Еще более 20 лет назад о микробиоте практически никто не говорил. О ней не преподавали в университетах, врачи не обсуждали с коллегами ее влияние на организм и не рассказывали на своих приемах о ней пациентам. За последние 10 лет микробиота стала обсуждаема за пределами узкого круга специалистов. Перед тем как углубиться в философские рассуждения, было принято познакомить заинтересованного читателя с базовыми понятиями и открытиями, которые повлияли и вдохновили меня на написание этой книги.
Начнем с главных определений.
Так что же это такое — «МИКРОБИОТА»:
Микробиота — это эволюционно сложившееся сообщество разнообразных микроорганизмов, населяющих открытые полости организма человека, определяющее биохимическое, метаболическое и иммунологическое равновесие макроорганизма. Микрофлора (микробиота) — собирательное название микроорганизмов, находящихся в симбиозе с человеком.
Термин «микробиота», обозначающий нормальную микробиоту высших организмов, был впервые опубликован в монографии Т. Rosebury «Microorganisms Indigenous to Man» в 1962 г. В настоящее время данное название микроорганизмов- обитателей человеческого организма — полностью принято в современной литературе [1–3].
Значительная часть (более 60 %) микрофлоры заселяет различные отделы желудочно-кишечного тракта, примерно 15 % приходится на ротоглотку, на урогенитальный тракт — 11 %(из них на вагинальный отдел — 9 %), 14 % — на кожные покровы [6].
Рассмотрим тезисно кишечную микробиоту и микробиоту кожи.
Кишечная микробиота, в основной своей массе обездвиженная в структуре биопленок становится сложной метаболической системой пищеварения в симбиозе, выполняющей многие взаимополезные функции, обусловленные её ферментативной активностью и способностью активировать реакции врожденного иммунитета [2].
У людей, согласно современным данным, выявляют три типа кишечной микробиоты:
• Prevotella-enterotype
• Bacteroides-enterotype
• Ruminecoccus-enterotype
В результате исследований, опубликованных в журнале Nature в 2011 году, выявлена взаимосвязь между численностью каждого таксона бактерий и характером питания людей.
Так, энтеротип Prevotella-enterotype чаще встречается у вегетарианцев и жителей сельской местности — типичный для лиц с углеводной диетой. Энтеротип Bacteroides-enterotype доминирует у мясоедов и любителей восточной кухни. Их пища обогащена белками, аминокислотами, насыщенными жирными кислотами. Третий энтеротип — Ruminecoccus-enterotype, встречается у людей со сбалансированным разнообразным питанием. При этом энтеротипы могут переходить из одного в другой.
Микробиота кишечника способна влиять на работу сердечно-сосудистой системы, желудочно-кишечного тракта, повышать риск развития сахарного диабета, ожирения, бронхиальной астмы, аллергий, оказывать влияние на работу мозга, пищевого поведения, связана с поведенческими нарушениями. Микробиота способна воздействовать на работу гормонов, нервной и иммунной системы — например, эффективность терапии при некоторых онкологических заболеваниях сильно зависит от того, как на неё реагирует микрофлора кишечника.
Микробиота кожи имеет свои особенности, которые еще недостаточно изучены на сегодняшний день. В этой главе рассмотрим только состав микрофлоры кожи.
На коже взрослого здорового человека определяются 19 таксономических рангов (филов) микроорганизмов. Большинство бактерий кожи относятся к четырем из них: Actinobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes и Proteobacteria. Эти же филы доминируют и на слизистой полости рта и желудочно-кишечного тракта (ЖКТ), однако их пропорции отличаются от таковых на коже. Так, количество Actinobacteria больше на коже, в то время как в ЖКТ превалируют Firmicutes и Bacteroidetes. Общей чертой микробных сообществ кишечника и кожи, по-видимому, является небольшое количество филов, но высокое разнообразие на уровне видов [9-15].
Метагеномный анализ показал, что Staphylococcus и Corynebacterium spp. — организмы, наиболее обильно колонизирующие влажные участки кожи, такие как область пупка, подмышечные впадины, паховая складка, межъягодичная складка, подошва стопы, подколенная ямка, область локтевого сгиба. Стафилококки занимают аэробную нишу на коже и, вероятно, используют мочевину, присутствующую в составе пота, в качестве источника азота [16, 17, 18, 19, 20, 21].
На сухих участках кожи (например, предплечьях, кистях) определяется наибольшее разнообразие микроорганизмов из филов Actinobacteria, Proteobacteria, Firmicutes и Bacteriodetes [20, 21, 22]. Удивительной особенностью микробиоты этих участков является обилие грамотрицательных микроорганизмов, хотя ранее считалось, что они колонизируют кожу редко, попадая из ЖКТ [23, 24].