Летом 1940 года у литовцев не было лидеров, чувствующих ответственность перед историей. В стране не было сил, способных повести нацию за собой в борьбе за защиту независимости. Как правящий националистический союз, так и оппозиция, состоящая из христианских демократов, крестьян-популистов или социал-демократов, не смогли подняться над фракционными интересами. Политическое руководство страны разделило ответственность за позорную капитуляцию с генералами. Военные, к сожалению, даже не пытались защитить страну. Более того, существуют обоснованные сомнения относительно того, был бы выполнен такой приказ. 15 июня командир 7-го полка, дислоцированного в Таураге, полковник Антанас Бреймелис, получив приказ Президента от министра обороны Мустейкиса оказать сопротивление русским хотя бы символическое, ответил: «Господин министр, я этого не сделаю». И он этого не сделал! Утром 16 июня генерал Казис Таллат-Келпша остановил марш 9-го полка в направлении границы с Германией и отправил его обратно в Мариямполе. (Существует еще одна версия этого инцидента. Предположительно, 9-й полк был направлен для прикрытия отхода президента и после выполнения задачи вернулся к месту своей дислокации.)
Два дня спустя, 17 июня, Советы оккупировали Латвию и Эстонию. Прибалтийские государства капитулировали одно за другим.
Народное правительство
Одной из важнейших задач Деканозова, специального представителя правительства СССР, прибывшего в Каунас вечером 15 июня 1940 года, было создание марионеточного правительства, которое служило бы прикрытием для коммунистического господства и подготовки к аннексии страны. Из сотрудников советского посольства, вновь прибывших сотрудников Народного комиссариата внутренних дел (НКВД), командиров гарнизонов Красной Армии и членов Центрального комитета Коммунистической партии Литвы (ЦК ЛКП) была сформирована специальная группа, которая занималась вопросами формирования и функционирования правительства и давала указания прессе. Самым важным советником Деканозова при формировании нового правительства был советский посланник в Каунасе Н. Поздняков; он был хорошо осведомлен о местной жизни и лично знал многих общественных деятелей и интеллектуалов. Мнение лидеров LCP также было услышано.
«Курс» Кремля летом 1940 года в странах Балтии был направлен не на «социалистическую революцию», а на видимость законности: весь процесс оккупации и аннексии Литвы проводился при формальном соблюдении Конституции 1938 года и других правовых актов Литовской Республики. Таким образом, особенно в начальный период, наибольшую помощь оккупантам в странах Балтии оказывала не местная коммунистическая партия, которая изначально держалась в стороне (Коммунистический интернационал запретил ей проводить митинги и демонстрации до 24 июня), а политики законного правительства, которым доверял народ, общественные деятели и интеллектуалы. К сожалению, летом 1940 года в Литве было много таких людей.
17 июня 1940 года исполняющий обязанности президента Меркис послушно выполнил инструкции Деканозова и подписал два акта подряд. Первым актом было назначение Юстаса Палецкиса премьер-министром, и на него также была возложена задача формирования Совета министров; вторым актом было утверждено следующее новое правительство:
Юстас Палецкис — премьер-министр.
Винкас Креве-Мицкявичюс — заместитель премьер-министра и министр иностранных дел.
Генерал Винкас Виткаускас — министр обороны.
Повилас Пакарклис — министр юстиции.
Эрнестас Гальванаускас — министр финансов.
Матас Мицкис — министр сельского хозяйства.
Леонас Коганас — министр здравоохранения.
Народное правительство Литвы. 17 июня 1940 года.
18 и 19 июня Палецкис подписал акты о назначении писателя Антанаса Венцлова министром образования и Мечисловаса Гедвиласа министром внутренних дел. Гедвилас был первым членом Коммунистической партии в так называемом Народном правительстве. Антанас Снечкус, который только что вышел из тюрьмы, стал директором Департамента государственной безопасности. Опыт, накопленный Советами в 1940 году в странах Балтии, был использован после Второй мировой войны при советизации стран Восточной и Центральной Европы — в этих странах коммунисты также сначала захватили Министерство внутренних дел.
После утверждения так называемого Народного правительства во главе с Палецкисом Меркис немедленно подал в отставку, и, опять же согласно Конституции Литвы, Палецкис вступил в должность президента Литвы, а Креве-Мицкявичюс стал премьер-министром. Палецкис и члены правительства принесли присягу на Конституции страны и обязались защищать независимость Литвы. Они также возложили венок к могиле Неизвестного солдата, символизирующий борьбу за независимость. Эти действия должны были продемонстрировать желание правительства защищать суверенитет страны. 19 июня Палецкис выступил с речью, текст которой был согласован с офисом Деканозова и секретариатом Центрального комитета Коммунистической партии Литвы. Чтобы успокоить общественность, было заявлено, что правительство будет поддерживать конституционный порядок Литовской Республики, сохранять суверенную власть и проводить независимую политику. Подобные заявления должны были создать иллюзию, что правительство будет самостоятельно проводить демократические политические реформы. Так называемое Народное правительство состояло в основном из демократически настроенных интеллектуалов, которые не принадлежали ни к одной партии, и людей, связанных с популистским крестьянским союзом. Большинство министров были хорошо известны общественности. Палецкис был бывшим активистом популистского крестьянского союза, журналистом и писателем (редактор журналов «Науясис жодис» и «Лайко жодис» и автор таких книг, как «Паскутинис карас» («Последний царь»), «ССРС мусу акимис» («СССР нашими глазами») и др.); Креве-Мицкявичюс был бывшим националистом, профессором гуманитарного факультета Университета Витаутаса Великого и, возможно, самым популярным литовским писателем; Гальванаускас бывший ректор Клайпедского коммерческого института, несколько раз был министром правительства, даже премьер-министром и министром финансов в правительстве Меркиса; Дивизионный генерал Виткаускас был солдатом-добровольцем, командующим армией, который в октябре 1939 года был назначен Сметона был командиром Вильнюсского армейского корпуса, который вошел в Вильнюс 28 октября; а Пакарклис был бывшим активистом-националистом, позже сторонником Вольдемараса, юристом и историком. Еврейская община Литвы была довольна тем, что впервые с 1923 года (когда было упразднено Министерство по делам евреев) их соотечественник врач Л. Коган стал членом правительства. М. Гедвилас выделялся среди других: до 1931 года он был членом популистского крестьянского союза, а позже — идейным литовским сознательным большевиком, умным, активным, неоднократно судимым за антигосударственную деятельность, редактором «Жемайтис» и других газет. В 1931 году он был избран директором Фонда помощи пациентам Тельшяйского района.
Однако ни литовское общество, ни полиция государственной безопасности не знали о закулисной жизни многих «народных» министров. Креве-Мицкявичюс, автор патриотических произведений, с 1924 года сотрудничал с советским представительством в Каунасе (а также с сотрудниками советской разведки, которые работали с дипломатическим статусом). В то время он думал, что для Литвы было бы лучше присоединиться к Советскому Союзу, где литовский народ имел бы безопасную жизнь и культурную автономию. Начиная с конца 1920-х годов, Палецкис предоставлял ценную информацию представительству Советского Союза и получал от него деньги за публикации. 18 сентября 1939 года, когда Красная Армия приближалась к Вильнюсу, Палецкис и Креве-Мицкявичюс посетили миссию и попросили посланника Позднякова направить Красную Армию в Каунас. Несколько дней спустя Людас Гира, председатель Союза писателей Литвы и будущий заместитель министра образования Народного правительства, посоветовал советскому послу не передавать Вильнюс Литве, потому что «чем ближе советско-литовская граница, тем лучше для литовской нации». Таким образом, в состав Народных правительств стран Балтии входили люди, которые не были выбраны случайным образом, а были хорошо проверенными сторонниками советского режима. Гальванаускас был, пожалуй, единственным случайным человеком в правительстве.