Осень — прибытие в Петербург второго профессора химии У. М. Сальхова.
1757, январь — выход в свет «Российской грамматики». Сочинение «Гимна бороде».
1 марта — назначение советником Академической канцелярии. В ведение Ломоносова попадают Академическое собрание, университет, гимназия и Географический департамент.
26 марта — доклад Синода императрице по поводу «Гимна бороде».
Март — начало публикации собрания сочинений Ломоносова в Москве.
Август — труд «Рассуждение о большей точности морского пути».
6 сентября — выступление со «Словом о рождении металлов трясением земли».
Сентябрь — октябрь — переселение в собственный дом, отстранение от дел в химической лаборатории. Поправки к «Истории Российской империи при Петре Великом» Вольтера. Пишет для Вольтера «Описание стрелецких бунтов» и «Сокращенную историю самозванцев».
1758, январь — завершение диссертаций «Об отношении количества материи и веса» и «Физическая задача о ночезрительной трубе».
Весна — лето — предложение оформления Петропавловского собора мозаичными панно. Завершение первого тома «Российской истории». Написание «Предисловия о пользе книг церковных в русском языке». Дискуссия с Эпинусом о проекте ночезрительной трубы.
Октябрь — выход первого тома собрания сочинений Ломоносова после полуторагодовалой задержки.
1759 — возобновление университетских занятий, прерванных в середине 1750-х годов. Хлопоты об официальной «инавгурации» Санкт-Петербургского университета. Рассылка опросных листов в российские города и попытка организации экспедиции с целью уточнения широты и долготы географических пунктов в статусе начальника Географического департамента. Переделка отозванной из типографии подготовленной к печати «Древней российской истории».
1760 — подготовка и выпуск «Краткого российского летописца».
Начало года — перевод «Оды к счастию» Ж. Б. Руссо в соревновании с Сумароковым, инициированным И. И. Шуваловым.
Апрель — аббат С. Лёфевр произносит в доме Строганова неприятную для Ломоносова речь. Столкновение с бароном А. С. Строгановым. А. П. Шувалов произносит и публикует новую речь, превозносившую Ломоносова. Избрание членом Шведской королевской академии.
Июль — отправление в Шведскую королевскую академию «Рассуждения о происхождении ледяных гор в северных морях».
1761 — выход первой песни «Петра Великого».
Январь — столкновение с Сумароковым в доме Шувалова, неудачные попытки Шувалова примирить поэтов.
Май — конфликт с Эпинусом из-за подготовки к наблюдению за прохождением Венеры через диск Солнца.
26 мая — наблюдение «явления Венеры на Солнце».
4 июля — публичный академический акт, где Ломоносов произносит «Слова о явлении Венеры на Солнце».
1 ноября — записка Шувалову «О сохранении и размножении российского народа».
25 декабря — смерть Елизаветы Петровны.
1762, начало года — возглавляет Фарфоровую мануфактуру. Создание оды Петру III.
Февраль — апрель — первый приступ тяжелой болезни.
Апрель — ведение метеорологических наблюдений.
Июнь — подготовка речи «О катадиоптрической трубе».
28 июня — государственный переворот.
Июль — сочинение оды новой императрице Екатерине II. Обострение болезни. Успехи Тауберта и других недругов Ломоносова. Прошение об отставке. Изменение намерений после визита Ф. Г. Орлова. Ходатайство о повышении в чине.
Осень — новый приступ болезни, несколько месяцев в постели.
1763, январь — возвращение к работе в академии. Передача Географического департамента в ведение Миллера.
Март — отказ от посещений Академического собрания после конфликтов с Миллером и Таубертом.
Май — указ (сразу же отозванный обратно) об отставке Ломоносова с чином статского советника.
Июль — август — возобновление работы в академии. Участие в обсуждении проекта «Карты российских продуктов». Предлагает издание «Экономического лексикона».
20 сентября — представление в Морское ведомство «Краткого описания разных путешествий по Северным морям и показание возможного проходу Сибирским океаном в Восточную Индию».