Вояж длиной в 14000 морских миль с двумя промежуточными бункеровками прошел без приключений. 5 августа «Куин Мэри» встала в военно-морской сухой док сингапурской базы. В течение 41 дня рабочие очистили корпус судна от обрастаний, подновили окраску, установили в носовой части судна параванное устройство для защиты от якорных мин. Механики перебрали силовую установку и рулевой привод лайнера.
Но пребывание в Сингапуре было прервано поступившим 14 сентября сообщением о вторжении итальянских войск в Египет. Это событие представляло собой новый фактор угрозы для Британской империи: в случае захвата итальянцами Суэца оказалась бы перекрытой важнейшая транспортная артерия, по которой из Азии, Австралии и Новой Зеландии в метрополию доставлялись войска и снабжение. Кроме того, успех стран оси в Египте открывал им дорогу для вторжения на Ближний Восток. Так буквально за сутки Средиземноморье стало основным театром военных действий. Из Адмиралтейства поступил приказ: «Куин Мэри» немедленно отбыть в Сидней и приступить к переброске войск АНЗАК в Египет. 25 сентября лайнер прибыл в Австралию и в течение трех недель вновь прошел модернизацию на фирме «Кокату». Теперь он мог взять на борт 7500 человек. 20 октября «Куин Мэри» снова вышла в рейс и направилась с войсками в Суэц.
В течение следующих семи месяцев лайнер занимался переброской войск в Индийском океане. Иногда он ходил с конвоями вместе с другими лайнерами, но чаще действовал в одиночку. Командование пришло к резонному выводу: в узкостях Красного моря огромное судно будет подвергаться слишком большой опасности со стороны авиации и подводных лодок противника, поэтому большинство рейсов «Королевы» заканчивались в Бомбее или Тринкомали, где войска перегружались на более мелкие транспорты и следовали дальше.
На военной службе
В начале апреля 1941 г. к «Куин Мэри» присоединилась ее младшая сестра «Куин Элизабет». К ноябрю ку нардовские «Королевы» перебросили на африканский театр военных действий более 80000 бойцов АНЗАК, внеся неоценимый вклад в стабилизацию на египетском фронте. Однако все надежды на скорое завершение войны рухнули после 7 декабря, когда в войну на стороне оси вступила Япония. Это событие расстроило все стратегические планы англичан, поскольку под ударом оказались все их дальневосточные коммуникации и базы — такие как Гонконг и Сингапур. Австралия также находилась в опасном положении: отток сил АНЗАК в другие регионы основательно ослабил оборону доминиона. В случае захвата Австралии силы оси доминировали бы над Тихим и Индийским океанами, угрожая Индии и Юго-Восточной Азии. Оказались бы прерванными и поставки в метрополию ценного стратегического сырья — такого как нефть и каучук.
Начало войны с Японией застало «Куин Мэри» в Тринкомали, где «Королева» остановилась по пути в Сингапур. Там планировалось еще более увеличить ее вместимость. Быстрое наступление японцев на юг Малаккского полуострова сделало этот переход бессмысленным. 10 декабря японская авиация потопила британские линкоры «Принс оф Уэлс» и «Рипалс», со всей ясностью показав, что в Индийском и в южной части Тихого океана ни одно судно союзников не может считать себя в безопасности. 19 декабря 1941 г. Адмиралтейство переадресовало «Куин Мэри» в Нью-Йорк с промежуточной бункеровкой в Кейптауне. 12 января лайнер ошвартовался у пирса на реке Гудзон, пройдя 12000 морских миль. Стоянка не затянулась — уже через 10 дней судно перешло в Бостон, где на военной верфи начались работы по увеличению пассажировместимости «Королевы» на тысячу койко-мест.
Створки сухого дока Бостонской военно-морской верфи закрылись за «Куин Мэри» 27 января 1942 г. 13 дней потребовалось для того, чтобы довести вместимость «Королевы» до 8500 человек, снабдить судно дополнительными туалетами, увеличить емкость кладовых провианта и танков для пресной воды. ПВО лайнера усилили десятью 40-мм скорострельными пушками, установленными в пяти спаренных установках на полубаке и юте, а также 24 20-мм автоматами в качестве одиночных установок на надстройке. Кроме того, лайнер вооружили шестью трехдюймовками и четырьмя блоками пусковых труб в боевом отношении абсолютно бесполезных (как показала дальнейшая практика) двухдюймовых неуправляемых зенитных ракет.