Продолжали сопротивление и некоторые части АК в Белоруссии. В Бресте и Новогрудке работали подпольные радиостанции «Ванда-19» и «Ванда-20», сотрудники которых были также арестованы чекистами. А всего в тылу наступавшей Красной Армии действовало 20 радиостанций, шесть из них — на советской территории (кроме упоминавшихся — в Вильнюсе, Браславе и Львове).
19 августа 1944 года были разгромлены отряды «Яремы» (командир арестован) и «Бустрамяка». 21 августа в Сурконтах погибли в бою с опергруппой НКВД сотрудники диверсионной группы АК «Тихотемные» капитан Францишек Цеплик, майор Мацей Калянкевич, ротмистры Ян Скраховский, Валенты Василевский, 32 солдата. С советской стороны погибло 132 человека (впрочем, это данные АК). Тогда же органами «Смерш «наступавшей Красной Армии были арестованы комендант Полесского округа АК Юзефа Сварцевич, ее муж и сын (в 1956 году, отбыв срок заключения, они вернулись в Польшу).
В декабре 1944 года в Лидском районе, в результате кровопролитного боя, был ликвидирован отряд «Рагнара» (Чеслава Зайончковс-кого), а сам он убит.
21 января 1945 года под Кавальками разгромлен отряд «Крыся» (Яна Барысевича), командир также погиб. Бойцы этого отряда неоднократно нападали на населенные пункты, уничтожали советских и партийных работников, мирных жителей, грабили их имущество и являлись, по сути, бандой. 9 февраля 1945 года под Кареличами были разгромлены 8-я бригада Витольда Туронка и кавалерийский отряд Китовского.
С июля 1944-го по июнь 1945 года против отрядов АК в Белоруссии (80 вооруженных групп) и Литве (84 польские и литовские группы) действовало 18 полков НКВД (25 000 человек), а кроме них, истребительные отряды из числа бывших партизан и партийного актива. В этих боях погибло 594 солдата и офицера Красной Армии, ранено 219 человек. Руководили операциями заместители наркома внутренних дел СССР Иван Серов, затем Сергей Круглов (в Литве), и первый замнаркома госбезопасности СССР Богдан Кобулов (в БССР).
А всего, по данным доклада Лаврентия Берии Иосифу Сталину, в декабре 1944 года органы НКВД БССР (нарком Сергей Бельченко) и НКГБ БССР (нарком Лаврентий Цанава) под общим руководством Кобулова разгромили 288 польских и белорусских организаций и взяли 5069 их участников, ликвидировали 13 немецких резидентур, арестовали 700 немецких агентов, уничтожили 800 повстанцев, выловили более 1600 дезертиров и 48 000 уклонявшихся от призыва в РККА. На границе с УССР, в Пинской, Брестской и Полесской областях были ликвидированы 11 бандгрупп из Волынской и Ровенской областей (убито 385 и арестовано 160 оуновцев).
В сентябре 1945 года в докладе руководству СССР нарком внутренних дел Лаврентий Берия дает общие цифры с июля 1944 по сентябрь 1945 года. За этот период в БССР было убито 3232 бандита и дезертира; арестовано около 15 000 бандитов и антисоветчиков, около 82 000 дезертиров; добровольно сдались 698 бандитов и более 48 000 дезертиров.
В январе 1945 года польское эмигрантское правительство в Лондоне приказало распустить АК, что и было формально выполнено ее последним командующим, генералом Леопольдом Окулицким.
Однако, несмотря на роспуск АК, борьба продолжалась. Лишь в мае 1949 года был ликвидирован один из последних крупных (около 800 человек) отрядов под командованием «Олеха» (Анатоль Радзивоник). Отряд совершил многочисленные убийства советских работников, сотрудников милиции, колхозников в Гродненской области. После операции, проведенной полком внутренних войск, отряд был разгромлен, а сам «Олех» убит.
К 1951 году, после обещанных амнистий в Гродненской области сложили оружие более 2000 аковцев — при этом некоторые из них были убиты бывшими соратниками. Но и после 1951 года продолжалась ликвидация оставшихся банд — «Гражуолиса» (из Литвы), «Бяр-жиса», «Сенка».
С 1944 по 1952 год все в той же Гродненской области от рук аковцев погибло 774 человека — партийных, советских, комсомольских и хозяйственных работников, тружеников совхозов и колхозов, мирных жителей, которых часто убивали вместе с семьями. Банда «Палоя» (Альфонс Тыркин) убила 38 переселенцев из УССР. Банда была уничтожена, однако атаману удалось уйги за кордон. В 1970-е годы его обнаружили мирно проживающим в братской ПНР, но требование советской стороны о его выдаче поляки отклонили.
Цифры жертв АК не учитывают офицеров и солдат МГБ и МВД. Известны имена офицеров МГБ, погибших в Гродненской области в 1947–1953 годах: Анатолий Федосимов, Иван Носков, Николай Стрельников, Александр Иванов, Андрей Стрелкове кий, Иван Арефьев, Георгий Князев.
Последний по времени из погибших, капитан Андрей Стрелков-ский, был убит в Лиде вместе с сержантом и рядовым, и еще один рядовой был тяжело ранен. Их убил бывший аковец Ян Гринцевич, который бежал из заключения и вернулся на родину, где занялся террором. Он застрелил милиционера, уполномоченного министерства заготовок, председателя колхоза. После почти полуторагодового розыска Гринцевич, выданный крестьянином села, где он укрывался, в декабре 1954 года был арестован и приговорен к расстрелу.