Но не только авиация угрожала японским кораблям, по их следам шли тяжелые артиллерийские корабли, а для перехвата была развернута завеса из подводных лодок. В 17 ч 32 мин командир американской подводной лодки "Хэллибат" (SS-232), осматривая горизонт в перископ, обнаружил характерные "пагодообразные" надстройки японского линкора. Лодка начала маневрировать для занятия позиции. В 18 ч 43 мин был произведен шеститорпедный залп из носовых аппаратов, но ни одна из торпед не попала в цель.
В 19 ч 43 мин флаг адмирала Одзавы был перенесен на крейсер "Ойодо", командующий японским соединением принял решение со всеми оставшимися в строю артиллерийскими кораблями идти назад, чтобы прикрыть отход поврежденных кораблей и, если представится возможность, вступить в артиллерийский бой. Корабли пошли на юг со скоростью 10 узлов.
В 23 ч соединение снова было обнаружено лодкой "Хэллибат", но на этот раз позицию для атаки занять не удалось.
В 23 ч 30 мин адмирал Одзава, понимая, что прикрывать уже некого, приказал идти в Амами-О-Шима. В это время было зафиксировано два контакта с вражескими подводными лодками, но они не смогли занять позицию для атаки.
"Цена успеха эскадры-приманки адмирала Одзавы была очень высокой — все четыре авианосца, один из трех крейсеров и два из восьми эсминцев были потоплены. Но задача была выполнена: огромный флот Хэлси был отвлечен на север, пролив Сан-Бернардино остался неохраняемым и хищные когти адмирала Куриты нависли над беспомощными десантными кораблями, сгрудившимися в заливе Лейте." [3]
День 26 октября прошел спокойно, хотя сигнальщикам постоянно мерещились перископы и следы торпед. 27 октября корабли прибыли в бухту Сакава на о. Амами-О-Шима. Одзава перенес свой флаг на более соответствующий статусу корабль — линкор "Хьюга". 28 октября корабли 4-й дивизии пополнили запас топлива и вышли в море, сопровождаемые эсминцами, взяв курс на метрополию. В 21 ч 20 мин японские корабли были атакованы вражеской подлодкой "Си Дог" (SS-401, командир капитан-лейтенант В. Т. Лоуренс). Ни одна из шести торпед в цель не попала.
29 октября "Исе" и "Хьюга" были обнаружены подводной лодкой "Стерлет" (SS-392), но ей не удалось занять позицию для атаки. В этот же день в проливе Бунго соединение столкнулось с американскими подводными лодками "Бесуго" (SS-321) и "Ронквил" (SS-396), но им не удалось занять позицию для атаки и пришлось ограничиться передачей радиограммы о своем месте.
Кормовая оконечность линкора "Исе" с установленными на ней катапультами и гидросамолетами
Поздним вечером 29 октября соединение прибыло в Куре. В период с 29 октября по 8 ноября на "Исе" сняли две катапульты, это было сделано для увеличения угла обстрела из башен №3 и №4. В это же время на "гибридов" грузили и войска и технику для доставки в Манилу.
8 ноября корабли 4-й дивизии авианосцев вышли в море, сопровождаемые 1 эсминцем и 2 эскортными миноносцами. Когда они приближались к точке назначения, им было приказано идти на остров Спретли, так как Манилу каждый день бомбила вражеская авиация и заход в порт скорее всего закончился бы гибелью кораблей. 16 ноября Мобильный флот был расформирован, оба линкора-авианосца остались по-прежнему в составе 4-й дивизии авианосцев, но уже Второго флота. Остальные два корабля, "Дзунье" и "Рюхо", входившие ранее в это соединение, были переведены в 1-ю дивизию авианосцев Объединенного флота.
16 ноября соединение прибыло в пункт назначения, и сразу же началась выгрузка войск и техники. Но после выгрузки оба линкора-авианосца продолжили стоять на рейде. Сопровождавшие их эскортные миноносцы вошли в состав соединения вице-адмирала Т. Куриты, совершавшего переход из Брунея в Куре.
19 ноября 1944 г. на рейд прибыли линкор "Харуна", тяжелые крейсера "Ашигара" и "Хагуро", легкий крейсер "Ойодо". Из Манилы прорвались 4 эсминца, на одном из них находился командующий 5-м флотом вице-адмирал К. Шима. Вскоре его флаг был поднят на крейсере "Асигара".
20-22 ноября флот совершил переход на якорную стоянку Линнга Роудз, в окрестностях Сингапура. Затем 12 декабря японское соединение: "Исе", "Хыога" "Асигара", "Ойодо" перебазировались в Камрань. Там они пополнили запас топлива, и ждали возможности атаковать вражеский конвой, идущий на Минданао. 14 декабря их обнаруживает на якорной стоянке подводные лодки "Бэшоу" (SS-241) и "Гуавина" (SS-362), но занять позицию для атаки им не удалось.
В этот же день адмирал Шима перенес флаг на "Хыогу". 17 декабря американская субмарина "Минго" (SS-261) обнаружила неприятельское соединение в бухте Камрань, но выйти в атаку не смогла. 18 декабря "Исе" и "Хыога" перебираются на якорную стоянку у мыса Жак. 28 декабря к "гибридам" присоединились "Асигара" и "Ойодо", которые до этого обстреляли американский плацдарм у Сан Хосе на острове Минданао. 30 декабря командованию Императорского флота стало ясно, что атаковать вражеский конвой не удастся и корабли были "оттянуты" в базы.