Войска Красной Армии убегают из Литвы 22 июня 1941 года.
Поскольку немецкая армия еще не вошла в Тельшяй, 24 июня руководители Тельшяйского НКГБ в сопровождении подразделения Красной Армии по возвращении в город отобрали из тюрьмы 76 политических заключенных. Существует мало информации о том, что произошло позже. Вероятно, это единственная резня в Литве, у которой не осталось выживших свидетелей. Только 28 июня, после того как было найдено и раскопано массовое захоронение, стало ясно, что все заключенные были садистски замучены до смерти. Акция, проведенная в Концлагерь Правенишкес отличался от других мест массового уничтожения не только своими размерами, но и тем, что были казнены все заключенные без исключения и даже тюремные надзиратели со своими семьями (они были литовцами). Вооруженные пулеметами и автоматическими винтовками солдаты Красной Армии расстреляли всех заключенных, когда их выгоняли из казарм. Погибло около 230 человек.
Небольшие группы заключенных вместе с другими гражданскими лицами были убиты в других местах Литвы. Коллаборационисты (советские и партийные активисты) убили десятки людей, которые были прямо обозначены как не лояльные или враждебные Советам. Из 672 убитых красноармейцев погибло 518 человек. Всего было совершено почти сорок групповых убийств.
Убитые заключенные в Правенишкесской исправительно-трудовой колонии 26 июня 1941 года.
Политические заключенные Тельшяя, жестоко замученные 25 июня 1941 года в Рейняйском лесу.
Убитые рабочие Паневежисского сахарного завода. 24 Июня 1941 года.
22 июня 1941 года убиты советскими войсками священники Вилкавишкисского района: Юстинас Дабрила, Вацловас Бальсис и Йонас Петрикон.
Устремления дипломатической службы Литвы в 1940-1941 годах
Литовская дипломатическая служба (СПД) — единственное официальное учреждение независимой Литвы, которое никогда не подчинялось советской системе и продолжало свою деятельность без перерывов с 1918 года. К сожалению, вся структура LDS не сохранилась — продолжали работать только некоторые посольства и консульства Литвы на Западе. Судьба литовских посольств и дипломатов зависела от преобладающего политического отношения к странам Балтии в государстве, где присутствовала СПД, и от ее отношений с Советским Союзом. В течение всего периода оккупации Литвы СССР посольства Литвы продолжали свою работу в США, Ватикане и Великобритании, поскольку эти страны придерживались политики непризнания оккупации и аннексии государств Балтии. Литовский дипломатический персонал на Западе, сохранивший дипломатический иммунитет, и легально действующие посольства продолжали свою дипломатическую деятельность в изгнании, они подняли вопрос о свободе Литвы на международной арене.
Согласно данным справочника Министерства иностранных дел Литвы за 1939 год, на 1 января того же года в Литве было 15 посольств, восемь генеральных консульств, семь почетных генеральных консульств, шесть консульств, 33 почетных консульства и шесть почетных вице-консулов в Европе, Америке, Азии и Африке.
После 1940 года СПД официально сохранила прежний статус своих посольств и дипломатов из-за позиции многих стран (США, Великобритании, Ватикана и в течение некоторого времени Аргентины, Бразилии и Швейцарии), которые отказались признать грубое нарушение международного права. Главной целью деятельности литовских дипломатов было как можно скорее восстановить независимость Литвы. Литовские дипломаты, стремясь достичь этой цели, пытались найти какие-то средства для создания литовского правительства в изгнании на Западе, но ни одно иностранное государство не было готово признать такое правительство.
Накануне заседания Народного сейма Стасис Лозорайтис, впервые используя свои полномочия главы LDS, распорядился по телефону, чтобы литовские дипломаты, проживающие за границей, выразили протест против включения Литвы в состав СССР. 21 июля 1940 года литовские дипломаты направили ноты протеста большинству правительств стран, где они были аккредитованы. Казис Шкирпа был первым литовским дипломатом, который представил свой протест на имя Иоахима фон Риббентропа, имперского министра по иностранным делам (22 июля Шкирпа вручил ноту протеста доктору Эрнсту Ворманну, главе политического отдела Министерства иностранных дел Германии, но 24 июля Ворман вернул оригинал протеста из-за желания Германии не портить свои дружеские отношения с Москвой). Чуть позже, с 22 июля по 4 августа, свой протест представили другие дипломаты: Стасис Гирдвайнис в Ватикане, Стасис Лозорайтис в Италии, Казис Граужинис в Аргентине (он также выразил свой протест министрам иностранных дел Уругвая и Бразилии, а также дипломатическим представителям других стран Латинской Америки), Бронюс Казис Балутис в Великобритании, доктор Юргис Шаулис в Швейцарии, Эдуардас Тураускас в Румынии и Югославии, Витаутас Йонас Гилис правительствам Швеции и Дании, Повилас Жадейкис в США и Петрас Климас правительствам Франции (правительство Виши) и Португалии. Климас не подавал протест правительствам Бельгии и Люксембурга, потому что после оккупации Германией этих государств их правительства уехали за границу. 21 июля-1 августа литовские послы (кроме Климаса) направили телеграммы протеста также в Литву.
Казис Шкирпа (в середине) покидает посольство Литовской Республики в Берлине. 14 августа 1940 года.
Первая встреча дипломатов после оккупации Литвы в посольстве Литвы при Святом Престоле. Слева сидят: Петрас Климас, Казис Шкирпа, Стасис Лозорайтис, Эдуардас Тураускас и Стасис Гирдвайнис. Рим, 20 сентября 1940 года.
Вскоре начались ответные действия Советской Литвы против СПД: послы были лишены литовского гражданства и дипломатического статуса; им было запрещено возвращаться в Литву; их имущество было конфисковано, и предпринимались попытки закрыть представительства и завладеть их имуществом. Прямое давление на СПД преследовало простую цель: ликвидировать законные остатки ныне несуществующего государства за рубежом. Juozas Юргинис, директор политического департамента Министерства иностранных дел, по приказу министра иностранных дел пытался ликвидировать посольство Литвы в Швейцарии, стране, не имеющей дипломатических отношений с СССР, — закрыть посольство в Берне и отозвать постоянную делегацию Литвы при Лиге Наций. Однако ему не удалось убедить литовских дипломатов передать ему все имущество и архивы дипломатических представительств. Посольство Литвы в Берне и представительство Литвы в Лиге Наций официально функционировали до 1946 года. После неудачи в Швейцарии Юргинис отказался ехать в Рим, чтобы закрыть посольства Литвы при итальянском правительстве и Святом Престоле.