В течение 1915-1918 гг. почти все линкоры Гранд Флита оснастили системой управления огнем центральной наводки противоминных орудий.
В этот же период времени подобная система управления огнем была смонтирована и на "Нептуне". Рубки с ПУАО разместили на индивидуальных площадках, закрепленных на правой и левой опорной ноге фок-мачты, на уровне верхнего мостика.
К концу 1917 года на всех линкорах Гранд Флита были установлены по два больших циферблата, на которых для мателотов с помощью стрелки показывалось расстояние до кораблей противника. Циферблаты получили название "указатели дистанции до цели". На "Нептуне" один циферблат закрепили на фок-мачте под площадкой фор-марса на рубке ПУАО, второй - на грот-мачте на рубке кормового наблюдательного поста. Циферблатные указатели просуществовали на флоте до 1922 года и после этого их сняли.
Торпедное вооружение. На момент готовности "Нептун" имел три подводных 18-дюймовых (457-мм) торпедных аппарата (конструкции компании "Армстронг"), размещенных в трех торпедных отсеках-два бортовых, расположенных на трюмной палубе между наружной поверхностью носового барбета и помещением машинного отделения носового шпиля и одного кормового (после Ютландского сражения был снят) с общим боезапасом 18 торпед.
Труба торпедного аппарата была снабжена боковой крышкой, при открывания которой торпеда загружалась внутрь трубы вручную с поданного устройства. Применение боковой перезарядки обуславливалось нехваткой ширины корабля. Торпеда выстреливалась сжатым воздухом, подаваемым трубопроводами от воздушного компрессора. В аварийной ситуации (при отказе работы компрессора) в каждом торпедном отсеке имелись баллоны со сжатым воздухом, подключенные к основной магистрали. При производстве выстрела направляющая труба торпедного аппарата выдвигались вперед за борт для того, чтобы предохранить торпеду от повреждения или даже переламывания, а также, чтобы торпеда не смогла быть отброшенной назад, к миделю корабля набегавшим водяным потоком от форштевня.
Авиационное вооружение. В 1918 году на крыше носовой орудийной башни "А" была установлена авиационная взлетная платформа для легкого колесного самолета-биплана типа "Сопвич-ПАП" или "Сопвич- Кэмел"), выполнявшего функцию самолета-корректировщика или разведчика. По-походному самолет стоял закрепленным непосредственно на взлетной платформе под защитой брезентового ангара. "Нептун" обеспечивался самолетом только в том случае, если выходил в море для проведения учебных маневров и стрельб. При взлете самолета башня "А" с авиационной платформой разворачивалась против ветра.
На момент готовности прожекторное вооружение "Нептуна" состояло из шестнадцати боевых и сигнальных ламповых прожекторов с диаметром зеркала 24 дюйма (610 мм), которые наводились вручную. Прожекторы, установленные на специальных прожекторных площадках, разместили поровну (по восемь пар) на носовой надстройке и на большой прожекторной платформе вокруг грот-мачты, немного выше кормовой надстройки. Состав, расположение и боевые характеристики прожекторов в течение службы корабля неоднократно менялись.
Бронирование. Боевая защита "Нептуна", являвшейся важнейшей составляющей конструкции любого линкора, по своей концепции не представляла из себя ничего качественно нового и повторяла в основном схему бронирования "Сент-Винсента", хотя не обошлось и не без некоторых отличий:
1. Нижний 10-дюймовый (254-мм) броневой пояс, прикрывающий ватерлинию, был несколько уменьшен по своей протяженности и не доходил до траверзов наружной поверхности концевых орудийных барбетов.
2. Толщина бронирования носовой оконечности броневого пояса увеличена с двух дюймов (51 мм) до двух с половиной дюйма (64 мм).
3. Была демонтирована кормовая боевая рубка. Вместо нее установили легко бронированную сигнальную рубку.
4. Впервые на Королевском флоте применили бронирование дюймовой сталью основания кожухов дымовых труб между верхней и средней палубами в целях уменьшения разрушительного воздействия осколков при взрыве снарядов и, как следствие, могущего возникнуть задымления помещений нижних палуб.