Однако, — в 1490 году сильно заболел сын Ивана Грозного, и в это же время, каким-то образом, появился в Москве учёный еврей «мистер Леон» из Венеции, который клялся своей головой, что вылечит сына царя. В случае успеха, наверное, лояльность Ивана Грозного к евреям была бы обеспечена. Но лечение не удалось — царский сын умер, и царь приказал публично отрубить учёному лекарю голову.
На этом история взаимоотношений этого русского царя с евреями не закончилась. В войне с соседней Польшей его войска вошли на вражескую территорию, где проживало очень много евреев, и захватили город Полоцк (тогда был польским городом). Царь инициировал обратный процесс — переход евреев в христианскую религию. Это было предложение, от которого невозможно было отказаться, сохраняя жизнь. Евреев, не пожелавших перейти в христианство, царь приказал топить в реке Двине.
В очередной раз евреи пришли в Россию вместе с поляками. Развитая и сильная в то время Польша была заинтересованная в своей экспансии, воспользовалась слабостью боярской смутной демократии и в союзе с евреями решила распространить «свою цивилизацию» на Россию, то есть захватить и ограбить, и это у поляков получилось.
Ссылаясь на исследования еврейского историка Ю.И.Гессена, Солженицын утверждает, что при Лжедмитрии Первом (1605–1606 гг.) евреи появились в Москве в большом количестве, а в конце Смуты было объявлено, что Лжедмитрий Второй («Тушинский Вор») — «родом Жидовин».
Карамзин: «Сигизмунд послал Жида, который назвался Дмитрием Царевичем», который «разумел, если верить одному чужеземному историку, и язык Еврейский, читал талмуд, книги раввинов».
Это подтверждают и еврейские историки — КЕЭ: «Евреи входили в свиту самозванца и пострадали при его низложении. По некоторым сообщениям… Лжедмитрий Второй был выкрестом из евреев и служил в свите Лжедмитрия Первого».
После перемирия, в договоре между москвитянами и поляками было такое условие: «Не склонять никого в Римскую, ни в другие Веры, и Жидам не въезжать для торговли в Московское государство» (С).
Наступил XVIII век. Пётр Великий утверждал: «Для меня совершенно безразлично, крещён ли человек или обрезан, чтобы он только знал своё дело и отличался порядочностью». Пётр, получив европейское образование, был по тем временам очень цивилизованным человеком.
В Голландии того времени было очень много евреев, и Пётр, вероятно во время учёбы, много раз с ними сталкивался, и после этого настороженно к ним относился. Ибо историк Соловьёв, отец философа Владимира Соловьёва, утверждал, что Пётр Первый любил все нации, кроме жидов. Что и подтверждает высказывание самого Пётр Первого:
«Я хочу… видеть у себя лучше народов Магометанской и языческой веры, нежели Жидов. Они плуты и обманщики. Я искореняю зло, а не распложаю; не будет для них в России ни жилища, ни торговли, сколько о том ни стараются, и как ближних ко мне ни подкупают» (1702 г.).
Однако Пётр не настолько отрицательно к ним относился, чтобы не брать их к себе на службу. Пётр Первый привёз из Голландии в Россию представителей разных национальностей, среди них были и евреи. Например, любимый шут царя — еврей Ян Акоста. А юнга Антон Мануилович Девиер (Дивьер, Девнер) сделал хорошую карьеру, став в 36 лет первым полицмейстером Петербурга и получив титул графа. И хотя он был зятем Меньшикова, но после смерти Петра за какие-то провинности был сослан в Сибирь и вернулся в столицу только с разрешения Елизаветы Петровны в 1741 году.
Переводчик из Польского приказа еврей из Польши Пётр Павлович Шафиров дослужился при Петре до вице-канцлера и получил титул барона. Однако в 1723 году за казнокрадство был приговорён к смертной казни, заменённой ссылкой.
После смерти Петра Великого, фактически правящий некоторое время Россией Меньшиков, в своих взглядах был категоричен, приказывая: «Чтоб жидов в Россию ни с чем не впускать».
Той же политики придерживалась и правящая государством жена Петра Великого. Соглашаясь с Меньшиковым, она издала ещё отдельный указ относительно жительства евреев на Украине, в Малороссии.
«Императрица Екатерина Первая от 26 апреля 1727 г.:
«Сего апреля, 20 дня, Ея Императорское Величество указала — жидов, как мужского, так и женского полу, которые обретаются на Украине и в других российских городах, тех всех выслать вон из России за рубеж немедленно, и впредь их ни под каким образом в Россию не впускать, и того предостерегать во всех местах накрепко. А при отпуске их смотреть накрепко ж, чтоб они из России за рубеж червоных золотых и никаких российских серебряных монет и ефимков отнюдь не вывезли, а буде у них червонные и ефимки, или какая российская монета явится, и за оныя дать им медными деньгами...»