На начальном этапе религиозных распрей она пыталась играть роль женщины-миротворицы - хотела объединить страну и отчаянно старалась сохранить равновесие между двумя враждующими группировками, умело маневрируя между католическими и протестантскими лидерами, не позволяя ни той, ни другой группировке отнять у неё влияние на коронованных отпрысков.
Благодаря своему уму, ещё в пятнадцатилетнем возрасте, Екатерина смогла всё же расположить к себе короля Франциска (отца своего будущего мужа) и его ближайшее окружение, включая королеву, королевскую фаворитку, сестру короля и его дочерей. Ко французскому двору она привнесла такие новшества, как женское боковое седло и панталоны, активно внедряла духи. Она же - слушала, обучалась, наблюдала, разделяя любовь короля к охоте, искусству - в последующие годы она слыла страстной коллекционеркой, собирая шахматы, миниатюрные бильярдные столики и другие игрушки, помогавшие скоротать время в непогоду, прекрасные коллекции фарфора, венецианского стекла и эмалей, памятки прошедших дней, соседствовали с дорогими сердцу вещами, куклами в разнообразных одеяниях и сентиментальными безделушками, на книжных полках выстроились любимые литературные произведения, тексты, посвященные покойному мужу, фолианты по строительству, генеалогические древа ее родственников по материнской линии, графов Булонских, книги с описанием игр и прочее, среди них были и древние, в том числе даже несколько папирусов, и современные. Эти две коллекции составили впоследствии основу для нынешней Национальной библиотеки Франции. Екатерина первая при дворе начала пользоваться складным веером, свисавшим с ленты, прикрепленной к поясу, и богато укрaшенным. Эта вещь, впоследствии, стала излюбленной в Англии. А еще она внедрила носовые платки, и это новшество придворные весьма полюбили, а платок стал неотъемлемым аксессуаром ренессансного костюма. Впервые платки начали делать в Венеции, они считались предметом роскоши, рaзрешенным только для знати. Екатерина собрала огромную коллекцию декоративных платочков; их полагалось держать за серединку, демонстрируя расшитые края. По прямому назначению использовали лишь простые кусочки льна, остальные же играли чисто декоративную роль.
Для неё же был создан образ этакой коварной злодейки-паучихи в черном, искусно плетущей свои кровавые интриги. Однако, в приписываемом ей отравлении матери своего будущего зятя, Генриха Наваррского - Иоанны/Жанны Наваррской её вина вряд ли присутствует - вскрытие показало, что королева страдала легочным заболеванием. Договор о браке Генриха и дочери Екатерины, принцессы Маргариты, уже был подписан - эта смерть уже ни чего не решала.
Мягко, но уверенно, словно играючись, она устранила от дел вдову старшего сына - Марию Стюарт - будущую королеву Шотландии, и слабовольного Антуана Бурбона - формального лидера французских протестантов, который, хоть, иногда и причинял Екатерине некоторое беспокойство, серьезным противником она его, конечно же, не считала. А вот сын его Генрих, повзрослев, станет опасной угрозой трону Валуа. Дерзкий и энергичный, он совершал хитроумные провокации, избегая ловушек. Как тут было не тревожиться королеве-матери, если пророчества предсказателей открыли ей - этот мальчишка будет править Францией после ее сыновей! С тех пор Генрих Наваррский стал самым страшным из кошмаров Екатерины...
Самое известное масштабное кровопролитие, с которым связывают имя королевы-матери - убийство французских протестантов в Париже в августовскую ночь в праздник Дня Святого Варфоломея.
Дабы попытаться примирить католиков и протестантов, заодно и держать ближе к себе того, кто стал для неё живым напоминанием самого ужасного пророчества в её жизни, подчинить его своему влиянию в надежде отвести кошмарное предсказание от её семьи. Это объединило бы старшую и младшую ветви королевской семьи и стало бы настоящим маяком надежды на будущий мир в королевстве. Разве в былые времена брак Елизаветы Йоркской и Генриха Тюдора не положил конец английским войнам Алой и Белой Розы? Быть может, то же самое произойдет и во Франции? Кроме того, у этого союза было еще и другое привлекательное качество: если Генрих Бурбон и унаследует трон Франции, кровь династии Валуа и Медичи сохрaнится в потомстве Марго и останется у власти.
Массовая резня не могла положить конец жгучим религиозным проблемам, a вот убийство избранных личностей лишило бы еретиков их вождей, кроме того, таким образом, Екатерина могла одним ударом избавиться от большинства своих врагов, под благовидным предлогом бракосочетания своего вождя, собравшихся в Париже со всех концов королевства, стравив две могущественные враждующие группировки: гугенотских лидеров и ревностных католиков под предводительством знатного семейства Гизов, не раз намекавших о своих притязаниях на престол её детей.