В то время, как три величайших лайнера в мире стояли рядом у нью-йоркских пирсов, в Англии и в США шли ожесточенные дебаты об их дальнейшей судьбе. Несмотря на то, что военные реалии ясно свидетельствовали о том, что Британии вскоре понадобятся все наличные войсковые транспорты, члены британского парламента в один голос заявляли о том, что «Королевы» не подготовлены к участию в войне — в первую очередь потому, что в силу своих громадных размеров они окажутся слишком лакомой целью для боевых кораблей, субмарин и самолетов стран оси. Стране, находящейся в состоянии морской блокады, будет нелегко выделять боевые корабли и людей для их сопровождения. «Королевы», заявляли критики, будет невозможно использовать в качестве грузовых судов из-за ограниченного объема их трюмов, а та тысяча тонн нефти, которую каждый из лайнеров сжигает ежедневно, жизненно необходима для боевых кораблей королевского флота. А наиболее радикально настроенные парламентарии вообще предлагали отправить «Королев» на слом, а полученный металл пустить на строительство боевых кораблей.
Президент США Франклин Д. Рузвельт имел свой взгляд на проблему. В 1940 г. он предложил госсекретарю Самнеру Уэллсу конфисковать «Куин Мэри» и «Нормандию» в счет оплаты военных долгов Англии и Франции, и использовать эти лайнеры в американском торговом флоте. Лишь резкие возражения британцев и французов удержали США от этого шага.
Пирсы «Френч Лайн» и «Кунарда» во время «великого нью- йоркского стояния» трех самых больших в мире судов
Лайнер вскоре после переоборудования в войсковой транспорт
По мере того как развивались события по другую сторону Атлантики, у «Королев» появлялось все больше и больше сторонников. Британская метрополия остро нуждалась в доставке подкреплений из доминионов. А «Королевы» подходили для этого практически идеально, благодаря своим размерам, огромной вместимости и мореходным качествам. Эти суда можно было использовать на океанских маршрутах, недоступных для транспортов меньших размеров и водоизмещения. «Королевы» имели еще один козырь — рекордную скорость, что позволяло им работать в челночном режиме с большей экономичностью и эффективностью, чем целый флот малых войсковых транспортов сопоставимой суммарной вместимости. Скорость позволяла «Королевам» уйти практически от любого боевого корабля стран оси и сорвать торпедную атаку вражеской субмарины, в результате че го отпадала нужда в эскорте из боевых кораблей. Исходя из этого, в парламенте было принято решение о том, что тратить деньги на обслуживание простаивающих в Нью-Йорке лайнеров не имеет смысла — необходимо срочно включить их в боевую работу. Адмиралтейство приняло решение о том, что «Куин Мэри» будет реквизирована в первую очередь. Уведомление о реквизиции было направлено компании «Кунард — Уайт Стар» в начале марта 1940 г., и в течение остатка месяца на борту «Королевы» кипела работа: лайнер готовили к первому военному рейсу. Судно подкрасили, обновив шаровую окраску. А бронзовые буквы, составлявшие название судна, вообще были закрашены, чтобы ввести в заблуждение противника. Для облегчения конверсии лайнера в войсковой транспорт (эту операцию решили произвести в Австралии) большинство предметов искусства, интерьеров, обшивку стен салонов и многое другое демонтировали и передали на береговые склады.
По рекомендации Адмиралтейства на «Куин Мэри» была установлена активная гидроакустическая станция АСДИК и одно 4-дюймовое орудие, призванное в случае встречи с германскими «карманными линкорами» навести на них ужас. Для обеспечения противовоздушной обороны судно снабдили несколькими музейными экспонатами — пулеметами систем «Льюис» и «Виккерс» времен начала Первой мировой войны. На бортах, на уровне палубы В, установили кабель системы размагничивания, призванный уберечь судно от магнитных мин.