На "Нагато": адмирал И. Ямамото в ходовой рубке (вверху). На камбузе. Конец 1930-х гг.
19 ноября соединение прибыло в пункт назначения и начало выгрузку личного состава и снаряжений, 23 октября вышло в вероятную точку местонахождения американского соединения, но противника не обнаружило и 26 прибыло на Трук. Следующее три месяца соединение стояло в лагуне.
1 февраля 1944 года произошел американский авианалет на Трук, и все тяжелые корабли Императорского флота ушли с Трука в Паллау. "Нагато" совершил переход в составе соединения, в которое также вошли линкор "Фусо", крейсера "Судзуя", "Кумано", "Тоне" и 5 эсминцев.
Патрулирующая у Трука американская подводная лодка "Пермит" (SS-176) обнаружила вражеское соединение, но выйти в атаку не смогла. 4 февраля корабли прибыли в Паллау. Но теперь и эта база не была безопасной, и 17 февраля "Нагато" в составе того же соединения выходит в море и берет курс на Сингапур.
Во время перехода сигнальщики линкора три раза докладывали об обнаружении вражеских подводных лодок (16, 17 и 20 февраля). После рассвета 20 февраля американская подводная лодка "Паффер" (SS-268) обнаружила "Нагато", но занять позицию для атаки не смогла.
21 февраля соединение прибыло на рейд Линга. Следующий месяц корабль находился на этом рейде, лишь изредка выходя в море на боевую подготовку. 30 марта "Нагато" перешел с рейда Линнга в Сингапур. Там линкор проходил текущий ремонт, совмещенный с докованием, после чего 15 апреля вернулся в Линнг.
Вторая половина апреля прошла для корабля в боевой подготовке, как индивидуальной, так и в составе соединения. Отправной точкой в боевой подготовке стали большие учения по борьбе за живучесть, которые окончились 4 мая.
11 мая 1945 года "Нагато" в составе главных сил Мобильного флота выходит в море.
Цель выхода — база в Тави-Тави (около Борнео). Во время перехода провели учения по маневрированию и стрельбы. В Тави-Тави прибыли 14 (по другим данным, 15) мая. До 11 июня "Нагато" простоял в гавани Тави-Тави, где вместе с остальными кораблями ждал начала операции "А-ГО", вошедшей в историю как Первая битва в Филиппинском море. В этот день в море вышли Главные силы японского флота. "Нагато" был в составе соединения "В", в которое также входили 3 авианосца, тяжелый крейсер и 8 эсминцев. Вместе с ними двигалось соединение "А": 3 авианосца, 2 тяжелых, 1 легкий крейсер и 7 эсминцев.
"Нагато" в бою. Море Сибуян, 1944 г.
В 10 ч утра корабли Японии были обнаружены вражеской подводной лодкой "Редфин" (SS-272), которая и доложила о выходе японского соединения в штаб американского флота. 12 июня "Нагато" и остальные корабли пополнили запас топлива с танкеров и пошли к Филиппинам. 13 июня у пролива Сан-Бернардино соединение было обнаружено еще одной американской подлодкой "Флаинг-Фиш" (SS-229). Корабли Императорского флота продолжали свой поход. По плану операции береговая авиация начала наносить удары по американскому соединению TF-58. Пилоты доложили о многочисленных успехах, но на самом деле вражеский флот не пострадал.
17 июня соединение в очередной раз обнаружила американская подводная лодка. 18 июня командующий японской эскадрой перестроил ее боевой порядок. 19 июня с палуб японских авианосцев стартуют самолеты. Мощного удара по американскому соединению не получилось, большая часть группы не обнаружила противника на Гуаме. Так неудачно для японцев началось Первое сражение в Филиппинском море.
Позднее японские корабли были атакованы вражеской палубной авиацией. Находившийся в охранении авианосца "Дзуньо" "Нагато" сбил огнем главного калибра два "Эвенджера" и отогнал остальные атакующие самолеты. Известно, что линкор получил незначительные повреждения, потерь среди экипажа не было.
В 18 ч 30 мин самолеты-торпедоносцы "Эвенджер" с авианосца "Белло Вуд" (CVL-24) добились попадания в авианосец "Хийо", который загорелся, в 20 ч 30 мин на его борту прогремел сильный взрыв, и он затонул. Все это время "Нагато" и тяжелый крейсер "Могами" находились рядом с поврежденным кораблем. После гибели "Хийо" эсминцы охранения приступили к спасению уцелевших моряков. После завершения этой операции линейный корабль, как и все корабли Мобильного соединения, пошел на Окинаву.