8 августа 1900 г. по приказанию Управляющего Морским министерством транспорты закончили кампанию и были введены в Петровский док в Кронштадте.
14 августа 1900 г. Крылов доложил в МТК результаты опытов на модели: скорость от уширения при той же мощности машин уменьшится на 0,3 узла с 17,5 до 17,2. В тот же день специальная комиссия произвела освидетельствование подводной части “Амура” (оба корабля уже стояли в Петровском доке) и пришла к выводу, что корпус может прослужить не менее 30 лет. Лишь боковые кили имели незначительные помятости.
16 августа началась расклепка обшивки; одновременно с переделкой бортов продолжались достроечные работы и внутренняя отделка. В целом ввод транспортов в строй задержался почти на год.
30 августа 1900 г. Ратник доложил в ГМШ, что работы по переделке образований бортов минных транспортов предполагается закончить к первым числам октября. В это же время ведутся и другие работы по окончании отделки транспортов, в течение октября можно будет закончить необходимые испытания и в ноябре выслать оба транспорта за границу.{18}
14 сентября 1900 г. Управляющий морским министерством приказал до 1905 г. не приступать к постройке 9-го броненосца, 4-го крейсера Балтийского моря, крейсера по проекту вице-адмирала С.О. Макарова, двух транспортов типа “Буг” и двух типа “Амур”, и до особого распоряжения отложить работы по броненосцу береговой обороны типа “Генерал-адмирал Апраксин”. В связи с этим в тот же день правление Балтийского завода было извещено об отказе постройки 3-го и 4-го транспорта типа “Амур”.
После выполнения работ по уширению корпуса все отсеки кроме помещений динамомашин и одной кочегарки испытывались в Кронштадте наливанием воды.
Минные транспорты типа “Амур". 1899 г. (Наружный вид и планы жилой палубы, трюма и платформ)
Минные транспорты типа "Амур". 1900 г. (Мидель-шпангоут после “уширения” корпуса)
“Енисей” начал кампанию 24 октября 1900 г. а 31 октября главный командир Кронштадтского порта вице-адмирал С.О. Макаров доложил в ГМШ, что испытания постановки мин с “Енисея” закончено и признано удовлетворительным, 11 ноября транспорт окончил кампанию.
По предложению изобретателя радио А.С. Попова каюту боцмана под полубаком переоборудовали в радиорубку. 26 июня 1901 г. “Енисей” вышел на 6часовые испытания полного хода. Так как машины развили суммарную индикаторную мощность на 426 л.с. ниже контрактной (4274 л.с.), испытания пришлось повторить позднее. Проба же “Амура” 9 июля прошла успешно (таблица), паровые котлы давали пар с избытком. Повторные испытания “Енисея” 16 июля складывались вначале неудачно: через 1,5 ч пришлось остановить машины для подтягивания мотылевого подшипника циркуляционной помпы, после чего обе машины в течение 5 ч работали нормально. “Енисей” развил максимальную скорость 18,1, “Амур” — 17,92 уз. Комиссия Кронштадтского порта определила остойчивость “Амура”, а через два дня “Енисея”; метацентрическая высота полностью готовых кораблей составила 0,79 и 0,73 м соответственно.
14 июня 1901 г. Управляющий морским министерством для скрытности назначения этих кораблей приказал в тех случаях, когда предвиделась надобность при переписке именовать на иностранном языке транспорты “Амур” и “Енисей” указывать что они “авизо”. В июле оба транспорта прибыли в Санкт-Петербург, где 21-го при спуске на воду эскадренного броненосца “Император Александр III” произвели салют.
1 августа 1901 г. состоялся высочайший смотр “Енисея” после чего оба транспорта стали спешно готовиться к переходу в Порт- Артур. Не смотря на то, что они должны были выйти в дальний поход одновременно, командиры получили приказание следовать раздельно. “Енисею” предстояло зайти в Бангкок и доставить нашему дипломатическому представителю новый секретный шифр.
До похода транспорты не имели возможности произвести учебные минные постановки. В связи с этим командир “Енисея” ходатайствовал о разрешении выполнить несколько практических постановок мин для обучения команды, в составе которой находилось 32 минных ученика на вакансиях штатных минеров, которых по комплекту должно быть 38.
“Енисею” разрешили задержаться на три недели в Поросе для практики личного состава в постановке мин и на одну неделю в Пирее. То же самое предписали в инструкции и “Амуру”, “чтобы предстоящие минные постановки транспортами в б. Порос велись с расчетом не возбуждать пререканий с местными властями и не могли привлекать внимания иностранцев”{19}.