Всего в 1901 г. на “Амуре” проведены следующие судовые учения и занятия: 10 пожарных тревог, 4 водяные тревоги с подведением штатного пластыря , 2 завода верпов, 16 учений по обучению гребле и постановке рангоута, 10 походов на шлюпках под парусами, 10 подготовительных упражнений при стрельбе из ружей и револьверов, 4 занятия по обучению разборке, сборке, чистке ручного оружия, 9 строевых учений и ружейных приемов, 10 занятий с рулевыми и сигнальщиками, 4 спуска водолазов, 12 уроков “занятия грамотностью” 2 стволиковые стрельбы, 3 учебно-боевые стрельбы. Во время стрельб было выпушено 105 47-мм и 40 75-мм снарядов, при стрельбе из ружей сделано 2430 выстрелов, поставлено 100 мин, из них неудачно встала только одна.{21}
Во время перехода “Енисея” из Кронштадта в Копенгаген наблюдались стук в цилиндрах высокого давления правой машины, нагрев головного подшипника цилиндра высокого давления и цилиндра низкого давления левой машины, течь правого холодильника (лопнула одна трубка). 20 августа 1901 г. на рейде Копенгагена собралась целая русская эскадра: императорская яхта “Штандарт”, эскадренный броненосец “Император Александр II”, крейсер I ранга “Светлана”, минные транспорты “Енисей” и “Амур”.
17 сентября 1901 г. командир “Енисея” Грамматчиков{22} доложил из Кадикса что: “Во время перехода Атлантическим океаном при сильном северо-западном ветре и океанской зыби в галфвинд, после израсходования большей части пресной воды, помещенной в междудонных отделениях и части угля транспорт обнаружил чересчур большую плавность в качке, так что казалось, что накренившись на один борт он как бы одно мгновение оставался в этом положении. После наполнения 5 междудонных отделений водою, что вместе с 3 наполненными пресной водой составило около 6000 пудов, качка стала несколько стремительней. Балтийский завод при уширении транспортов предполагал положить в междудонное пространство до 5000 пудов лекального балласта, но затем почему-то от этого отказался”.
21 октября “Енисей” попал в Средиземном морс в сильнейший шторм, крен достигал 60°, оголялись винты, зашкаливало креномеры. С изменением курса (против волны) качка уменьшилась, стала возможной 9-узловая скорость. Грамматчиков писал в рапорте, что “кормовые порта сделаны чересчур низко, транспорт даже на малом ходу садится на корму и при волнении в жилую палубу будет попадать много воды”{23}. При проходе Суэцким каналом корабль по вине лоцмана коснулся мели и погнул две лопасти правого винта; их пришлось заменить в Исмаилии.
Командующий отдельным отрядом судов в Средиземном морс 9 ноября 1901 г. докладывал в Петербург: “Оба транспорта в свежую погоду против ветра и в бейдевинд, держались прекрасно, попутным же ветром и в галфвинд качка была значительна и в машинах появлялся перебой. Опыт показал необходимость иметь водяной балласт до 300 т, без чего от одного только ветра транспорты кренились на 3-4“. Помещения для провизии и шкиперских запасов малы, рефрижератора нет”.{24}
В Бресте и Алжире французские власти предоставляли пресную воду бесплатно. В Алжире приняли 464 т угля, в Коломбо 200 т.
“Енисей” в бухте Элевзис поставил с плотика 10, стрелами на якоре - 2 и на ходу с плотика 90 мин. Опыт практических постановок выявил ряд недостатков минного вооружения транспортов. При качке подвешенные мины и якоря раскачивались и перекатывались по рельсам, плохо работало устройство открывания кормовых портов. Недостатки устранены силами личного состава во время похода. На переходе “Енисея” из Шанхая в Порт-Артур волной сбило два носовых вентилятора, повреждения были также исправлены судовыми средствами.
Всего за переход с “Амура” были положены в госпиталь три человека, с “Енисея” один, сбежали 2 матроса (матрос Валов остался в Сингапуре, Недиков в Сайгоне).
8 марта 1902 г. в Порт-Артур прибыл “Амур”, а через две недели (22-го) и “Енисей”, который 1 апреля зачислили в вооруженный резерв. Предполагалось при недостатке кораблей на Дальнем Востоке использовать весьма быстроходные транспорты кроме их прямого назначения и для крейсерской службы (после израсходования мин), а в мирное время как стационеры.
В связи с этим 24 марта “Амур” ушел в Порт Дальний и стал нести брандвахтенную службу, занимаясь там и боевой подготовкой. 9 апреля транспорт пришел в Порт-Артур, погрузил запас угля и вернулся в Талиенванский залив.