5.3. Особые учреждения в церкви. Служением армейских и флотских священников руководят особые управления военного и военно-морского протопресвитеров при Синоде, но содержатся священнослужители армии и флота за казённый счёт.
Церковь имеет собственные учебные заведения — духовные семинарии и духовные академии.
Церковный суд по делам, связанным с вероучением и церковной дисциплиной, осуществляют епископы, экзархи и патриарх по совещанию с епархиальными советами и Синодом. Наказанием, в зависимости от тяжести содеянного, может быть церковная епитимья (исполнение молитвенных правил разной степени строгости, недопущение в течение некоторого срока до причастия и проч.), помещение в монастырскую тюрьму (обычно совмещаемое с епитимьей), помещение в монастырь со строгим уставом, временное или постоянное запрещение в служении, извержение из сана. В особых случаях может последовать анафема — отлучение от церкви с публичным о том провозглашением и проклятием.
5.4. Церковь и государство. В случае совершения преступления против законов государственных священнослужитель или монашествующий подлежит суду светскому. Извержение из сана и (или) отлучение от церкви в таких случаях может последовать как после приговора суда, так и до судебного заседания. Кроме того, светскими судами могут быть переданы церкви на заключение в монастырские тюрьмы осуждённые за государственные или уголовные преступления одарённые.
В особых случаях может быть наложено временное запрещение на совершение богослужений и треб на определённой территории или в отношении определённых категорий лиц. Впрочем, такая мера применялась в последний раз очень давно — во время мятежа Емельки Страхова на землях, где мятежники имели поддержку среди местных жителей, и немало способствовала подавлению мятежа.
5.5. Духовенство. Духовенство устроено, как и в нашем мире, и делится на белое (женатое) и чёрное (монашествующее).
На высшем уровне священства стоят архиереи — патриарх, митрополиты, архиепископы и епископы. Все архиереи — монашествующие.
Священники (протоиереи и иереи) возглавляют церковную жизнь в приходах и благочиниях. Могут представлять собою как белое, так и чёрное духовенство. Монашествующие священники — архимандриты (настоятели особо значимых монастырей), игумены (настоятели обычных монастырей), иеромонахи. Монашествующие священники, принявшие схиму (особо строгое монашество) — схиархимандриты, схиигумены и иеросхимонахи. В архиереи из схимников не выходят.
На низшей ступени священства стоят диаконы, каковые также могут относиться к белому (протодиаконы и диаконы) и чёрному (архидиаконы и иеродиаконы) духовенству.
Ниже диаконов стоят церковнослужители, помогающие при совершении таинств, но сами их не совершающие — алтарники, псаломщики и проч.
Признаками сословия духовенство обладает не в полной мере, потому что наследование приходов сыновьями священников является делом, хотя и нередким, но вовсе не обязательным.
5.6. Прочие христианские церкви. В отношениях с государством все христианские церкви подчиняются тем же правилам, что и Русская Православная, за некоторыми исключениями. Так, в армии и на флоте служат только священники Русской Церкви, грузины, армяне и католики окормляются обычными священнослужителями своих церквей. Ополченческие формирования, создаваемые на военное время в землях с грузинским, армянским и католическим населением, могут иметь собственных священнослужителей, содержащихся на счёт соответствующих церквей. Католические епархии в Царстве Русском объединены в экзархат, глава которого назначается римским папой по согласованию с Патриархом Московским и всея Руси и русским царём.
5.7. Иноверные религиозные организации. Допускать объединение магометан и буддистов в Царстве Русском прямо не запрещено, но магометанские духовные управления в Поволжье, на Кавказе и на Яике существуют порознь, каждое само по себе. Таким же образом по отдельности управляются буддисты в Сибири и в Калмыцкой степи.