На здоровой коже также были определены микроорганизмы, не относящиеся к бактериям: грибы (род Malassezia составляет 53–80 % от общей популяции грибов) [25], клещи Demodex folliculorum и Demodex brevis (колонизация указанными микроорганизмами особенно увеличивается в областях, богатых сальными железами) и комменсальные вирусы [26].
Наиболее многочисленными резидентными группами микроорганизмов кожи являются пропионовые бактерии (грамположительные палочки), стафилококки и дрожжи рода Malassezia. Баланс этих микроорганизмов на коже является условием благополучия данной экосистемы, тогда как отклонение от нормы носительства ведет как к развитию различных кожных заболеваний, так и манифестации болезней, исходно протекавших субклинически. Изменение баланса нормофлоры ассоциировано с развитием кожных заболеваний [27].
О МИКРОБИОМЕ
Лауреат Нобелевской премии J. Lederberg в 2001 году предложил термин «микробиом» для обозначения всего генетического материала, содержащегося в микробиоте кишечника человека [3]. Численность генов «микробиома» значительно выше, чем собственных генов организма человека, что послужило основанием рассматривать совокупность всех микроорганизмов в качестве «суперорганизма» или "надорганизма" [4].
Установлено, что масса нормальной микробиоты кишечника взрослого человека составляет 2,5–3,0 кг численностью 1014 клеток это на порядок превышает количество наших собственных клеток. Основная микробная популяция обитает в толстом кишечнике, затем идет кожа (104–106 на см2), конъюнктива глаза, верхние дыхательные пути и влагалище. Подсчитано, что общий геном обнаруживаемых в ЖКТ бактерий, обозначаемый термином «микробиом», составляет 600 000 генов, что в 24 раза превышает размер генома человека, насчитывающего 25 000 функционирующих генов [5].
По результатам генетического анализа биоматериала было установлено, что в человеческом организме обитает свыше 10 тыс. видов различных микробов. Так, если в геноме человека содержится 22 тыс. генов, кодирующих белки для регуляции метаболизма, микробиом добавляет еще около 8 млн уникальных бактериальных генов [7].
Рис. 1 Значение микробиома в жизни человека
Как показал проект «геном человека», люди практически идентичны в своем генетическом составе, однако небольшие различия в ДНК порождают огромное фенотипическое разнообразие среди населения. Напротив, метагеном микробиоты человека ‒ суммарное содержание ДНК микробов, обитающих в организме человека, ‒ гораздо более изменчив, причем только одна треть его составляющих генов обнаружена у большинства здоровых людей. Понимание этой изменчивости в «здоровой микробиоте» стало серьезной проблемой в исследованиях микробиоты начиная с 1960-х годов [8].
ИНТЕРЕСНЫЕ ФАКТЫ…
Одно из первых и важнейших сообщений о роли микробиоты кишечника в чувствительности к инсулину и регуляции массы тела было сделано после того, как мыши, выращенные в стерильных условиях, примерно на 60 % увеличили свой вес в ответ на введение микробиоты обычно выращенных мышей. Этот феномен сопровождался увеличением содержания жира в организме. Более того, возникновение резистентности к инсулину и непереносимость глюкозы наблюдались в течение 14 дней даже при снижении потребления пищи, что дало доказательства того, что сообщество бактерий каким-то образом контролирует энергетический метаболизм. Было также показано, что устойчивость к развитию ожирения мышей, 95 выращенных в стерильных условиях, связано с активацией окисления жирных кислот и увеличением расхода энергии. Даже при поступлении высококалорийной пищи мыши, выращенные в стерильных условиях, сохраняли свой вес в пределах нормы [28, 29]. Чтобы продемонстрировать, что измененный состав микробиоты кишечника является причиной, а не следствием ожирения или измененных привычек питания, микробиота от мышей с ожирением трансплантирована мышам со стерильным кишечником. Через 2 нед мыши-реципиенты «тучной микробиоты» экстрагировали больше калорий из пищи и стали прибавлять в весе больше, чем мыши, которым была осуществлена пересадка микробиоты от животных с нормальной массой тела [30]. Эксперименты на животных в целом согласуются с исследованиями на людях.
***
В августе 2014 года судмедэксперт Гульназ Джаван из Алабамского государственного университета вместе с коллегами опубликовала первое исследование под названием «Thanatomicrobiome» (от греческого «танатос» — смерть). Пока мы живы, в большинстве наших внутренних органов нет микробов. Но, вскоре после смерти иммунная система перестаёт работать, и микробы свободно распространяются по всему телу. Начинается это, как правило, в кишечнике, на стыке между толстым кишечником и тонким. Затем бактерии проникают в капилляры пищеварительной системы и в лимфатические узлы, попадая вначале в печень и селезёнку, а потом в сердце и мозг. Исследования Джаван показали, что бактерии попадают в печень примерно через 20 часов после смерти и им требуется как минимум 58 часов для того, чтобы распространиться на все остальные органы, с которых брались образцы. По мере самопереваривания и распространения бактерий из пищеварительного тракта в трупе начинаются процессы разложения. Это «молекулярная смерть», то есть распад мягких тканей на газы, соли и жидкости. Разложение связано с тем, что в теле на смену аэробным бактериям, для размножения которых нужен кислород, приходят бактерии анаэробные, для жизнедеятельности которых кислород не требуется. Они питаются тканями организма и производят газообразные побочные продукты, такие как сероводород, метан и аммиак, которые скапливаются в теле.