересно, что растения с пестичными и тычиночными цветами редко произрастают вместе. В СССР, ГДР, ФРГ и Швейцарии растут преимущественно мужские тычиночные цветы, тогда как в Венгрии, Голландии и других странах - только женские, пестичные. Поэтому плоды у телореза образуются довольно редко, и он размножается главным образом почками, которые можно заметить на концах длинных боковых побегов. Осенью из почек развиваются молодые дочерние растеньица. Затем они отрываются и падают на дно для перезимовки.
Полоса кубышки завершает пояс растений с плавающими листьями. Для водных растений Ладожского озера этот пояс мало характерен: группировки плавающих растений развиты лишь в хорошо защищенных от ветра и волнений вершинах заливов. Обычно же за поясом воздушно-водных растений, сложенным преимущественно группировками тростника, а также топяного хвоща и тростянки, сразу начинается пояс погруженных растений, представленный большей частью группировками пронзеннолистного и разнолистного рдестов. Иногда картина усложняется, и между полосой рдестов и поясом плавающих растений на илистых грунтах развивается группировка урути, или роголистника, что мы видим в заливе Янхинселькя.
Высокие водные растения легко поддаются наблюдению. Однако существует немало мелких придонных макрофитов, которых трудно изучать, не облачившись в резиновый скафандр и не используя кислородную водолазную аппаратуру или акваланги.
Погрузившись в воду и привыкнув к полумраку, мы обнаруживаем на дне цепочку малюсеньких листиков повойничка - водяного перца. Тут же виднеются небольшие растения с шиловидными листьями, которые цветут под водой, не раскрывая цветка. Это шильница. Здесь можно обнаружить и густые пучки хорошо знакомой нам по домашнему аквариуму элодеи канадской, или водяной чумы. Считается, что своим появлением в Европе элодея обязана аквариумистам. Выходец из Северной Америки, элодея в 1836 году была завезена в Ирландию, откуда началось ее победное шествие по водоемам Европы. Она развивалась в огромных количествах в реках и причиняла невероятные затруднения судоходству, препятствуя движению речных судов. В конце 70-х годов прошлого столетия элодея была отмечена в Польше, а в начале 80-х - ее наблюдали в Петербурге, откуда она распространилась по рукавам и притокам Невы. В 1892 году элодея была завезена из Москвы в Екатеринбург (ныне - Свердловск) и за последующие 10 лет быстро распространилась по бассейну реки Исети. В настоящее время интенсивность распространения элодеи уменьшилась, местами она исчезает сама собой. Однако достоверного объяснения этого явления еще не нашли.