В Ярославле, куда ополченцы вступили в начале апреля, был создан «Совет всея земли» — временное правительство из представителей духовенства и Боярской думы, выборных дворян и посадских людей. Во главе его встали Пожарский и Минин. Начали действовать также приказы. Численность ополчения к этому времени составила уже 10 тысяч человек: дворян, стрельцов, крестьян, посадских людей и прочих. Вошли в него и татарские отряды из Касимова и Темникова, Алатыря и Кадома.
В июле, получив сведения о походе к Москве гетмана Ходкевича с войском, Пожарский и Минин покинули Ярославль. Их первые отряды через Ростов, Переславль и Троицу подошли в конце месяца к северной окраине Москвы. Остановились у Тверских ворот.
Казаки и дворяне Заруцкого и Трубецкого тоже стояли под стенами столицы. Но ополченцы Пожарского и Минина предпочитали не объединяться с ними. К тому же Заруцкий вскоре ушел с несколькими тысячами своих людей к Коломне, а оттуда через Михайлов к Астрахани. Остались под Москьой отряды Трубецкого, всего до 5–6 тысяч человек.
В августе к Москве подошли основные силы второго ополчения. Пожарский разбил свой лагерь у Яузы и окружил укреплениями (острожками) Кремль, в котором засели польско-литовские интервенты.
22 августа войско Ходкевича переправилось у Новодевичьего монастыря через Москву-реку и подошло к Чертольским воротам, к западу от Боровицких ворот Кремля. Здесь гетман сделал попытку прорваться на помощь осажденным в цитадели полякам. Но конные сотни ополченцев, поддержанные казацкими отрядами Трубецкого, отбросили врага с большими для него потерями. На следующий день то же повторилось в районе Донского монастыря, причем в исходе сражения заметную роль сыграли действия отряда во главе с Кузьмой Мининым и тех же казаков. Снова Ходкевич потерпел немалый урон в людях и потерял 400 возов с провиантом.
Поняв безнадежность своих попыток, гетман ушел от Москвы, бросив на произвол судьбы своих земляков, запертых в Кремле, как птица в клетке. Через два месяца, 22 октября, ополченцы с боем взяли Китай-город. А через четыре дня интервенты капитулировали.
Москва, сердце всей России, была освобождена усилиями народа, который, как нередко бывало в истории Отечества, проявил в эти трудные времена мужество, терпение и выдержку, спас государство от распада, национальной катастрофы, от иноземного ига. Подвиг ополченцев Минина и Пожарского встал в один ряд с героизмом ратников Александра Невского и Дмитрия Донского.
В январе 1613 года собрались на Земский собор члены освященного собора (высшее духовенство) и Боярской думы, выборные представители дворян, посадских людей и черносошных крестьян. После долгих обсуждений они избрали нового царя: 16-летнего Михаила Романова, сына тушинского патриарха Филарета, в миру — боярина Федора Никитича Романова, который в это время был в польском плену.
Избрание царем представителя русской боярской фамилии, находившейся в родстве, правда, по женской линии, с Иваном Грозным и Федором Ивановичем, имело в ту пору большое национальное значение. Народ России, его представители на соборе отвергли кандидатуры чужеземцев. А это означало сохранение, ограждение государственного суверенитета, национальной самостоятельности и самобытности.
Важной задачей было окончательное изгнание интервентов, польско-литовских и шведских, из Русской земли, общее замирение и успокоение от бедствий Смутной поры, И в этом плане все народы земли Русской были заинтересованы в национальном освобождении и возведении на «превысочайший престол» русского царя, а не чужеземного королевича. Выразительно показал это подвиг Ивана Сусанина, костромского крестьянина, который, спасая Михаила Романова (он находился в это время в костромском Ипатьевском монастыре), завел в дебри и погубил отряд польских интервентов, но и сам погиб под их саблями.